More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0226 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0226  coenzyme F390 synthetase  100 
 
 		 454 aa  910    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1004  coenzyme F390 synthetase-like protein  50.79 
 
 		 442 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1546  coenzyme F390 synthetase-like protein  48.17 
 
 		 443 aa  368  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3434  coenzyme F390 synthetase-like protein  42.52 
 
 		 467 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1615  Coenzyme F390 synthetase-like protein  49.62 
 
 		 461 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1800  coenzyme F390 synthetase-like  44.57 
 
 		 450 aa  350  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0238175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3140  hypothetical protein  44.72 
 
 		 447 aa  334  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1315  hypothetical protein  42.69 
 
 		 442 aa  319  6e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  hitchhiker  0.000203578 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2614  coenzyme F390 synthetase-like protein  52.92 
 
 		 377 aa  316  6e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1469  hypothetical protein  44.57 
 
 		 431 aa  305  9.000000000000001e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1814  coenzyme F390 synthetase-like protein  38.79 
 
 		 457 aa  263  3e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1556  coenzyme F390 synthetase-like protein  41.86 
 
 		 435 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.30077  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3276  coenzyme F390 synthetase-like protein  33.43 
 
 		 417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3545  coenzyme F390 synthetase-like  39.79 
 
 		 524 aa  226  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0636  coenzyme F390 synthetase-like protein  39.76 
 
 		 406 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.201614 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1580  AMP-binding protein  40.11 
 
 		 449 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  32.55 
 
 		 427 aa  147  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  36.83 
 
 		 436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  32.2 
 
 		 438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1817  coenzyme F390 synthetase  45.57 
 
 		 465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342453  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2408  Phenylacetate--CoA ligase  29.93 
 
 		 429 aa  125  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0464701 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4074  phenylacetate-CoA ligase  31.01 
 
 		 437 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  29.67 
 
 		 413 aa  123  8e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  31.98 
 
 		 430 aa  123  8e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  26.85 
 
 		 435 aa  122  9e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  27.02 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  30.27 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  30.08 
 
 		 694 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  32.3 
 
 		 431 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  30.36 
 
 		 414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  27.2 
 
 		 432 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2051  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  32.65 
 
 		 433 aa  119  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.433372  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  29.69 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  27.02 
 
 		 432 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  30.65 
 
 		 435 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  30.47 
 
 		 432 aa  117  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  29.13 
 
 		 434 aa  117  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  29.76 
 
 		 414 aa  117  6e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  30.33 
 
 		 444 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  27.42 
 
 		 432 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2883  phenylacetate-CoA ligase  29.7 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  29.67 
 
 		 436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3457  phenylacetate-CoA ligase  34.78 
 
 		 433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1613  Phenylacetate--CoA ligase  26.81 
 
 		 445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297864  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  29.13 
 
 		 438 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5790  phenylacetate--CoA ligase  29.88 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  28.76 
 
 		 442 aa  111  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  29.47 
 
 		 412 aa  110  6e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  29.79 
 
 		 428 aa  110  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  31.65 
 
 		 430 aa  110  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  28.7 
 
 		 432 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5526  phenylacetate-CoA ligase  31.23 
 
 		 449 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0759485  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  28.53 
 
 		 436 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  30.7 
 
 		 437 aa  109  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  28.5 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2897  Phenylacetate--CoA ligase  28.5 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  26.71 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  33.23 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  26.75 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  27.85 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  29.66 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  30.14 
 
 		 434 aa  108  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  27.76 
 
 		 433 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  29.17 
 
 		 432 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  28.24 
 
 		 433 aa  107  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  29.68 
 
 		 433 aa  107  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  29.84 
 
 		 432 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  26.9 
 
 		 445 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  33.23 
 
 		 435 aa  107  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08400  coenzyme F390 synthetase  25.38 
 
 		 447 aa  107  5e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0324519  normal  0.311069 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2904  phenylacetate-CoA ligase  29.28 
 
 		 432 aa  107  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  29.39 
 
 		 434 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2010  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.27 
 
 		 455 aa  107  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.484811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26570  phenylacetate-CoA ligase  30.31 
 
 		 448 aa  107  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.123505 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  32.58 
 
 		 441 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  32.58 
 
 		 441 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  28.38 
 
 		 412 aa  106  7e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  27.76 
 
 		 433 aa  106  7e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1075  phenylacetate--CoA ligase  26.07 
 
 		 429 aa  106  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0169  phenylacetate--CoA ligase  25 
 
 		 433 aa  106  9e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  29.58 
 
 		 432 aa  106  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  32.33 
 
 		 441 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  28.53 
 
 		 433 aa  106  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  28.15 
 
 		 434 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0042  Phenylacetate--CoA ligase  30.12 
 
 		 441 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0038  phenylacetate-CoA ligase  30.12 
 
 		 441 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.455543  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2486  phenylacetate-CoA ligase  31.23 
 
 		 450 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  29.32 
 
 		 432 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  29.47 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  31.45 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2016  coenzyme F390 synthetase-like protein  29.91 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.651292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  30.14 
 
 		 432 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  30.14 
 
 		 432 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  31.83 
 
 		 434 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  28.78 
 
 		 434 aa  104  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  29.28 
 
 		 434 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0054  Phenylacetate--CoA ligase  30.23 
 
 		 441 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  31.07 
 
 		 439 aa  103  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  27.34 
 
 		 447 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  30.14 
 
 		 432 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>