More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2446 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0136  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  93.82 
 
 		 421 aa  832    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0413194 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0319  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  90.5 
 
 		 421 aa  806    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000219032  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0460  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  85.75 
 
 		 421 aa  776    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0540  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  94.06 
 
 		 421 aa  833    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000138329  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2446  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  100 
 
 		 421 aa  868    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3347  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  86.46 
 
 		 421 aa  767    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2287  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  49.05 
 
 		 418 aa  412  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.534483  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1592  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  44.3 
 
 		 397 aa  340  2e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_811  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  38.24 
 
 		 429 aa  295  9e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0824  phenylacetate--CoA ligase  37.38 
 
 		 429 aa  291  1e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2429  coenzyme F390 synthetase-like protein  38.54 
 
 		 406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.756333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1866  coenzyme F390 synthetase  40.98 
 
 		 440 aa  280  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.20834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0540  coenzyme F390 synthetase-like protein  36.34 
 
 		 406 aa  279  6e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0940  AMP-binding enzyme  37.14 
 
 		 429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0628  coenzyme F390 synthetase-like protein  35.52 
 
 		 407 aa  273  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0294  putative phenylacetate-CoA ligase  37.29 
 
 		 410 aa  272  6e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190212  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0255  putative phenylacetate-CoA ligase  39.61 
 
 		 409 aa  272  7e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3411  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  36.78 
 
 		 416 aa  271  1e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.79511  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5012  putative phenylacetate-CoA ligase  38.37 
 
 		 416 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3536  putative phenylacetate-CoA ligase  37.59 
 
 		 418 aa  268  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.756955  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3131  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  36.56 
 
 		 409 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.244322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1837  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  34.84 
 
 		 425 aa  265  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0779546  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3441  putative phenylacetate-CoA ligase  38.85 
 
 		 420 aa  264  3e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5720  putative phenylacetate-CoA ligase  36.59 
 
 		 407 aa  263  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.776613  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1153  putative phenylacetate-CoA ligase  36.54 
 
 		 415 aa  263  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5040  putative phenylacetate-CoA ligase  37.32 
 
 		 416 aa  261  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0781  putative phenylacetate-CoA ligase  40.22 
 
 		 425 aa  261  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2311  putative phenylacetate-CoA ligase  36.32 
 
 		 410 aa  260  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00962069 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2605  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  37.02 
 
 		 408 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3613  putative phenylacetate-CoA ligase  38.56 
 
 		 416 aa  259  7e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.572476 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0455  putative phenylacetate-CoA ligase  38.92 
 
 		 415 aa  259  7e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.647769  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0464  putative phenylacetate-CoA ligase  38.92 
 
 		 415 aa  259  8e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.260095 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2719  putative phenylacetate-CoA ligase  38.52 
 
 		 413 aa  258  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.384073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3504  putative phenylacetate-CoA ligase  39.44 
 
 		 413 aa  256  5e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0598  putative phenylacetate-CoA ligase  34.75 
 
 		 422 aa  252  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0266  putative phenylacetate-CoA ligase  39.04 
 
 		 416 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0054  phenylacetate-CoA ligase, putative  38.21 
 
 		 405 aa  248  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0563  putative phenylacetate-CoA ligase  38.68 
 
 		 418 aa  247  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0311753 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0121  phenylacetate-CoA ligase, putative  37.2 
 
 		 405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4001  phenylacetate-CoA ligase, putative  34.77 
 
 		 400 aa  244  3e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0220  putative phenylacetate-CoA ligase  35.97 
 
 		 420 aa  243  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2223  coenzyme F390 synthetase-like protein  35.96 
 
 		 404 aa  243  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.230555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3359  phenylacetate--CoA ligase  39.2 
 
 		 411 aa  242  7.999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2273  putative anaerobic phenylacetate CoA ligase  37.03 
 
 		 410 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0948  putative anaerobic phenylacetate CoA ligase  36.76 
 
 		 404 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0382  phenylacetate-CoA ligase  34.8 
 
 		 406 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000398  coenzyme F390 synthetase  33 
 
 		 400 aa  228  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  33.02 
 
 		 433 aa  213  4.9999999999999996e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  32.21 
 
 		 433 aa  208  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  32.13 
 
 		 433 aa  205  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  31.19 
 
 		 433 aa  199  6e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  31.67 
 
 		 433 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  31.19 
 
 		 433 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  34.2 
 
 		 434 aa  196  7e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  30.71 
 
 		 433 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  30.61 
 
 		 433 aa  191  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  33.02 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  31.58 
 
 		 438 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  31.27 
 
 		 434 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  31.21 
 
 		 436 aa  184  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  31.84 
 
 		 433 aa  180  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  31.07 
 
 		 434 aa  180  4e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  32.12 
 
 		 434 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  30.12 
 
 		 435 aa  179  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  30.4 
 
 		 435 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  30.98 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  30.33 
 
 		 414 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  30.81 
 
 		 414 aa  177  4e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  32.12 
 
 		 441 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  31.79 
 
 		 433 aa  177  5e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  32.91 
 
 		 432 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  30.57 
 
 		 437 aa  176  5e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  32.12 
 
 		 441 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  32.12 
 
 		 441 aa  176  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  29.52 
 
 		 432 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  30.98 
 
 		 438 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  31.04 
 
 		 434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  31.12 
 
 		 431 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  30.24 
 
 		 433 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  31.05 
 
 		 414 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  29.76 
 
 		 433 aa  172  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  32.09 
 
 		 442 aa  171  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  32.23 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  32.04 
 
 		 435 aa  171  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  30.92 
 
 		 427 aa  169  7e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  30.12 
 
 		 432 aa  169  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  30 
 
 		 433 aa  169  9e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  32.12 
 
 		 430 aa  169  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  29.29 
 
 		 433 aa  168  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  28.85 
 
 		 432 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  30.89 
 
 		 415 aa  169  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  31.48 
 
 		 443 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  29.98 
 
 		 436 aa  167  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  31.97 
 
 		 429 aa  167  4e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  30.83 
 
 		 436 aa  167  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  30.75 
 
 		 439 aa  167  4e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  31.09 
 
 		 441 aa  166  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  30.98 
 
 		 412 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  30.23 
 
 		 413 aa  166  8e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  29.98 
 
 		 439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>