More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1800 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1800  coenzyme F390 synthetase-like  100 
 
 		 450 aa  911    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0238175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1615  Coenzyme F390 synthetase-like protein  66.89 
 
 		 461 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2614  coenzyme F390 synthetase-like protein  70.59 
 
 		 377 aa  504  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3434  coenzyme F390 synthetase-like protein  46.9 
 
 		 467 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1004  coenzyme F390 synthetase-like protein  51.11 
 
 		 442 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1546  coenzyme F390 synthetase-like protein  48.88 
 
 		 443 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3140  hypothetical protein  48.31 
 
 		 447 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1315  hypothetical protein  51.96 
 
 		 442 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  hitchhiker  0.000203578 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0226  coenzyme F390 synthetase  44.57 
 
 		 454 aa  350  2e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1469  hypothetical protein  46.22 
 
 		 431 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1556  coenzyme F390 synthetase-like protein  42.99 
 
 		 435 aa  292  9e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.30077  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3545  coenzyme F390 synthetase-like  41.51 
 
 		 524 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1814  coenzyme F390 synthetase-like protein  38.21 
 
 		 457 aa  281  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3276  coenzyme F390 synthetase-like protein  33.02 
 
 		 417 aa  276  4e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0636  coenzyme F390 synthetase-like protein  44.93 
 
 		 406 aa  265  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.201614 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1580  AMP-binding protein  39.54 
 
 		 449 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  30.7 
 
 		 438 aa  153  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  28.93 
 
 		 427 aa  152  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  29.47 
 
 		 442 aa  147  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  27.43 
 
 		 439 aa  145  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  32.86 
 
 		 430 aa  144  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  29.03 
 
 		 694 aa  143  7e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  29.1 
 
 		 428 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  32.95 
 
 		 432 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  26.44 
 
 		 439 aa  139  7e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2115  coenzyme F390 synthetase  31.18 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  28.31 
 
 		 433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  29.49 
 
 		 430 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  31.71 
 
 		 431 aa  137  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  26.7 
 
 		 439 aa  137  5e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  28.9 
 
 		 435 aa  136  7.000000000000001e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  26.22 
 
 		 414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  25.71 
 
 		 414 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1075  phenylacetate--CoA ligase  27.56 
 
 		 429 aa  133  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  29.58 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  29.17 
 
 		 432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  27.97 
 
 		 436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  29.72 
 
 		 443 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  28.1 
 
 		 413 aa  131  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1817  coenzyme F390 synthetase  46.94 
 
 		 465 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342453  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  29.26 
 
 		 433 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  30.58 
 
 		 436 aa  129  9.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  26.14 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2051  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  30.65 
 
 		 433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.433372  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  28.85 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  29.25 
 
 		 432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  29.92 
 
 		 432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  26.37 
 
 		 432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  26.12 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  27.45 
 
 		 432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  30.4 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  26.27 
 
 		 414 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  28.73 
 
 		 435 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  28.31 
 
 		 434 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  31.05 
 
 		 441 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  30.64 
 
 		 441 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  27.39 
 
 		 439 aa  128  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  29.16 
 
 		 412 aa  128  3e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  31.05 
 
 		 441 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  27.32 
 
 		 432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  30.73 
 
 		 437 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  29.18 
 
 		 432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  26.18 
 
 		 433 aa  127  5e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  26.29 
 
 		 433 aa  127  5e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  27.68 
 
 		 434 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  28.53 
 
 		 449 aa  126  8.000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  25.48 
 
 		 415 aa  126  9e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  26.8 
 
 		 434 aa  126  9e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4074  phenylacetate-CoA ligase  28.72 
 
 		 437 aa  126  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0950  phenylacetate-CoA ligase  31.4 
 
 		 433 aa  126  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000041107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  25.92 
 
 		 432 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  25.92 
 
 		 433 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5775  phenylacetate-CoA ligase  27.39 
 
 		 440 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  26.39 
 
 		 433 aa  124  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2408  Phenylacetate--CoA ligase  31.62 
 
 		 429 aa  124  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0464701 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  28.17 
 
 		 435 aa  123  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  28.69 
 
 		 413 aa  123  6e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  28.9 
 
 		 433 aa  123  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  25.82 
 
 		 433 aa  123  7e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  25.34 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1318  phenylacetate-CoA ligase  27.17 
 
 		 440 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  27.17 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2016  coenzyme F390 synthetase-like protein  30.75 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.651292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3839  phenylacetate-CoA ligase  27.17 
 
 		 440 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4529  phenylacetate-CoA ligase  27.17 
 
 		 440 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652745  normal  0.906833 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2883  phenylacetate-CoA ligase  30.88 
 
 		 427 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  25.86 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  28.98 
 
 		 435 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  28.53 
 
 		 435 aa  120  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  27.25 
 
 		 433 aa  121  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4422  phenylacetate-CoA ligase  26.73 
 
 		 440 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  28.26 
 
 		 438 aa  120  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  28.32 
 
 		 445 aa  121  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  26.44 
 
 		 433 aa  121  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  27.76 
 
 		 427 aa  121  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0133  Phenylacetate--CoA ligase  27.42 
 
 		 436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0426675  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  25.57 
 
 		 436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  25.91 
 
 		 433 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  29.34 
 
 		 415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  27.56 
 
 		 434 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>