More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3140 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3140  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  919    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3434  coenzyme F390 synthetase-like protein  46.25 
 
 		 467 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1800  coenzyme F390 synthetase-like  48.31 
 
 		 450 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0238175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1315  hypothetical protein  46.95 
 
 		 442 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  hitchhiker  0.000203578 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1004  coenzyme F390 synthetase-like protein  46.88 
 
 		 442 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1546  coenzyme F390 synthetase-like protein  43.62 
 
 		 443 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1615  Coenzyme F390 synthetase-like protein  47.09 
 
 		 461 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0226  coenzyme F390 synthetase  44.72 
 
 		 454 aa  334  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1469  hypothetical protein  42.89 
 
 		 431 aa  318  2e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2614  coenzyme F390 synthetase-like protein  48.33 
 
 		 377 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1814  coenzyme F390 synthetase-like protein  36.28 
 
 		 457 aa  256  5e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3276  coenzyme F390 synthetase-like protein  34.65 
 
 		 417 aa  252  8.000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3545  coenzyme F390 synthetase-like  39.48 
 
 		 524 aa  248  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1556  coenzyme F390 synthetase-like protein  36.53 
 
 		 435 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.30077  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1580  AMP-binding protein  37.31 
 
 		 449 aa  234  3e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0636  coenzyme F390 synthetase-like protein  37.61 
 
 		 406 aa  223  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.201614 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  33.51 
 
 		 427 aa  154  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  30.46 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  33.43 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  32.72 
 
 		 412 aa  136  7.000000000000001e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  30.99 
 
 		 432 aa  133  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  31.06 
 
 		 430 aa  131  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4074  phenylacetate-CoA ligase  30.65 
 
 		 437 aa  129  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  31.93 
 
 		 433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  31.19 
 
 		 430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2310  Phenylacetate--CoA ligase  31.6 
 
 		 425 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  31.27 
 
 		 432 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  28.87 
 
 		 413 aa  126  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  33.88 
 
 		 415 aa  126  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  32.89 
 
 		 415 aa  126  9e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  30.45 
 
 		 436 aa  126  9e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  32.33 
 
 		 436 aa  126  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  32.83 
 
 		 428 aa  126  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  30.06 
 
 		 432 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  32.2 
 
 		 431 aa  125  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  32.59 
 
 		 414 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  31.69 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0169  phenylacetate--CoA ligase  27.25 
 
 		 433 aa  124  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  32.1 
 
 		 414 aa  124  4e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  29.35 
 
 		 438 aa  123  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  30.06 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  32 
 
 		 412 aa  122  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  32.25 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  32.36 
 
 		 435 aa  121  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  29.41 
 
 		 432 aa  121  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  31.73 
 
 		 429 aa  121  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  30.75 
 
 		 434 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  29.45 
 
 		 432 aa  120  6e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  29.48 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2883  phenylacetate-CoA ligase  28.78 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2051  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  31.29 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.433372  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  29.81 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  32.02 
 
 		 437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  29.27 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  31.42 
 
 		 429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  31.31 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1029  Phenylacetate--CoA ligase  29.45 
 
 		 429 aa  117  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  31.4 
 
 		 430 aa  116  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  30.77 
 
 		 432 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  30.42 
 
 		 433 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  30.15 
 
 		 432 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  28.12 
 
 		 435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2115  coenzyme F390 synthetase  29.77 
 
 		 447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  30.72 
 
 		 428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0409  Phenylacetate--CoA ligase  24.94 
 
 		 447 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0103532 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2016  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.02 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.651292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  28.7 
 
 		 433 aa  114  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  26.85 
 
 		 432 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  29.78 
 
 		 436 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2408  Phenylacetate--CoA ligase  29.08 
 
 		 429 aa  114  5e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0464701 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1817  coenzyme F390 synthetase  40 
 
 		 465 aa  114  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342453  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2010  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.74 
 
 		 455 aa  113  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.484811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2458  coenzyme F390 synthetase/phenylacetyl-CoA ligase  28.29 
 
 		 451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  28.75 
 
 		 694 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  29.61 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  29.35 
 
 		 413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  31.74 
 
 		 441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  30.84 
 
 		 446 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  31.75 
 
 		 432 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  30.79 
 
 		 434 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  29.72 
 
 		 445 aa  110  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  29.22 
 
 		 433 aa  110  6e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  29.34 
 
 		 433 aa  110  6e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  28.92 
 
 		 432 aa  110  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  28.09 
 
 		 433 aa  110  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  28 
 
 		 433 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  27.08 
 
 		 433 aa  109  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  27.83 
 
 		 434 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1877  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.35 
 
 		 429 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  28.13 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  26.46 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  30.03 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  27.71 
 
 		 433 aa  108  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  26.63 
 
 		 439 aa  108  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  28.57 
 
 		 439 aa  108  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08400  coenzyme F390 synthetase  24.42 
 
 		 447 aa  107  3e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0324519  normal  0.311069 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  29.36 
 
 		 434 aa  108  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  31.44 
 
 		 432 aa  107  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  31.13 
 
 		 423 aa  107  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  30.23 
 
 		 441 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>