More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1535 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1535  CapK protein, putative  100 
 
 
461 aa  937    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0449  putative capK protein  33.77 
 
 
446 aa  231  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3795  CapK protein, putative  30.3 
 
 
475 aa  209  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.217638  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  30.13 
 
 
458 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2310  coenzyme F390 synthetase-like protein  31.49 
 
 
475 aa  194  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2316  coenzyme F390 synthetase-like protein  30.05 
 
 
450 aa  189  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0387  Coenzyme F390 synthetase-like protein  31.3 
 
 
466 aa  189  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.602394  normal  0.432377 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  30.05 
 
 
464 aa  189  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  29.34 
 
 
480 aa  169  8e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  33.25 
 
 
448 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1971  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  29.84 
 
 
453 aa  163  6e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  28.36 
 
 
469 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0614  CapK related-protein  32.11 
 
 
445 aa  163  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.973847  normal  0.145617 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1793  putative CapK protein  30.99 
 
 
441 aa  160  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  32.45 
 
 
450 aa  157  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13008  possible CapK protein  24.09 
 
 
463 aa  156  6e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0922559  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  28.44 
 
 
426 aa  154  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0676  putative CapK protein  28.26 
 
 
459 aa  153  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0499803  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  29.79 
 
 
457 aa  153  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1950  capK related-protein  29.84 
 
 
446 aa  150  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3332  coenzyme F390 synthetase-like  29.78 
 
 
416 aa  145  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.422547  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02970  possible capK protein  29.45 
 
 
435 aa  144  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240993  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  25.48 
 
 
446 aa  144  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  27.18 
 
 
451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  30.73 
 
 
437 aa  141  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0291  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  29.67 
 
 
453 aa  140  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.326701  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.48 
 
 
454 aa  139  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1040  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.54 
 
 
436 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  27.64 
 
 
453 aa  137  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3567  CapK related-protein  27.78 
 
 
502 aa  137  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  27.54 
 
 
439 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2526  Coenzyme F390 synthetase-like protein  23.65 
 
 
437 aa  133  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142234 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0582  hypothetical protein  31.34 
 
 
479 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.661178  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00696  hypothetical protein  24.3 
 
 
417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0295  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  29.83 
 
 
461 aa  123  8e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619099  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0441  capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.93 
 
 
468 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356155  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1200  hypothetical protein  26.9 
 
 
448 aa  120  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0277555  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1943  hypothetical protein  25.89 
 
 
460 aa  120  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2299  hypothetical protein  30.8 
 
 
448 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0875  Coenzyme F390 synthetase-like protein  25.96 
 
 
563 aa  110  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1800  putative polysaccharide biosynthesis protein  25.42 
 
 
448 aa  108  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2429  capK domain protein  25.81 
 
 
476 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00799946  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  29.36 
 
 
438 aa  103  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  26.76 
 
 
430 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  27.49 
 
 
434 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1800  coenzyme F390 synthetase-like  27.43 
 
 
450 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0238175  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  25.18 
 
 
414 aa  100  8e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2647  coenzyme F390 synthetase-like  25.42 
 
 
467 aa  99.8  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0169  phenylacetate--CoA ligase  26.15 
 
 
433 aa  99.4  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  25.65 
 
 
414 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  26.16 
 
 
427 aa  98.6  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1615  Coenzyme F390 synthetase-like protein  27.75 
 
 
461 aa  98.6  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  24.59 
 
 
414 aa  97.8  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  27.14 
 
 
443 aa  97.4  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  26.5 
 
 
432 aa  97.8  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0460  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  33.86 
 
 
421 aa  97.4  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2287  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  29.62 
 
 
418 aa  97.1  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.534483  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  27.07 
 
 
433 aa  96.7  7e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  27.83 
 
 
427 aa  96.7  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3347  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  33.9 
 
 
421 aa  95.5  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  26.4 
 
 
447 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5012  putative phenylacetate-CoA ligase  28.8 
 
 
416 aa  94.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  28.53 
 
 
431 aa  94  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  25.5 
 
 
433 aa  92.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  27.11 
 
 
432 aa  92  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0016  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.81 
 
 
480 aa  92.4  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110032  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2007  CapK related-protein  23.25 
 
 
487 aa  91.7  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0540  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  31.22 
 
 
421 aa  91.3  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000138329  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  25.84 
 
 
445 aa  90.5  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1613  Phenylacetate--CoA ligase  25.07 
 
 
445 aa  89.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297864  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0226  coenzyme F390 synthetase  28.3 
 
 
454 aa  89.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2310  Phenylacetate--CoA ligase  27.78 
 
 
425 aa  89.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2446  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  31.75 
 
 
421 aa  89.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  24.01 
 
 
432 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  28.44 
 
 
432 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0136  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  31.22 
 
 
421 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0413194 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3276  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.7 
 
 
417 aa  89  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4201  coenzyme F390 synthetase-like  24.94 
 
 
457 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282456  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.88 
 
 
436 aa  88.2  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  25.71 
 
 
428 aa  87.8  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  23.89 
 
 
433 aa  87.4  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3212  coenzyme F390 synthetase-like protein  33.12 
 
 
460 aa  87.8  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  26.57 
 
 
434 aa  87.8  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  27.99 
 
 
432 aa  87.4  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  26.24 
 
 
441 aa  87.4  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  35.38 
 
 
433 aa  87  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  27.98 
 
 
458 aa  87  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  24.2 
 
 
433 aa  87  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1315  hypothetical protein  25.98 
 
 
442 aa  86.7  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  hitchhiker  0.000203578 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  27.75 
 
 
442 aa  86.7  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  26 
 
 
435 aa  86.7  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0319  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  30.53 
 
 
421 aa  86.7  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000219032  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4305  CapK domain-containing protein  27.42 
 
 
481 aa  86.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  24.2 
 
 
433 aa  86.7  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3545  coenzyme F390 synthetase-like  25.89 
 
 
524 aa  86.7  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  25.86 
 
 
432 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2239  coenzyme F390 synthetase-like  29.1 
 
 
466 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  24.67 
 
 
415 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1592  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  29.38 
 
 
397 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2997  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.98 
 
 
468 aa  84.7  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>