More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1754 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1754  coenzyme F390 synthetase  100 
 
 		 451 aa  936    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0508  coenzyme F390 synthetase  64.13 
 
 		 455 aa  620  1e-176  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0107  coenzyme F390 synthetase/phenylacetyl-CoA ligase  62.78 
 
 		 451 aa  594  1e-169  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2458  coenzyme F390 synthetase/phenylacetyl-CoA ligase  62.97 
 
 		 451 aa  594  1e-169  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0602  coenzyme F390 synthetase  58.31 
 
 		 451 aa  567  1e-160  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0488194  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2226  coenzyme F390 synthetase/phenylacetyl-CoA ligase  56.76 
 
 		 450 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.457159 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  31.4 
 
 		 432 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  29.58 
 
 		 428 aa  166  8e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  31.03 
 
 		 443 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  32.21 
 
 		 438 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2792  phenylacetate--CoA ligase  29.79 
 
 		 440 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0409  Phenylacetate--CoA ligase  30.77 
 
 		 447 aa  160  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0103532 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  30.2 
 
 		 432 aa  159  9e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  32.34 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  31.02 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  30.38 
 
 		 445 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  29.41 
 
 		 431 aa  153  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  31.71 
 
 		 432 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  28.35 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  26.43 
 
 		 433 aa  151  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1613  Phenylacetate--CoA ligase  29.84 
 
 		 445 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297864  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  26.21 
 
 		 433 aa  150  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  25.99 
 
 		 433 aa  149  8e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  28.35 
 
 		 432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  31.31 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  27.43 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  31 
 
 		 435 aa  147  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  25.95 
 
 		 433 aa  147  5e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  29.79 
 
 		 434 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  27.93 
 
 		 447 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  25.88 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  30.79 
 
 		 437 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  26.04 
 
 		 436 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  28.49 
 
 		 458 aa  144  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  29.19 
 
 		 442 aa  143  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  26.17 
 
 		 433 aa  144  5e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  29.48 
 
 		 434 aa  143  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3048  phenylacetate-CoA ligase  28.54 
 
 		 456 aa  143  7e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  27.59 
 
 		 436 aa  143  7e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  28 
 
 		 434 aa  143  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  29.7 
 
 		 434 aa  142  8e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  26.21 
 
 		 432 aa  143  8e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  30.91 
 
 		 434 aa  142  9e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  26.71 
 
 		 433 aa  142  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  26.17 
 
 		 433 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  26.21 
 
 		 432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1318  phenylacetate-CoA ligase  27.49 
 
 		 440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  25.33 
 
 		 433 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  29.5 
 
 		 430 aa  141  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3839  phenylacetate-CoA ligase  27.49 
 
 		 440 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  27.49 
 
 		 432 aa  141  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4529  phenylacetate-CoA ligase  27.49 
 
 		 440 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652745  normal  0.906833 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  28.57 
 
 		 432 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2486  phenylacetate-CoA ligase  31.19 
 
 		 450 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  27.72 
 
 		 432 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  29.45 
 
 		 448 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4126  phenylacetate-CoA ligase  27.49 
 
 		 440 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351473  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0169  phenylacetate--CoA ligase  27.5 
 
 		 433 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  27.88 
 
 		 434 aa  140  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  30.3 
 
 		 432 aa  140  6e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  26.11 
 
 		 439 aa  139  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  30.42 
 
 		 432 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  30.42 
 
 		 432 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  30.42 
 
 		 432 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26570  phenylacetate-CoA ligase  27.84 
 
 		 448 aa  139  8.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.123505 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  27.62 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5775  phenylacetate-CoA ligase  27.27 
 
 		 440 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  25.77 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  28.1 
 
 		 433 aa  138  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08400  coenzyme F390 synthetase  28.76 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0324519  normal  0.311069 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  25.72 
 
 		 433 aa  138  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  25.5 
 
 		 433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1392  phenylacetate-CoA ligase  27.62 
 
 		 441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.276204  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  30.09 
 
 		 446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  30.19 
 
 		 434 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  26.77 
 
 		 434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  30.26 
 
 		 432 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  28.18 
 
 		 433 aa  137  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4422  phenylacetate-CoA ligase  27.11 
 
 		 440 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  27.79 
 
 		 435 aa  137  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  29.87 
 
 		 434 aa  137  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  28.19 
 
 		 434 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  29.97 
 
 		 433 aa  136  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  25.56 
 
 		 435 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  26.97 
 
 		 430 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  29.55 
 
 		 436 aa  136  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  29.22 
 
 		 439 aa  136  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  27.88 
 
 		 430 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  28.66 
 
 		 432 aa  136  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  25.55 
 
 		 432 aa  136  8e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3959  phenylacetate-CoA ligase  27.11 
 
 		 440 aa  136  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349382  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  28.18 
 
 		 433 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  29.77 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  29.79 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  29.13 
 
 		 432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2904  phenylacetate-CoA ligase  30.1 
 
 		 432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  26.71 
 
 		 429 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3568  phenylacetate-CoA ligase  30.19 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172482  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  26.37 
 
 		 433 aa  134  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  26.5 
 
 		 436 aa  134  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>