More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000398 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000398  coenzyme F390 synthetase  100 
 
 		 400 aa  835    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3131  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  46.83 
 
 		 409 aa  366  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.244322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1837  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  45.86 
 
 		 425 aa  363  4e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0779546  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2605  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  46.72 
 
 		 408 aa  360  3e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3411  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  44.69 
 
 		 416 aa  358  7e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.79511  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3504  putative phenylacetate-CoA ligase  46.31 
 
 		 413 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0781  putative phenylacetate-CoA ligase  44.55 
 
 		 425 aa  351  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1153  putative phenylacetate-CoA ligase  44.82 
 
 		 415 aa  350  3e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2311  putative phenylacetate-CoA ligase  46.82 
 
 		 410 aa  349  6e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00962069 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0266  putative phenylacetate-CoA ligase  45.34 
 
 		 416 aa  348  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0464  putative phenylacetate-CoA ligase  43.83 
 
 		 415 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.260095 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0455  putative phenylacetate-CoA ligase  43.58 
 
 		 415 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.647769  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0294  putative phenylacetate-CoA ligase  45.41 
 
 		 410 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190212  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0563  putative phenylacetate-CoA ligase  43.41 
 
 		 418 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0311753 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0255  putative phenylacetate-CoA ligase  45.99 
 
 		 409 aa  333  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3441  putative phenylacetate-CoA ligase  43.57 
 
 		 420 aa  330  3e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362161 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3613  putative phenylacetate-CoA ligase  44.53 
 
 		 416 aa  329  4e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.572476 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3359  phenylacetate--CoA ligase  46.55 
 
 		 411 aa  329  7e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5012  putative phenylacetate-CoA ligase  42.03 
 
 		 416 aa  328  8e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3536  putative phenylacetate-CoA ligase  42.11 
 
 		 418 aa  328  9e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.756955  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5720  putative phenylacetate-CoA ligase  44.9 
 
 		 407 aa  326  5e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.776613  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0220  putative phenylacetate-CoA ligase  42.65 
 
 		 420 aa  322  8e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1866  coenzyme F390 synthetase  43.37 
 
 		 440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.20834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0598  putative phenylacetate-CoA ligase  42.65 
 
 		 422 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2719  putative phenylacetate-CoA ligase  42.53 
 
 		 413 aa  311  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.384073 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0121  phenylacetate-CoA ligase, putative  43.38 
 
 		 405 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0054  phenylacetate-CoA ligase, putative  41.77 
 
 		 405 aa  303  4.0000000000000003e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5040  putative phenylacetate-CoA ligase  39.9 
 
 		 416 aa  291  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4001  phenylacetate-CoA ligase, putative  45.89 
 
 		 400 aa  290  4e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2223  coenzyme F390 synthetase-like protein  38.86 
 
 		 404 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.230555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0382  phenylacetate-CoA ligase  41.83 
 
 		 406 aa  282  7.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0948  putative anaerobic phenylacetate CoA ligase  38.56 
 
 		 404 aa  276  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2273  putative anaerobic phenylacetate CoA ligase  38.56 
 
 		 410 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1592  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  38.96 
 
 		 397 aa  263  4.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0460  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  35.11 
 
 		 421 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0540  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  35.29 
 
 		 421 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000138329  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3347  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  37.57 
 
 		 421 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0540  coenzyme F390 synthetase-like protein  40.27 
 
 		 406 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2429  coenzyme F390 synthetase-like protein  41.14 
 
 		 406 aa  231  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.756333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2446  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  33 
 
 		 421 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0136  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  32.51 
 
 		 421 aa  226  4e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0413194 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0628  coenzyme F390 synthetase-like protein  36.99 
 
 		 407 aa  225  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0319  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  34.19 
 
 		 421 aa  222  9e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000219032  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0824  phenylacetate--CoA ligase  35.31 
 
 		 429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_811  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  35.31 
 
 		 429 aa  219  7e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0940  AMP-binding enzyme  37.27 
 
 		 429 aa  202  8e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2287  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  32.97 
 
 		 418 aa  195  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.534483  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  32.07 
 
 		 428 aa  144  4e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  30.42 
 
 		 433 aa  139  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  30.16 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  31.22 
 
 		 436 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  28.5 
 
 		 432 aa  137  4e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  30.03 
 
 		 442 aa  135  9e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  29.49 
 
 		 432 aa  135  9e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  30.86 
 
 		 432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1829  phenylacetate-CoA ligase  30.85 
 
 		 444 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.914606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1236  phenylacetate-CoA ligase  30.83 
 
 		 436 aa  130  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  29.81 
 
 		 430 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  29.33 
 
 		 434 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  29.77 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  32.78 
 
 		 439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  29 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  31.28 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  31.05 
 
 		 433 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3944  phenylacetate-CoA ligase  30.07 
 
 		 439 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2870  phenylacetate-CoA ligase  30.83 
 
 		 442 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  29.84 
 
 		 435 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3634  phenylacetate-CoA ligase  30.07 
 
 		 444 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  32.96 
 
 		 448 aa  126  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  29.13 
 
 		 433 aa  126  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2189  phenylacetate-CoA ligase  31.91 
 
 		 434 aa  126  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0357047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  29.8 
 
 		 434 aa  125  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  29.06 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  28.16 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1908  phenylacetate-CoA ligase  31.53 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  31.3 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  29.06 
 
 		 435 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  30.09 
 
 		 428 aa  124  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  29.95 
 
 		 438 aa  124  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1923  phenylacetate-CoA ligase  30.1 
 
 		 443 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0702505  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  28.87 
 
 		 434 aa  124  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  26.16 
 
 		 433 aa  123  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  26.68 
 
 		 434 aa  123  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  31.65 
 
 		 434 aa  123  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2403  phenylacetate-CoA ligase  32.5 
 
 		 436 aa  123  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.670369 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  30.75 
 
 		 434 aa  123  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4422  phenylacetate-CoA ligase  32.54 
 
 		 440 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  30.77 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2904  phenylacetate-CoA ligase  31.9 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  31.65 
 
 		 439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  30.51 
 
 		 436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  29.93 
 
 		 431 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  30.34 
 
 		 435 aa  120  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  27.78 
 
 		 437 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  30.48 
 
 		 434 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3959  phenylacetate-CoA ligase  32.28 
 
 		 440 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349382  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1318  phenylacetate-CoA ligase  32.6 
 
 		 440 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5775  phenylacetate-CoA ligase  32.6 
 
 		 440 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4529  phenylacetate-CoA ligase  32.6 
 
 		 440 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652745  normal  0.906833 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4126  phenylacetate-CoA ligase  32.32 
 
 		 440 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351473  normal  0.162313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>