More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2458 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2458  coenzyme F390 synthetase/phenylacetyl-CoA ligase  100 
 
 		 451 aa  926    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0508  coenzyme F390 synthetase  65.02 
 
 		 455 aa  614  1e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1754  coenzyme F390 synthetase  62.97 
 
 		 451 aa  594  1e-169  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2226  coenzyme F390 synthetase/phenylacetyl-CoA ligase  60.31 
 
 		 450 aa  596  1e-169  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.457159 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0107  coenzyme F390 synthetase/phenylacetyl-CoA ligase  63 
 
 		 451 aa  588  1e-167  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0602  coenzyme F390 synthetase  58.54 
 
 		 451 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0488194  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  30.09 
 
 		 443 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  31.33 
 
 		 427 aa  161  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0409  Phenylacetate--CoA ligase  30.53 
 
 		 447 aa  158  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0103532 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08400  coenzyme F390 synthetase  29.22 
 
 		 447 aa  159  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0324519  normal  0.311069 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  30.12 
 
 		 432 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  27.85 
 
 		 434 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2792  phenylacetate--CoA ligase  26.72 
 
 		 440 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  28.7 
 
 		 442 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  29.3 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  28.88 
 
 		 438 aa  151  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  28.73 
 
 		 458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  26.99 
 
 		 432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  31.52 
 
 		 436 aa  147  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  32.42 
 
 		 434 aa  147  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  28.73 
 
 		 445 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  25.5 
 
 		 433 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  25.5 
 
 		 433 aa  144  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  27.45 
 
 		 447 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1613  Phenylacetate--CoA ligase  27.89 
 
 		 445 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297864  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  26.5 
 
 		 431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  27.76 
 
 		 433 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  27.76 
 
 		 433 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  25.5 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  30.61 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  28.5 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  28.53 
 
 		 433 aa  138  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  26.72 
 
 		 436 aa  138  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  31.4 
 
 		 430 aa  138  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  25.76 
 
 		 436 aa  138  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  25.05 
 
 		 433 aa  137  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  26.49 
 
 		 434 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  27.46 
 
 		 433 aa  137  5e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2152  Phenylacetate--CoA ligase  32.24 
 
 		 446 aa  137  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65736  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  28.98 
 
 		 441 aa  137  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  27.16 
 
 		 433 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  26.32 
 
 		 433 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  25.72 
 
 		 432 aa  136  8e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  28.98 
 
 		 441 aa  136  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  24.67 
 
 		 433 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  28.98 
 
 		 441 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  25.5 
 
 		 432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0169  phenylacetate--CoA ligase  26.51 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  28.23 
 
 		 434 aa  134  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  27.91 
 
 		 432 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  26.2 
 
 		 433 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  26.34 
 
 		 439 aa  134  5e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1132  Phenylacetate--CoA ligase  27.11 
 
 		 418 aa  133  6e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  24.78 
 
 		 435 aa  133  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  25.5 
 
 		 432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  25.97 
 
 		 433 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1845  phenylacetate-CoA ligase  31.75 
 
 		 440 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  25.61 
 
 		 439 aa  131  3e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  26.96 
 
 		 437 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  26.28 
 
 		 439 aa  129  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  29.5 
 
 		 430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  25.76 
 
 		 435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  31.06 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  25.38 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4074  phenylacetate-CoA ligase  27.96 
 
 		 437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  28.57 
 
 		 432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  26.48 
 
 		 435 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  25.12 
 
 		 433 aa  127  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  27.29 
 
 		 428 aa  128  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  27.16 
 
 		 432 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2486  phenylacetate-CoA ligase  29.36 
 
 		 450 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  27.16 
 
 		 432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  25.6 
 
 		 434 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  31.4 
 
 		 444 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  31.19 
 
 		 441 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  28.16 
 
 		 432 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  30.75 
 
 		 432 aa  126  9e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  27.84 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3048  phenylacetate-CoA ligase  28.34 
 
 		 456 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  27.49 
 
 		 694 aa  125  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  25.05 
 
 		 432 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  27.16 
 
 		 432 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  27.16 
 
 		 432 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  27.16 
 
 		 432 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  28.91 
 
 		 449 aa  124  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  26.15 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  26.62 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  26.54 
 
 		 432 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2322  Phenylacetate--CoA ligase  30.42 
 
 		 449 aa  124  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  26.12 
 
 		 423 aa  124  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  24.06 
 
 		 433 aa  124  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2189  phenylacetate-CoA ligase  28.7 
 
 		 434 aa  123  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0357047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  25.97 
 
 		 435 aa  123  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0539  phenylacetate--CoA ligase  27.71 
 
 		 477 aa  123  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  decreased coverage  0.00138843 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  26.96 
 
 		 434 aa  123  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  30.28 
 
 		 446 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3655  phenylacetate--CoA ligase  25.7 
 
 		 481 aa  123  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  29.7 
 
 		 433 aa  123  8e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  26.43 
 
 		 429 aa  122  9e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  27.54 
 
 		 434 aa  122  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>