More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0602 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0508  coenzyme F390 synthetase  65.03 
 
 		 455 aa  642    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0602  coenzyme F390 synthetase  100 
 
 		 451 aa  940    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0488194  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2458  coenzyme F390 synthetase/phenylacetyl-CoA ligase  58.54 
 
 		 451 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0107  coenzyme F390 synthetase/phenylacetyl-CoA ligase  59.64 
 
 		 451 aa  571  1.0000000000000001e-162  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2226  coenzyme F390 synthetase/phenylacetyl-CoA ligase  58.2 
 
 		 450 aa  571  1e-161  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.457159 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1754  coenzyme F390 synthetase  58.31 
 
 		 451 aa  567  1e-160  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2792  phenylacetate--CoA ligase  32.88 
 
 		 440 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  33.54 
 
 		 443 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  28.12 
 
 		 438 aa  161  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  31.22 
 
 		 427 aa  161  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  29.24 
 
 		 432 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0409  Phenylacetate--CoA ligase  29.84 
 
 		 447 aa  154  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0103532 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  27.59 
 
 		 433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  27.53 
 
 		 442 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  28 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  28.12 
 
 		 434 aa  154  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  29.14 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  28.01 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  30 
 
 		 434 aa  149  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  26.81 
 
 		 436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  27.97 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20330  phenylacetate-CoA ligase  31.05 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  30.93 
 
 		 428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1613  Phenylacetate--CoA ligase  29.61 
 
 		 445 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297864  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  26.33 
 
 		 432 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  27.88 
 
 		 432 aa  147  5e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  29.32 
 
 		 433 aa  147  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  31 
 
 		 435 aa  147  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08400  coenzyme F390 synthetase  28.23 
 
 		 447 aa  146  6e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0324519  normal  0.311069 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  26.96 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  29.61 
 
 		 445 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  26.73 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  27.88 
 
 		 432 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  30.09 
 
 		 435 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  26.68 
 
 		 433 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0169  phenylacetate--CoA ligase  29.55 
 
 		 433 aa  144  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  27.72 
 
 		 433 aa  144  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  27.88 
 
 		 432 aa  144  4e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  30.4 
 
 		 436 aa  143  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  26.46 
 
 		 433 aa  142  8e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  27.59 
 
 		 439 aa  142  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  27.17 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  27.11 
 
 		 433 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  25.71 
 
 		 433 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  26.21 
 
 		 432 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  29.7 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  25.61 
 
 		 431 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  30.58 
 
 		 433 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  26.46 
 
 		 433 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  25.88 
 
 		 433 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  29.88 
 
 		 433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  25.71 
 
 		 433 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  26.65 
 
 		 432 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3048  phenylacetate-CoA ligase  26.42 
 
 		 456 aa  141  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  29.79 
 
 		 433 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  31.1 
 
 		 433 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  25.61 
 
 		 435 aa  140  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  25.99 
 
 		 432 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  26.52 
 
 		 435 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  26.21 
 
 		 432 aa  140  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  26.59 
 
 		 432 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  26.59 
 
 		 432 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  27.01 
 
 		 434 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  26.85 
 
 		 433 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  27.45 
 
 		 447 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  29.79 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  26.21 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  28.23 
 
 		 430 aa  139  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  29.27 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  28.57 
 
 		 458 aa  139  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  26.33 
 
 		 432 aa  138  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  28.07 
 
 		 429 aa  138  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  29.48 
 
 		 434 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  26.71 
 
 		 433 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  27.69 
 
 		 434 aa  137  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  27.9 
 
 		 423 aa  137  5e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  26.55 
 
 		 432 aa  137  5e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  26.34 
 
 		 433 aa  137  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  29.79 
 
 		 449 aa  137  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  26.61 
 
 		 434 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2322  Phenylacetate--CoA ligase  28.88 
 
 		 449 aa  136  8e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  29.18 
 
 		 434 aa  136  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  26.06 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  25.55 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  26.29 
 
 		 439 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2486  phenylacetate-CoA ligase  29.87 
 
 		 450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  28.16 
 
 		 428 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  26.16 
 
 		 435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  28.99 
 
 		 439 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  29.27 
 
 		 446 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  28.38 
 
 		 433 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  28.66 
 
 		 436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  30.28 
 
 		 444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  26.06 
 
 		 439 aa  134  3e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  29.87 
 
 		 448 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  29.27 
 
 		 435 aa  133  5e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  26.23 
 
 		 433 aa  134  5e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  26.61 
 
 		 430 aa  133  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  28.05 
 
 		 433 aa  133  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2189  phenylacetate-CoA ligase  29.64 
 
 		 434 aa  133  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0357047  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>