More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1615 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1615  Coenzyme F390 synthetase-like protein  100 
 
 		 461 aa  926    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2614  coenzyme F390 synthetase-like protein  91.28 
 
 		 377 aa  684    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1800  coenzyme F390 synthetase-like  66.89 
 
 		 450 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0238175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3434  coenzyme F390 synthetase-like protein  46.44 
 
 		 467 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1004  coenzyme F390 synthetase-like protein  49.32 
 
 		 442 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1546  coenzyme F390 synthetase-like protein  47.84 
 
 		 443 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3140  hypothetical protein  47.09 
 
 		 447 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0226  coenzyme F390 synthetase  49.62 
 
 		 454 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1315  hypothetical protein  45.25 
 
 		 442 aa  343  5e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  hitchhiker  0.000203578 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1469  hypothetical protein  46.24 
 
 		 431 aa  331  2e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1556  coenzyme F390 synthetase-like protein  43.03 
 
 		 435 aa  285  9e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.30077  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3545  coenzyme F390 synthetase-like  43.01 
 
 		 524 aa  277  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1814  coenzyme F390 synthetase-like protein  38.41 
 
 		 457 aa  264  3e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3276  coenzyme F390 synthetase-like protein  38.92 
 
 		 417 aa  256  8e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1580  AMP-binding protein  42.03 
 
 		 449 aa  254  3e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0636  coenzyme F390 synthetase-like protein  43.36 
 
 		 406 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.201614 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  32.06 
 
 		 438 aa  152  8.999999999999999e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  29.49 
 
 		 432 aa  147  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  31.81 
 
 		 433 aa  144  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  34.32 
 
 		 430 aa  142  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  33.04 
 
 		 432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  32.1 
 
 		 442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  30.25 
 
 		 427 aa  141  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  29.64 
 
 		 437 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  29.83 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  32.66 
 
 		 432 aa  138  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  31.56 
 
 		 434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  29.71 
 
 		 694 aa  136  9e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  28.41 
 
 		 443 aa  136  9e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1075  phenylacetate--CoA ligase  28.95 
 
 		 429 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  28.42 
 
 		 435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  34.57 
 
 		 436 aa  134  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  30.23 
 
 		 431 aa  134  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  30.53 
 
 		 436 aa  133  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  26.77 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  26.47 
 
 		 439 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  29.52 
 
 		 434 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  32.4 
 
 		 436 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1817  coenzyme F390 synthetase  46.94 
 
 		 465 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342453  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  29.41 
 
 		 433 aa  130  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  29.41 
 
 		 433 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  28.7 
 
 		 444 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  31.07 
 
 		 430 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  29.33 
 
 		 432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  27.61 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  29.95 
 
 		 428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  29.27 
 
 		 433 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2115  coenzyme F390 synthetase  30.71 
 
 		 447 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  28.24 
 
 		 412 aa  126  7e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2883  phenylacetate-CoA ligase  30.73 
 
 		 427 aa  126  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  31.31 
 
 		 432 aa  126  9e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  28.21 
 
 		 433 aa  126  9e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  31.27 
 
 		 432 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  31.09 
 
 		 413 aa  125  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  29.91 
 
 		 435 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3367  phenylacetate-CoA ligase  31.26 
 
 		 443 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322757  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  26.27 
 
 		 439 aa  125  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2310  Phenylacetate--CoA ligase  30.43 
 
 		 425 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  31.53 
 
 		 433 aa  124  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  26.79 
 
 		 433 aa  124  5e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  31.43 
 
 		 433 aa  123  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  29.39 
 
 		 433 aa  123  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  31.03 
 
 		 427 aa  123  7e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  28 
 
 		 435 aa  123  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  26.98 
 
 		 433 aa  122  9e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  28.13 
 
 		 436 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  27.35 
 
 		 436 aa  122  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  28.57 
 
 		 439 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4074  phenylacetate-CoA ligase  28.18 
 
 		 437 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  28.45 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  31.19 
 
 		 434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  29.81 
 
 		 432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  26.4 
 
 		 433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  32.78 
 
 		 441 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  31.87 
 
 		 434 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2010  coenzyme F390 synthetase-like protein  29.33 
 
 		 455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.484811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2016  coenzyme F390 synthetase-like protein  30.72 
 
 		 452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.651292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  31.62 
 
 		 446 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  26.22 
 
 		 434 aa  121  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  26.58 
 
 		 414 aa  121  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  29.38 
 
 		 439 aa  120  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1029  Phenylacetate--CoA ligase  30.46 
 
 		 429 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  27.47 
 
 		 434 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  29.52 
 
 		 437 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  29.27 
 
 		 432 aa  120  7e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  29.68 
 
 		 432 aa  120  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0038  phenylacetate-CoA ligase  28.97 
 
 		 441 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.455543  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  30.92 
 
 		 445 aa  120  7e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0054  Phenylacetate--CoA ligase  29.47 
 
 		 441 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  32.05 
 
 		 433 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  30.34 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  26.52 
 
 		 414 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  29.07 
 
 		 449 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  29.87 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  28.94 
 
 		 430 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  31.76 
 
 		 428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  30.26 
 
 		 432 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  28.35 
 
 		 434 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  27.9 
 
 		 435 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  27.5 
 
 		 434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>