More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0508 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0508  coenzyme F390 synthetase  100 
 
 		 455 aa  939    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0602  coenzyme F390 synthetase  65.03 
 
 		 451 aa  642    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0488194  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1754  coenzyme F390 synthetase  64.13 
 
 		 451 aa  620  1e-176  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2226  coenzyme F390 synthetase/phenylacetyl-CoA ligase  62.33 
 
 		 450 aa  618  1e-176  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.457159 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2458  coenzyme F390 synthetase/phenylacetyl-CoA ligase  65.02 
 
 		 451 aa  614  1e-175  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0107  coenzyme F390 synthetase/phenylacetyl-CoA ligase  63.45 
 
 		 451 aa  613  9.999999999999999e-175  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  30.89 
 
 		 432 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  32.61 
 
 		 438 aa  170  5e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  30.55 
 
 		 434 aa  167  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  32.32 
 
 		 442 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  29.66 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  33.23 
 
 		 434 aa  161  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  30.65 
 
 		 431 aa  160  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  32 
 
 		 443 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2792  phenylacetate--CoA ligase  30.11 
 
 		 440 aa  160  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0409  Phenylacetate--CoA ligase  30.37 
 
 		 447 aa  159  7e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0103532 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  29.04 
 
 		 427 aa  157  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  29.63 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2322  Phenylacetate--CoA ligase  31.42 
 
 		 449 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  29.94 
 
 		 433 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  30.65 
 
 		 434 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  30 
 
 		 434 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  25.44 
 
 		 433 aa  150  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  30.7 
 
 		 435 aa  150  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  30.21 
 
 		 449 aa  150  7e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  29.32 
 
 		 433 aa  149  8e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  30.86 
 
 		 448 aa  149  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  30.4 
 
 		 436 aa  149  9e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  30.09 
 
 		 434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  29.18 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3279  phenylacetate-CoA ligase  28.25 
 
 		 439 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  29.4 
 
 		 445 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2617  phenylacetate-CoA ligase  28.75 
 
 		 439 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179563  normal  0.174416 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  28.79 
 
 		 433 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  29.68 
 
 		 432 aa  147  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  29.79 
 
 		 434 aa  147  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08400  coenzyme F390 synthetase  29.52 
 
 		 447 aa  147  5e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0324519  normal  0.311069 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  30 
 
 		 434 aa  147  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  26.58 
 
 		 436 aa  147  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  30.58 
 
 		 430 aa  146  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  30.18 
 
 		 428 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  28.13 
 
 		 433 aa  146  9e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  30.4 
 
 		 435 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2630  phenylacetate-CoA ligase  27.99 
 
 		 439 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460145  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  28.13 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  26.77 
 
 		 439 aa  145  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  28.22 
 
 		 434 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  29.03 
 
 		 432 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  29.35 
 
 		 432 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  26.75 
 
 		 434 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3550  phenylacetate-CoA ligase  29.68 
 
 		 432 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489447  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2480  phenylacetate-CoA ligase  27.74 
 
 		 439 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2486  phenylacetate-CoA ligase  30.16 
 
 		 450 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  28.7 
 
 		 436 aa  144  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3577  phenylacetate-CoA ligase  29.68 
 
 		 432 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306139  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2904  phenylacetate-CoA ligase  29.68 
 
 		 432 aa  144  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  29.79 
 
 		 433 aa  144  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  29.48 
 
 		 434 aa  144  5e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20330  phenylacetate-CoA ligase  29.05 
 
 		 449 aa  143  6e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2189  phenylacetate-CoA ligase  30.32 
 
 		 434 aa  143  8e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0357047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  29.66 
 
 		 433 aa  143  8e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  27.07 
 
 		 434 aa  142  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1613  Phenylacetate--CoA ligase  28.61 
 
 		 445 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  28.4 
 
 		 439 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  29.68 
 
 		 436 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3568  phenylacetate-CoA ligase  29.35 
 
 		 432 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172482  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  29.29 
 
 		 458 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  28.66 
 
 		 432 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1845  phenylacetate-CoA ligase  30.56 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  27.05 
 
 		 439 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  27.37 
 
 		 433 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  31.1 
 
 		 435 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  30.25 
 
 		 433 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  29.57 
 
 		 433 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0539  phenylacetate-coenzyme A ligase  29.35 
 
 		 432 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0321632  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1905  phenylacetate-coenzyme A ligase  29.35 
 
 		 432 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511484  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  29.57 
 
 		 433 aa  141  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  28.71 
 
 		 432 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0935  phenylacetate-coenzyme A ligase  29.35 
 
 		 432 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0638  phenylacetate-CoA ligase  29.35 
 
 		 432 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100652  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  26.26 
 
 		 433 aa  141  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  28.71 
 
 		 432 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  27.41 
 
 		 434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  28.71 
 
 		 432 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  28.71 
 
 		 432 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  29.88 
 
 		 432 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1392  phenylacetate-CoA ligase  26.56 
 
 		 441 aa  140  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.276204  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2403  phenylacetate-CoA ligase  28.53 
 
 		 436 aa  139  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.670369 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3048  phenylacetate-CoA ligase  28.96 
 
 		 456 aa  139  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1318  phenylacetate-CoA ligase  30.55 
 
 		 440 aa  139  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  31.38 
 
 		 428 aa  139  7e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  28.27 
 
 		 433 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  29.75 
 
 		 439 aa  139  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  29.35 
 
 		 434 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  27.48 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  29.88 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3959  phenylacetate-CoA ligase  30.55 
 
 		 440 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349382  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4529  phenylacetate-CoA ligase  30.23 
 
 		 440 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652745  normal  0.906833 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  29.66 
 
 		 433 aa  138  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  27.52 
 
 		 435 aa  138  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>