More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0319 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0136  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  91.21 
 
 		 421 aa  811    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0413194 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2446  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  90.5 
 
 		 421 aa  806    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0540  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  89.55 
 
 		 421 aa  795    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000138329  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0319  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  100 
 
 		 421 aa  870    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000219032  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0460  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  83.37 
 
 		 421 aa  750    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3347  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  83.37 
 
 		 421 aa  754    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2287  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  49.52 
 
 		 418 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.534483  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1592  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  44.3 
 
 		 397 aa  333  3e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_811  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  38.81 
 
 		 429 aa  298  1e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0824  phenylacetate--CoA ligase  38.33 
 
 		 429 aa  294  2e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1866  coenzyme F390 synthetase  41.8 
 
 		 440 aa  278  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.20834  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0940  AMP-binding enzyme  37.86 
 
 		 429 aa  276  3e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0540  coenzyme F390 synthetase-like protein  36.71 
 
 		 406 aa  276  6e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2429  coenzyme F390 synthetase-like protein  38.29 
 
 		 406 aa  276  7e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.756333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0294  putative phenylacetate-CoA ligase  37.29 
 
 		 410 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190212  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3411  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  37.02 
 
 		 416 aa  271  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.79511  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1837  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  35.8 
 
 		 425 aa  271  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0779546  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2311  putative phenylacetate-CoA ligase  37.56 
 
 		 410 aa  269  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00962069 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3131  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  37.29 
 
 		 409 aa  268  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.244322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0628  coenzyme F390 synthetase-like protein  35.44 
 
 		 407 aa  267  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2605  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  38.46 
 
 		 408 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5012  putative phenylacetate-CoA ligase  37.41 
 
 		 416 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3536  putative phenylacetate-CoA ligase  36.28 
 
 		 418 aa  264  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.756955  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0255  putative phenylacetate-CoA ligase  39.37 
 
 		 409 aa  263  6e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2719  putative phenylacetate-CoA ligase  39.4 
 
 		 413 aa  260  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.384073 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0781  putative phenylacetate-CoA ligase  40.77 
 
 		 425 aa  259  8e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0455  putative phenylacetate-CoA ligase  35.82 
 
 		 415 aa  256  4e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.647769  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1153  putative phenylacetate-CoA ligase  36.06 
 
 		 415 aa  256  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0464  putative phenylacetate-CoA ligase  35.82 
 
 		 415 aa  256  5e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.260095 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3613  putative phenylacetate-CoA ligase  38.3 
 
 		 416 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.572476 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3441  putative phenylacetate-CoA ligase  38.64 
 
 		 420 aa  255  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5720  putative phenylacetate-CoA ligase  35.37 
 
 		 407 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.776613  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0054  phenylacetate-CoA ligase, putative  36.71 
 
 		 405 aa  250  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3504  putative phenylacetate-CoA ligase  39.23 
 
 		 413 aa  250  4e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5040  putative phenylacetate-CoA ligase  35.85 
 
 		 416 aa  249  8e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0266  putative phenylacetate-CoA ligase  40.22 
 
 		 416 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0598  putative phenylacetate-CoA ligase  34.28 
 
 		 422 aa  248  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0220  putative phenylacetate-CoA ligase  35.73 
 
 		 420 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0121  phenylacetate-CoA ligase, putative  36.12 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4001  phenylacetate-CoA ligase, putative  36.81 
 
 		 400 aa  237  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0563  putative phenylacetate-CoA ligase  37.67 
 
 		 418 aa  237  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0311753 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3359  phenylacetate--CoA ligase  39.78 
 
 		 411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2223  coenzyme F390 synthetase-like protein  34.72 
 
 		 404 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.230555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2273  putative anaerobic phenylacetate CoA ligase  36.19 
 
 		 410 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0948  putative anaerobic phenylacetate CoA ligase  35.92 
 
 		 404 aa  229  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0382  phenylacetate-CoA ligase  34.8 
 
 		 406 aa  228  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000398  coenzyme F390 synthetase  34.19 
 
 		 400 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  31.73 
 
 		 433 aa  194  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  31.48 
 
 		 433 aa  194  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  31.18 
 
 		 433 aa  190  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  31.16 
 
 		 433 aa  186  7e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  31.92 
 
 		 434 aa  184  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  30.4 
 
 		 433 aa  184  3e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  29.29 
 
 		 433 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  29.06 
 
 		 433 aa  182  7e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  29.76 
 
 		 433 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  31.1 
 
 		 438 aa  179  7e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  31.22 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  31.28 
 
 		 434 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  30.5 
 
 		 436 aa  173  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  29.52 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  28.92 
 
 		 435 aa  169  7e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  31.37 
 
 		 441 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  29.62 
 
 		 437 aa  167  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  31.67 
 
 		 432 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  31.46 
 
 		 433 aa  166  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  29.43 
 
 		 434 aa  167  5e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  29.9 
 
 		 433 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  30.32 
 
 		 414 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  29.52 
 
 		 442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  29.83 
 
 		 414 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  32.88 
 
 		 441 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  32.88 
 
 		 441 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  30.03 
 
 		 428 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  30.34 
 
 		 447 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  29.48 
 
 		 435 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  29.95 
 
 		 431 aa  163  6e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  31 
 
 		 438 aa  162  7e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  29.98 
 
 		 433 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  30.54 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  29.15 
 
 		 434 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  29.81 
 
 		 436 aa  161  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  29.21 
 
 		 444 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  28.37 
 
 		 432 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  32.6 
 
 		 441 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  30.09 
 
 		 444 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  30.05 
 
 		 414 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  30.14 
 
 		 445 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  29.21 
 
 		 444 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  29.5 
 
 		 433 aa  160  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  30.44 
 
 		 458 aa  159  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  29.25 
 
 		 433 aa  159  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  30.27 
 
 		 439 aa  159  9e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  29.18 
 
 		 443 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  30.39 
 
 		 435 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  30.29 
 
 		 429 aa  158  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  31.09 
 
 		 427 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  30.77 
 
 		 435 aa  157  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  29.53 
 
 		 430 aa  158  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  29.53 
 
 		 446 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>