More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2614 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2614  coenzyme F390 synthetase-like protein  100 
 
 		 377 aa  755    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1615  Coenzyme F390 synthetase-like protein  91.28 
 
 		 461 aa  684    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1800  coenzyme F390 synthetase-like  70.59 
 
 		 450 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0238175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3434  coenzyme F390 synthetase-like protein  48.17 
 
 		 467 aa  352  5e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1004  coenzyme F390 synthetase-like protein  51.67 
 
 		 442 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1546  coenzyme F390 synthetase-like protein  49.72 
 
 		 443 aa  322  6e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0226  coenzyme F390 synthetase  52.92 
 
 		 454 aa  316  4e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3140  hypothetical protein  48.33 
 
 		 447 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1315  hypothetical protein  47.5 
 
 		 442 aa  298  8e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  hitchhiker  0.000203578 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1469  hypothetical protein  48.07 
 
 		 431 aa  273  3e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1556  coenzyme F390 synthetase-like protein  44.2 
 
 		 435 aa  256  6e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.30077  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3545  coenzyme F390 synthetase-like  41.69 
 
 		 524 aa  240  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1814  coenzyme F390 synthetase-like protein  39.95 
 
 		 457 aa  231  1e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3276  coenzyme F390 synthetase-like protein  40.85 
 
 		 417 aa  227  3e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1580  AMP-binding protein  42.61 
 
 		 449 aa  222  7e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0636  coenzyme F390 synthetase-like protein  46.88 
 
 		 406 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.201614 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1817  coenzyme F390 synthetase  46.94 
 
 		 465 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342453  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  30.85 
 
 		 438 aa  124  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  30.21 
 
 		 432 aa  119  6e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  30.54 
 
 		 442 aa  119  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  27.13 
 
 		 432 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  30.82 
 
 		 432 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  29.55 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  31.14 
 
 		 432 aa  113  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  30.75 
 
 		 436 aa  113  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  30.4 
 
 		 434 aa  113  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  31.91 
 
 		 430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  29.18 
 
 		 432 aa  110  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  27.67 
 
 		 427 aa  109  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  35.12 
 
 		 436 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  29.29 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  28.11 
 
 		 435 aa  107  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  26.24 
 
 		 443 aa  106  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  30.5 
 
 		 431 aa  105  9e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  30.03 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  34.97 
 
 		 427 aa  104  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2016  coenzyme F390 synthetase-like protein  32.67 
 
 		 452 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.651292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  27.17 
 
 		 437 aa  103  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  27.12 
 
 		 433 aa  103  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  27.12 
 
 		 433 aa  103  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  34.9 
 
 		 428 aa  102  8e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  27.88 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  30.29 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4074  phenylacetate-CoA ligase  29.32 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  34.05 
 
 		 414 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  36.57 
 
 		 428 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2010  coenzyme F390 synthetase-like protein  29.86 
 
 		 455 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.484811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  38.85 
 
 		 433 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  30.79 
 
 		 436 aa  101  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  36.77 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  49.52 
 
 		 436 aa  100  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  33.71 
 
 		 438 aa  100  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  36.13 
 
 		 415 aa  100  6e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2408  Phenylacetate--CoA ligase  28.57 
 
 		 429 aa  99.8  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0464701 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  36.13 
 
 		 414 aa  99.8  8e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0824  phenylacetate--CoA ligase  29.8 
 
 		 429 aa  99.4  8e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  29.93 
 
 		 432 aa  99.4  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_811  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  28.52 
 
 		 429 aa  98.6  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  31.82 
 
 		 445 aa  99.4  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  27.48 
 
 		 436 aa  98.6  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0382  phenylacetate--CoA ligase  35.47 
 
 		 442 aa  99  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  32.73 
 
 		 415 aa  98.2  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  31.87 
 
 		 458 aa  98.2  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  31.12 
 
 		 441 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  30.94 
 
 		 694 aa  98.6  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  26.63 
 
 		 433 aa  97.8  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  31.12 
 
 		 441 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  31.12 
 
 		 441 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  28.79 
 
 		 436 aa  97.8  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0838  phenylacetate--CoA ligase  30 
 
 		 431 aa  97.4  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  26.69 
 
 		 433 aa  97.1  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  29.77 
 
 		 444 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3367  phenylacetate-CoA ligase  30.65 
 
 		 443 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322757  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  30.99 
 
 		 433 aa  96.7  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  30.24 
 
 		 428 aa  96.7  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1908  phenylacetate-CoA ligase  28.67 
 
 		 446 aa  96.3  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  26.1 
 
 		 435 aa  96.7  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  28.97 
 
 		 432 aa  96.7  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  29.96 
 
 		 433 aa  96.7  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  31.33 
 
 		 446 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  28.27 
 
 		 435 aa  95.9  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  28.96 
 
 		 432 aa  95.5  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  31.13 
 
 		 434 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  45.45 
 
 		 433 aa  95.5  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2310  Phenylacetate--CoA ligase  31.08 
 
 		 425 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1592  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  32.68 
 
 		 397 aa  95.1  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  29.89 
 
 		 433 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  31 
 
 		 441 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  27.76 
 
 		 413 aa  93.6  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  29.11 
 
 		 429 aa  93.6  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  37.82 
 
 		 445 aa  93.2  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  29.34 
 
 		 432 aa  93.2  7e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  32.95 
 
 		 435 aa  92.8  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08400  coenzyme F390 synthetase  28.74 
 
 		 447 aa  93.2  8e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0324519  normal  0.311069 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  27.92 
 
 		 433 aa  93.2  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  27.48 
 
 		 434 aa  92.8  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  28.67 
 
 		 439 aa  92.8  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  29.07 
 
 		 433 aa  92.4  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2115  coenzyme F390 synthetase  27.76 
 
 		 447 aa  92  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  30.5 
 
 		 433 aa  92.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>