More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0540 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0540  coenzyme F390 synthetase-like protein  100 
 
 		 406 aa  825    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0628  coenzyme F390 synthetase-like protein  86.7 
 
 		 407 aa  737    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2429  coenzyme F390 synthetase-like protein  83.74 
 
 		 406 aa  697    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.756333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1592  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  46.02 
 
 		 397 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0460  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  36.84 
 
 		 421 aa  285  7e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2287  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  40.15 
 
 		 418 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.534483  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0540  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  36.59 
 
 		 421 aa  281  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000138329  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3347  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  36.75 
 
 		 421 aa  280  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2446  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  36.34 
 
 		 421 aa  279  6e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0319  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  36.71 
 
 		 421 aa  276  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000219032  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0136  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  36.34 
 
 		 421 aa  275  8e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0413194 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_811  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  38.42 
 
 		 429 aa  272  7e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1837  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  41.24 
 
 		 425 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0779546  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3441  putative phenylacetate-CoA ligase  41.36 
 
 		 420 aa  265  8.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362161 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0824  phenylacetate--CoA ligase  37.44 
 
 		 429 aa  264  2e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0266  putative phenylacetate-CoA ligase  40.15 
 
 		 416 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2273  putative anaerobic phenylacetate CoA ligase  41.78 
 
 		 410 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5040  putative phenylacetate-CoA ligase  41.26 
 
 		 416 aa  263  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2223  coenzyme F390 synthetase-like protein  40.99 
 
 		 404 aa  262  6e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.230555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0948  putative anaerobic phenylacetate CoA ligase  41.82 
 
 		 404 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5012  putative phenylacetate-CoA ligase  39.71 
 
 		 416 aa  260  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3613  putative phenylacetate-CoA ligase  40.25 
 
 		 416 aa  260  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.572476 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3536  putative phenylacetate-CoA ligase  39.39 
 
 		 418 aa  258  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.756955  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1866  coenzyme F390 synthetase  42.12 
 
 		 440 aa  256  7e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.20834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1153  putative phenylacetate-CoA ligase  37.44 
 
 		 415 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0940  AMP-binding enzyme  37.19 
 
 		 429 aa  251  2e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0121  phenylacetate-CoA ligase, putative  37.5 
 
 		 405 aa  250  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0464  putative phenylacetate-CoA ligase  38.58 
 
 		 415 aa  250  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.260095 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0054  phenylacetate-CoA ligase, putative  38.44 
 
 		 405 aa  249  5e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0455  putative phenylacetate-CoA ligase  38.58 
 
 		 415 aa  249  5e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.647769  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3504  putative phenylacetate-CoA ligase  38.04 
 
 		 413 aa  249  6e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3411  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  39.83 
 
 		 416 aa  249  7e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.79511  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0781  putative phenylacetate-CoA ligase  40.21 
 
 		 425 aa  249  7e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2605  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  45.45 
 
 		 408 aa  249  8e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4001  phenylacetate-CoA ligase, putative  40.33 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2719  putative phenylacetate-CoA ligase  40.05 
 
 		 413 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.384073 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0598  putative phenylacetate-CoA ligase  37.28 
 
 		 422 aa  246  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0382  phenylacetate-CoA ligase  39.73 
 
 		 406 aa  242  9e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0220  putative phenylacetate-CoA ligase  39.41 
 
 		 420 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0255  putative phenylacetate-CoA ligase  39.39 
 
 		 409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0563  putative phenylacetate-CoA ligase  38.67 
 
 		 418 aa  234  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0311753 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2311  putative phenylacetate-CoA ligase  36.75 
 
 		 410 aa  234  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00962069 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000398  coenzyme F390 synthetase  40.27 
 
 		 400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0294  putative phenylacetate-CoA ligase  36.39 
 
 		 410 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190212  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3359  phenylacetate--CoA ligase  42.47 
 
 		 411 aa  229  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5720  putative phenylacetate-CoA ligase  36.39 
 
 		 407 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.776613  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3131  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  36.94 
 
 		 409 aa  222  8e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.244322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  32.53 
 
 		 438 aa  192  7e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  31.96 
 
 		 433 aa  178  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  31.41 
 
 		 434 aa  176  9e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  32.09 
 
 		 439 aa  175  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  31.81 
 
 		 439 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  30.75 
 
 		 433 aa  172  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  32.69 
 
 		 433 aa  170  4e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  31.52 
 
 		 439 aa  170  4e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  30.84 
 
 		 434 aa  170  5e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  28.92 
 
 		 433 aa  169  6e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  30.36 
 
 		 431 aa  168  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  30.94 
 
 		 432 aa  168  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  29.5 
 
 		 435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  30.38 
 
 		 430 aa  162  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  31.83 
 
 		 429 aa  162  7e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  30.6 
 
 		 436 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  30.77 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  31.4 
 
 		 446 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  32.14 
 
 		 428 aa  160  4e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  30.1 
 
 		 427 aa  159  6e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  31.03 
 
 		 448 aa  159  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  30.81 
 
 		 434 aa  159  9e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  30.92 
 
 		 423 aa  159  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  30.21 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  29.81 
 
 		 432 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  29.47 
 
 		 433 aa  158  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  31.01 
 
 		 429 aa  159  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  28.54 
 
 		 434 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  29.95 
 
 		 433 aa  157  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  31.75 
 
 		 434 aa  155  8e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  31.41 
 
 		 439 aa  156  8e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  29.7 
 
 		 446 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  31.02 
 
 		 430 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26570  phenylacetate-CoA ligase  30.96 
 
 		 448 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.123505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5526  phenylacetate-CoA ligase  31.33 
 
 		 449 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0759485  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  28.75 
 
 		 434 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  29.82 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0986  phenylacetate-CoA ligase  30.13 
 
 		 435 aa  153  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  29.71 
 
 		 436 aa  153  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  28.46 
 
 		 432 aa  153  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  28.21 
 
 		 433 aa  153  7e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1585  Phenylacetate--CoA ligase  29.16 
 
 		 457 aa  152  8.999999999999999e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0730683 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  29.34 
 
 		 434 aa  152  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  29.9 
 
 		 445 aa  152  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  27.82 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  29.66 
 
 		 433 aa  151  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  29.95 
 
 		 435 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  29.82 
 
 		 444 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  31.61 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  30.9 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  28.46 
 
 		 435 aa  151  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0054  Phenylacetate--CoA ligase  31.4 
 
 		 441 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0038  phenylacetate-CoA ligase  31.16 
 
 		 441 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.455543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>