More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1580 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1580  AMP-binding protein  100 
 
 		 449 aa  887    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3545  coenzyme F390 synthetase-like  48.81 
 
 		 524 aa  363  3e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1556  coenzyme F390 synthetase-like protein  41.95 
 
 		 435 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.30077  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1800  coenzyme F390 synthetase-like  39.54 
 
 		 450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0238175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1615  Coenzyme F390 synthetase-like protein  42.03 
 
 		 461 aa  254  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1315  hypothetical protein  37.64 
 
 		 442 aa  250  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  hitchhiker  0.000203578 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1004  coenzyme F390 synthetase-like protein  40 
 
 		 442 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3434  coenzyme F390 synthetase-like protein  36.96 
 
 		 467 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3140  hypothetical protein  37.31 
 
 		 447 aa  234  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1469  hypothetical protein  35.19 
 
 		 431 aa  230  4e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1546  coenzyme F390 synthetase-like protein  37.14 
 
 		 443 aa  229  5e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1814  coenzyme F390 synthetase-like protein  36.38 
 
 		 457 aa  229  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3276  coenzyme F390 synthetase-like protein  31.22 
 
 		 417 aa  228  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2614  coenzyme F390 synthetase-like protein  42.61 
 
 		 377 aa  222  9e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0226  coenzyme F390 synthetase  40.11 
 
 		 454 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0636  coenzyme F390 synthetase-like protein  39.64 
 
 		 406 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.201614 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  33.43 
 
 		 432 aa  147  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  30.77 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  30.32 
 
 		 430 aa  139  7e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  30.95 
 
 		 428 aa  137  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  30.54 
 
 		 432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  29.28 
 
 		 436 aa  134  3.9999999999999996e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  29.49 
 
 		 432 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  30.35 
 
 		 435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  29.88 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  30.97 
 
 		 427 aa  127  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  29.05 
 
 		 412 aa  123  7e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  31.46 
 
 		 442 aa  121  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  27.54 
 
 		 413 aa  119  7.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  28.86 
 
 		 423 aa  119  9e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  30.46 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  31.35 
 
 		 437 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  31.44 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  30.21 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  31.87 
 
 		 438 aa  117  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  28.94 
 
 		 434 aa  117  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  29.06 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  28.65 
 
 		 434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  29.05 
 
 		 432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  29.86 
 
 		 435 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2630  phenylacetate-CoA ligase  30.5 
 
 		 439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460145  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  29.19 
 
 		 434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2189  phenylacetate-CoA ligase  31.16 
 
 		 434 aa  113  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0357047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  31.08 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  31.08 
 
 		 441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  27.83 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  31.08 
 
 		 441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  28.49 
 
 		 414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  27.91 
 
 		 427 aa  110  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1676  phenylacetate--CoA ligase  31.76 
 
 		 418 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2051  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  30.12 
 
 		 433 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.433372  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3279  phenylacetate-CoA ligase  28.38 
 
 		 439 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  31.67 
 
 		 441 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  26.17 
 
 		 439 aa  110  5e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2617  phenylacetate-CoA ligase  29 
 
 		 439 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179563  normal  0.174416 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2016  coenzyme F390 synthetase-like protein  29.65 
 
 		 452 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.651292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  26.48 
 
 		 439 aa  109  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1449  phenylacetate-CoA ligase  29.38 
 
 		 429 aa  109  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  29.24 
 
 		 430 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  29.19 
 
 		 434 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  26.98 
 
 		 415 aa  109  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3117  phenylacetate-CoA ligase  28.93 
 
 		 434 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0603128  normal  0.0548798 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  42.21 
 
 		 436 aa  109  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2403  phenylacetate-CoA ligase  30.29 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.670369 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  26.17 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  28.8 
 
 		 434 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1817  coenzyme F390 synthetase  41.25 
 
 		 465 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342453  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  29.34 
 
 		 433 aa  108  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2480  phenylacetate-CoA ligase  29 
 
 		 439 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  28.74 
 
 		 434 aa  108  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  28.94 
 
 		 433 aa  108  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  27.71 
 
 		 432 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  29.21 
 
 		 444 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  28.09 
 
 		 431 aa  107  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  28.49 
 
 		 432 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  28.82 
 
 		 434 aa  107  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  27.84 
 
 		 415 aa  107  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  27.71 
 
 		 433 aa  107  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  29.23 
 
 		 433 aa  107  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  28.22 
 
 		 432 aa  106  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2752  phenylacetate-CoA ligase  28.37 
 
 		 434 aa  106  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0185722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  29.29 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0477  phenylacetate-CoA ligase  31.75 
 
 		 427 aa  106  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  27.83 
 
 		 429 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  28.25 
 
 		 432 aa  106  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1908  phenylacetate-CoA ligase  30.3 
 
 		 446 aa  106  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  28.57 
 
 		 432 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3457  phenylacetate-CoA ligase  30.7 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  29.6 
 
 		 444 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1829  phenylacetate-CoA ligase  30.5 
 
 		 444 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.914606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0901  phenylacetate-CoA ligase  29.41 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  28.74 
 
 		 436 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  30.03 
 
 		 428 aa  104  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2486  phenylacetate-CoA ligase  30.3 
 
 		 450 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  28.69 
 
 		 432 aa  104  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  28.57 
 
 		 434 aa  104  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3634  phenylacetate-CoA ligase  30.64 
 
 		 444 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  28.65 
 
 		 446 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  28.69 
 
 		 432 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  28.69 
 
 		 432 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>