More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1817 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1817  coenzyme F390 synthetase  100 
 
 		 465 aa  934    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342453  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0636  coenzyme F390 synthetase-like protein  35.78 
 
 		 406 aa  199  9e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.201614 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0226  coenzyme F390 synthetase  34.58 
 
 		 454 aa  188  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3545  coenzyme F390 synthetase-like  34.92 
 
 		 524 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3434  coenzyme F390 synthetase-like protein  45 
 
 		 467 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1546  coenzyme F390 synthetase-like protein  48.59 
 
 		 443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1004  coenzyme F390 synthetase-like protein  43.22 
 
 		 442 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1800  coenzyme F390 synthetase-like  46.94 
 
 		 450 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0238175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2614  coenzyme F390 synthetase-like protein  46.94 
 
 		 377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1615  Coenzyme F390 synthetase-like protein  46.94 
 
 		 461 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3276  coenzyme F390 synthetase-like protein  36.22 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1315  hypothetical protein  46.05 
 
 		 442 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  hitchhiker  0.000203578 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1469  hypothetical protein  41.18 
 
 		 431 aa  125  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1814  coenzyme F390 synthetase-like protein  44.03 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3140  hypothetical protein  40 
 
 		 447 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1556  coenzyme F390 synthetase-like protein  45 
 
 		 435 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.30077  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1580  AMP-binding protein  51.85 
 
 		 449 aa  108  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  41.13 
 
 		 413 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  42.11 
 
 		 469 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  43.44 
 
 		 427 aa  99.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0582  hypothetical protein  36.78 
 
 		 479 aa  97.8  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.661178  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  27.65 
 
 		 432 aa  97.4  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  41.74 
 
 		 414 aa  97.1  7e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  41.74 
 
 		 414 aa  96.3  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  41.8 
 
 		 428 aa  96.3  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  26.25 
 
 		 432 aa  94.4  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  38.46 
 
 		 438 aa  93.2  9e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0382  phenylacetate--CoA ligase  35.9 
 
 		 442 aa  93.2  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  45.37 
 
 		 431 aa  92.4  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  38.52 
 
 		 435 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  39.84 
 
 		 432 aa  92.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  27.44 
 
 		 439 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  42.99 
 
 		 433 aa  92  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  26.25 
 
 		 432 aa  92  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  45.37 
 
 		 438 aa  92  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  51.58 
 
 		 441 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  49 
 
 		 430 aa  91.3  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  51.58 
 
 		 441 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  51.58 
 
 		 441 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  27.44 
 
 		 439 aa  90.9  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  40 
 
 		 414 aa  91.3  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  40.87 
 
 		 415 aa  91.3  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  40.8 
 
 		 436 aa  90.1  8e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0838  phenylacetate--CoA ligase  46.09 
 
 		 431 aa  89.7  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  26.25 
 
 		 432 aa  89.7  9e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  43.24 
 
 		 442 aa  89.7  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  39.67 
 
 		 439 aa  89.7  9e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  43.44 
 
 		 450 aa  89.7  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  42.34 
 
 		 443 aa  89.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0379  phenylacetate--CoA ligase  42.28 
 
 		 432 aa  89.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  46.15 
 
 		 423 aa  89.4  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  43.44 
 
 		 451 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  42.06 
 
 		 415 aa  89  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0169  phenylacetate--CoA ligase  35.82 
 
 		 433 aa  89  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  37.4 
 
 		 694 aa  89  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  43.12 
 
 		 433 aa  87.8  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  41.8 
 
 		 432 aa  88.2  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2408  Phenylacetate--CoA ligase  42.28 
 
 		 429 aa  88.2  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0464701 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  44.95 
 
 		 433 aa  88.2  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2115  coenzyme F390 synthetase  39.52 
 
 		 447 aa  87.8  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  38.74 
 
 		 458 aa  87.4  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  44.68 
 
 		 434 aa  87.4  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2338  Phenylacetate--CoA ligase  47.87 
 
 		 426 aa  87.4  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  35.94 
 
 		 427 aa  87.4  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  44.44 
 
 		 430 aa  87  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  42.59 
 
 		 434 aa  87  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  41.28 
 
 		 436 aa  86.7  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1943  hypothetical protein  33.97 
 
 		 460 aa  86.7  9e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5790  phenylacetate--CoA ligase  44.34 
 
 		 416 aa  86.7  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1613  Phenylacetate--CoA ligase  37.61 
 
 		 445 aa  86.7  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  46.81 
 
 		 434 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  36.94 
 
 		 445 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  41.8 
 
 		 435 aa  85.9  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  44.04 
 
 		 435 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  37.04 
 
 		 447 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  42.06 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  46.79 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  41.12 
 
 		 433 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  40 
 
 		 432 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  41.8 
 
 		 448 aa  84.7  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  41.28 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  47.31 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  43.12 
 
 		 435 aa  84  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  38.89 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  44.21 
 
 		 433 aa  83.6  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  42.62 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3457  phenylacetate-CoA ligase  46.32 
 
 		 433 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2452  phenylacetate--CoA ligase  46.32 
 
 		 432 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  39.1 
 
 		 436 aa  83.6  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0409  Phenylacetate--CoA ligase  40 
 
 		 447 aa  83.6  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0103532 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  36.59 
 
 		 412 aa  83.2  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0291  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  40.98 
 
 		 453 aa  83.6  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.326701  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2526  Coenzyme F390 synthetase-like protein  27.81 
 
 		 437 aa  82.4  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142234 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  45.45 
 
 		 441 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  42.11 
 
 		 433 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  41.28 
 
 		 433 aa  83.2  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0614  CapK related-protein  41.13 
 
 		 445 aa  82.8  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.973847  normal  0.145617 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08400  coenzyme F390 synthetase  38 
 
 		 447 aa  82.4  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0324519  normal  0.311069 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  41.28 
 
 		 435 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03810  coenzyme F390 synthetase-like protein  41.67 
 
 		 429 aa  82  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>