More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2226 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2226  coenzyme F390 synthetase/phenylacetyl-CoA ligase  100 
 
 
450 aa  934    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.457159 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0508  coenzyme F390 synthetase  62.33 
 
 
455 aa  618  1e-176  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2458  coenzyme F390 synthetase/phenylacetyl-CoA ligase  60.31 
 
 
451 aa  596  1e-169  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0602  coenzyme F390 synthetase  58.2 
 
 
451 aa  571  1e-161  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0488194  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0107  coenzyme F390 synthetase/phenylacetyl-CoA ligase  60 
 
 
451 aa  564  1.0000000000000001e-159  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1754  coenzyme F390 synthetase  56.76 
 
 
451 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  31.06 
 
 
438 aa  158  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  28.57 
 
 
432 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  30.05 
 
 
427 aa  157  4e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  30.46 
 
 
432 aa  156  7e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  31.38 
 
 
443 aa  156  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  31 
 
 
434 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  32.82 
 
 
434 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  31.91 
 
 
436 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  28.35 
 
 
433 aa  154  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  30.03 
 
 
431 aa  153  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  29.65 
 
 
429 aa  153  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  29.44 
 
 
442 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  28.86 
 
 
434 aa  152  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  30.75 
 
 
433 aa  151  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  28.29 
 
 
433 aa  151  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  29.72 
 
 
433 aa  151  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  29.38 
 
 
436 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  29.23 
 
 
433 aa  150  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0409  Phenylacetate--CoA ligase  29.59 
 
 
447 aa  150  5e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0103532 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08400  coenzyme F390 synthetase  28.21 
 
 
447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0324519  normal  0.311069 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  28.53 
 
 
434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2792  phenylacetate--CoA ligase  28.31 
 
 
440 aa  147  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  30.19 
 
 
428 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  27.65 
 
 
434 aa  147  5e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  27.21 
 
 
439 aa  145  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  26.23 
 
 
439 aa  145  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  30.4 
 
 
428 aa  145  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  31.91 
 
 
432 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  31.37 
 
 
432 aa  144  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4074  phenylacetate-CoA ligase  28.44 
 
 
437 aa  143  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1132  Phenylacetate--CoA ligase  29.35 
 
 
418 aa  143  6e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  27.05 
 
 
437 aa  143  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  26.55 
 
 
432 aa  143  6e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20330  phenylacetate-CoA ligase  29.72 
 
 
449 aa  143  6e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2322  Phenylacetate--CoA ligase  31.63 
 
 
449 aa  143  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  26.33 
 
 
432 aa  143  7e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  28.79 
 
 
433 aa  143  7e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  27.81 
 
 
435 aa  142  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1318  phenylacetate-CoA ligase  26.1 
 
 
440 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  30.65 
 
 
433 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  26.21 
 
 
433 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3839  phenylacetate-CoA ligase  26.1 
 
 
440 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4529  phenylacetate-CoA ligase  26.1 
 
 
440 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652745  normal  0.906833 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  28.62 
 
 
433 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  29.26 
 
 
434 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  28.91 
 
 
448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  29.23 
 
 
435 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  30.7 
 
 
434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  26.11 
 
 
432 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  27.21 
 
 
439 aa  140  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  31.12 
 
 
435 aa  140  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3048  phenylacetate-CoA ligase  27.31 
 
 
456 aa  139  7.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  30.12 
 
 
439 aa  139  7.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  28 
 
 
433 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  30.7 
 
 
434 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  28 
 
 
433 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  26.43 
 
 
433 aa  138  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  28.29 
 
 
433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1392  phenylacetate-CoA ligase  26.1 
 
 
441 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.276204  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  30.09 
 
 
436 aa  137  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5775  phenylacetate-CoA ligase  25.66 
 
 
440 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  31.01 
 
 
412 aa  137  5e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  28.27 
 
 
433 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3655  phenylacetate--CoA ligase  28.83 
 
 
481 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  29.35 
 
 
432 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  29.29 
 
 
694 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  30.09 
 
 
433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  27.32 
 
 
433 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  29.35 
 
 
432 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  29.18 
 
 
435 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  29.1 
 
 
413 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  29.43 
 
 
430 aa  134  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3959  phenylacetate-CoA ligase  25.44 
 
 
440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349382  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  29.39 
 
 
449 aa  133  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4422  phenylacetate-CoA ligase  25.44 
 
 
440 aa  134  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  26.67 
 
 
433 aa  134  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5019  phenylacetate--CoA ligase  26.45 
 
 
477 aa  134  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.173124  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  29.41 
 
 
433 aa  133  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  26.3 
 
 
434 aa  132  9e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  31.08 
 
 
435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  30.46 
 
 
434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0950  phenylacetate-CoA ligase  29.23 
 
 
433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000041107  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4126  phenylacetate-CoA ligase  25.22 
 
 
440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351473  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  29.1 
 
 
436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  27.58 
 
 
423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  27.42 
 
 
432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  25.88 
 
 
439 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  30.34 
 
 
433 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  29.81 
 
 
433 aa  131  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  27.76 
 
 
435 aa  131  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  28.71 
 
 
432 aa  131  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  27.85 
 
 
458 aa  131  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  28 
 
 
433 aa  131  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  30.15 
 
 
433 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>