More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0628 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0628  coenzyme F390 synthetase-like protein  100 
 
 
407 aa  825    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2429  coenzyme F390 synthetase-like protein  82.27 
 
 
406 aa  687    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.756333  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0540  coenzyme F390 synthetase-like protein  86.7 
 
 
406 aa  737    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1592  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  40.66 
 
 
397 aa  293  3e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0460  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  36.52 
 
 
421 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2287  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  40.81 
 
 
418 aa  276  5e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.534483  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0540  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  36.02 
 
 
421 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000138329  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3347  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  35.5 
 
 
421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2446  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  35.52 
 
 
421 aa  273  3e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3441  putative phenylacetate-CoA ligase  41.35 
 
 
420 aa  270  4e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362161 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0136  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  35.77 
 
 
421 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0413194 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2273  putative anaerobic phenylacetate CoA ligase  42.56 
 
 
410 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_811  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  37.93 
 
 
429 aa  268  1e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0319  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  35.44 
 
 
421 aa  267  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000219032  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0948  putative anaerobic phenylacetate CoA ligase  42.63 
 
 
404 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0266  putative phenylacetate-CoA ligase  41.48 
 
 
416 aa  266  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2223  coenzyme F390 synthetase-like protein  41.78 
 
 
404 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.230555  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3613  putative phenylacetate-CoA ligase  41.16 
 
 
416 aa  263  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.572476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5012  putative phenylacetate-CoA ligase  41.52 
 
 
416 aa  263  4.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5040  putative phenylacetate-CoA ligase  40.73 
 
 
416 aa  261  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1837  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  39.68 
 
 
425 aa  260  3e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0779546  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0824  phenylacetate--CoA ligase  36.7 
 
 
429 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0781  putative phenylacetate-CoA ligase  41.62 
 
 
425 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3536  putative phenylacetate-CoA ligase  39.8 
 
 
418 aa  258  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.756955  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1153  putative phenylacetate-CoA ligase  39.9 
 
 
415 aa  256  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3504  putative phenylacetate-CoA ligase  38.79 
 
 
413 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0121  phenylacetate-CoA ligase, putative  39.22 
 
 
405 aa  253  6e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0464  putative phenylacetate-CoA ligase  39.24 
 
 
415 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.260095 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0455  putative phenylacetate-CoA ligase  39.24 
 
 
415 aa  250  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.647769  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0054  phenylacetate-CoA ligase, putative  39.25 
 
 
405 aa  249  5e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1866  coenzyme F390 synthetase  41.18 
 
 
440 aa  248  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.20834  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0382  phenylacetate-CoA ligase  39.58 
 
 
406 aa  246  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0598  putative phenylacetate-CoA ligase  37.56 
 
 
422 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4001  phenylacetate-CoA ligase, putative  40.33 
 
 
400 aa  246  4.9999999999999997e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0940  AMP-binding enzyme  36.45 
 
 
429 aa  246  6.999999999999999e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2605  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  43.83 
 
 
408 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3411  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  38.27 
 
 
416 aa  240  4e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.79511  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0220  putative phenylacetate-CoA ligase  38.18 
 
 
420 aa  239  8e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2719  putative phenylacetate-CoA ligase  39.25 
 
 
413 aa  235  9e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.384073 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0563  putative phenylacetate-CoA ligase  38.8 
 
 
418 aa  232  9e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0311753 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0255  putative phenylacetate-CoA ligase  38.4 
 
 
409 aa  232  9e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3359  phenylacetate--CoA ligase  43.67 
 
 
411 aa  229  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2311  putative phenylacetate-CoA ligase  36.65 
 
 
410 aa  229  6e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00962069 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000398  coenzyme F390 synthetase  36.99 
 
 
400 aa  225  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0294  putative phenylacetate-CoA ligase  36.59 
 
 
410 aa  225  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190212  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3131  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  37.53 
 
 
409 aa  224  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.244322  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5720  putative phenylacetate-CoA ligase  36.12 
 
 
407 aa  220  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.776613  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  31.99 
 
 
438 aa  176  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  30.41 
 
 
434 aa  169  9e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  30.29 
 
 
434 aa  168  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  31.23 
 
 
433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  28.74 
 
 
433 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  33.09 
 
 
433 aa  162  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  30.75 
 
 
439 aa  160  3e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  30.17 
 
 
439 aa  158  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  31.02 
 
 
423 aa  158  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  31.75 
 
 
429 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  31.83 
 
 
429 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  31.28 
 
 
433 aa  155  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  30.17 
 
 
439 aa  155  9e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  28.81 
 
 
433 aa  154  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  30.53 
 
 
430 aa  154  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  30.47 
 
 
434 aa  154  4e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  30.67 
 
 
448 aa  153  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  29.29 
 
 
432 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  28.47 
 
 
427 aa  152  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  29.3 
 
 
434 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  30.87 
 
 
428 aa  151  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  29.95 
 
 
433 aa  151  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  29.95 
 
 
433 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  30.54 
 
 
436 aa  151  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  30.09 
 
 
428 aa  151  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  30.2 
 
 
430 aa  149  6e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  29.23 
 
 
433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  28.72 
 
 
435 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  28.35 
 
 
431 aa  147  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  29.4 
 
 
432 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  28.42 
 
 
434 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  30.1 
 
 
430 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  28.39 
 
 
444 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26570  phenylacetate-CoA ligase  31.47 
 
 
448 aa  146  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.123505 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  28.97 
 
 
435 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  30.53 
 
 
439 aa  146  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  27.78 
 
 
435 aa  145  9e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  30 
 
 
436 aa  145  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  30.87 
 
 
434 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  29.25 
 
 
444 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  29.2 
 
 
433 aa  143  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1392  phenylacetate-CoA ligase  31.58 
 
 
441 aa  144  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.276204  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  29.71 
 
 
434 aa  144  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2486  phenylacetate-CoA ligase  30.67 
 
 
450 aa  143  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773414  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0986  phenylacetate-CoA ligase  29.64 
 
 
435 aa  143  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337709  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  29.27 
 
 
438 aa  143  6e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  28.99 
 
 
435 aa  143  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  27.89 
 
 
434 aa  143  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  28.21 
 
 
446 aa  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  29.68 
 
 
432 aa  143  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4320  phenylacetate--CoA ligase  29.55 
 
 
444 aa  142  8e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3944  phenylacetate-CoA ligase  29.25 
 
 
439 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  29.93 
 
 
432 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>