More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2287 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2287  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  100 
 
 
418 aa  851    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.534483  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2446  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  49.05 
 
 
421 aa  412  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0136  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  48.81 
 
 
421 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0413194 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0460  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  47.13 
 
 
421 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0540  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  47.37 
 
 
421 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000138329  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0319  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  49.52 
 
 
421 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000219032  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3347  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  46.65 
 
 
421 aa  397  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1592  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  46.81 
 
 
397 aa  301  1e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0540  coenzyme F390 synthetase-like protein  40.15 
 
 
406 aa  282  8.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2429  coenzyme F390 synthetase-like protein  41.96 
 
 
406 aa  280  5e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.756333  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0628  coenzyme F390 synthetase-like protein  40.81 
 
 
407 aa  276  5e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0781  putative phenylacetate-CoA ligase  41.67 
 
 
425 aa  267  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0824  phenylacetate--CoA ligase  36.92 
 
 
429 aa  265  1e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1866  coenzyme F390 synthetase  42.9 
 
 
440 aa  265  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.20834  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_811  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  37.73 
 
 
429 aa  264  3e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3441  putative phenylacetate-CoA ligase  39.43 
 
 
420 aa  263  4.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362161 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3536  putative phenylacetate-CoA ligase  38.88 
 
 
418 aa  263  6e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.756955  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0294  putative phenylacetate-CoA ligase  38.89 
 
 
410 aa  259  7e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190212  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5012  putative phenylacetate-CoA ligase  40.37 
 
 
416 aa  256  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0054  phenylacetate-CoA ligase, putative  37.68 
 
 
405 aa  253  5.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3613  putative phenylacetate-CoA ligase  38.77 
 
 
416 aa  252  8.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.572476 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0255  putative phenylacetate-CoA ligase  39.33 
 
 
409 aa  252  9.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2311  putative phenylacetate-CoA ligase  38.69 
 
 
410 aa  252  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00962069 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0266  putative phenylacetate-CoA ligase  38.81 
 
 
416 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3411  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  35.51 
 
 
416 aa  249  9e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.79511  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0563  putative phenylacetate-CoA ligase  38.55 
 
 
418 aa  249  9e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0311753 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3504  putative phenylacetate-CoA ligase  38.46 
 
 
413 aa  248  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0464  putative phenylacetate-CoA ligase  38.28 
 
 
415 aa  248  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.260095 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4001  phenylacetate-CoA ligase, putative  36.36 
 
 
400 aa  247  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0121  phenylacetate-CoA ligase, putative  37.05 
 
 
405 aa  248  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0455  putative phenylacetate-CoA ligase  38.04 
 
 
415 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.647769  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0940  AMP-binding enzyme  37.21 
 
 
429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2605  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  38.68 
 
 
408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1153  putative phenylacetate-CoA ligase  37.8 
 
 
415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5040  putative phenylacetate-CoA ligase  39.25 
 
 
416 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5720  putative phenylacetate-CoA ligase  38.38 
 
 
407 aa  242  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.776613  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1837  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  36.43 
 
 
425 aa  238  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0779546  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3131  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  39.22 
 
 
409 aa  236  6e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.244322  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2719  putative phenylacetate-CoA ligase  39.95 
 
 
413 aa  236  8e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.384073 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0598  putative phenylacetate-CoA ligase  37.1 
 
 
422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0948  putative anaerobic phenylacetate CoA ligase  35.92 
 
 
404 aa  232  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2273  putative anaerobic phenylacetate CoA ligase  35.25 
 
 
410 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0382  phenylacetate-CoA ligase  37.14 
 
 
406 aa  231  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3359  phenylacetate--CoA ligase  41.55 
 
 
411 aa  230  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2223  coenzyme F390 synthetase-like protein  34.55 
 
 
404 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.230555  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0220  putative phenylacetate-CoA ligase  35.48 
 
 
420 aa  223  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  33.06 
 
 
433 aa  203  6e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  32.43 
 
 
432 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  32.5 
 
 
433 aa  195  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000398  coenzyme F390 synthetase  32.97 
 
 
400 aa  195  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  33.52 
 
 
433 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  32.6 
 
 
433 aa  195  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  32.96 
 
 
433 aa  195  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  32.69 
 
 
433 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  32.13 
 
 
433 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  32.26 
 
 
414 aa  186  5e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  34.11 
 
 
438 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  31.39 
 
 
414 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  32.03 
 
 
415 aa  181  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  29.24 
 
 
433 aa  181  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  30.89 
 
 
434 aa  179  9e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  30.79 
 
 
414 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  31.06 
 
 
433 aa  177  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  34.01 
 
 
432 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  31.72 
 
 
433 aa  176  7e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  31.72 
 
 
433 aa  176  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  31.6 
 
 
436 aa  176  8e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  29.47 
 
 
437 aa  176  9e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  30.81 
 
 
434 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  32.42 
 
 
434 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  31.35 
 
 
431 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  30.83 
 
 
434 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  33.79 
 
 
432 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  31.31 
 
 
435 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  32.03 
 
 
427 aa  173  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  30.16 
 
 
413 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  30.52 
 
 
428 aa  172  7.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  30.73 
 
 
435 aa  171  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  33.24 
 
 
434 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  30.82 
 
 
435 aa  169  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  31.04 
 
 
433 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  31.86 
 
 
432 aa  168  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  30.63 
 
 
435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  33.44 
 
 
430 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  32.75 
 
 
432 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  30.16 
 
 
443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  32.11 
 
 
433 aa  164  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  28.42 
 
 
438 aa  164  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  27.78 
 
 
433 aa  164  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  29.41 
 
 
432 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  31 
 
 
433 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  28.87 
 
 
436 aa  163  5.0000000000000005e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  30.73 
 
 
427 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  30.79 
 
 
433 aa  163  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  30.85 
 
 
436 aa  162  8.000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  33.03 
 
 
428 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  31.11 
 
 
412 aa  162  8.000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  30.24 
 
 
437 aa  162  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  30.4 
 
 
433 aa  161  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  31.59 
 
 
430 aa  161  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>