More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0636 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0636  coenzyme F390 synthetase-like protein  100 
 
 		 406 aa  796    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.201614 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1800  coenzyme F390 synthetase-like  44.93 
 
 		 450 aa  265  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0238175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1315  hypothetical protein  45.83 
 
 		 442 aa  263  4e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  hitchhiker  0.000203578 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1615  Coenzyme F390 synthetase-like protein  43.36 
 
 		 461 aa  253  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1004  coenzyme F390 synthetase-like protein  43.92 
 
 		 442 aa  248  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1546  coenzyme F390 synthetase-like protein  42.39 
 
 		 443 aa  239  5.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3434  coenzyme F390 synthetase-like protein  40.35 
 
 		 467 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3545  coenzyme F390 synthetase-like  45.62 
 
 		 524 aa  225  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3140  hypothetical protein  37.61 
 
 		 447 aa  224  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1469  hypothetical protein  35.91 
 
 		 431 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2614  coenzyme F390 synthetase-like protein  46.88 
 
 		 377 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3276  coenzyme F390 synthetase-like protein  33.97 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0226  coenzyme F390 synthetase  39.76 
 
 		 454 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1556  coenzyme F390 synthetase-like protein  42.86 
 
 		 435 aa  209  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.30077  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1580  AMP-binding protein  39.64 
 
 		 449 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1814  coenzyme F390 synthetase-like protein  36.36 
 
 		 457 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1817  coenzyme F390 synthetase  47.78 
 
 		 465 aa  147  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342453  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  32.38 
 
 		 429 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  36.09 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  35.97 
 
 		 438 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  31.58 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  33.53 
 
 		 442 aa  127  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  34.7 
 
 		 431 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  32.41 
 
 		 434 aa  122  9e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0379  phenylacetate--CoA ligase  35.74 
 
 		 432 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  32.41 
 
 		 432 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  33.73 
 
 		 427 aa  119  7e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  30.59 
 
 		 413 aa  119  7.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  30.41 
 
 		 432 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  27.86 
 
 		 413 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  29.85 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  34.15 
 
 		 430 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  27.72 
 
 		 414 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  32.27 
 
 		 432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  27.72 
 
 		 414 aa  116  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  29.51 
 
 		 435 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  30.75 
 
 		 428 aa  116  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  29.51 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  30.56 
 
 		 434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  27.4 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  31.12 
 
 		 694 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  31.06 
 
 		 432 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  29.51 
 
 		 433 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  29.06 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  28.09 
 
 		 433 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  29.17 
 
 		 439 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  30.12 
 
 		 423 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  29.3 
 
 		 412 aa  113  7.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  29.27 
 
 		 432 aa  113  7.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  31.6 
 
 		 428 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  32.15 
 
 		 432 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  27.47 
 
 		 433 aa  112  9e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2408  Phenylacetate--CoA ligase  34.45 
 
 		 429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0464701 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  28.12 
 
 		 433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  32.24 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  27.39 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  28.66 
 
 		 436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  27.24 
 
 		 414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  29.72 
 
 		 438 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  29.88 
 
 		 430 aa  110  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  29.25 
 
 		 432 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  29.34 
 
 		 435 aa  110  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  30.28 
 
 		 434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  31.25 
 
 		 430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  27.47 
 
 		 433 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  30.52 
 
 		 412 aa  109  9.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  28.75 
 
 		 439 aa  109  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  31.94 
 
 		 441 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  31.94 
 
 		 441 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  28.62 
 
 		 432 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1029  Phenylacetate--CoA ligase  29.97 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2338  Phenylacetate--CoA ligase  32.3 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  27.16 
 
 		 439 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  30.03 
 
 		 427 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  30.28 
 
 		 434 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  32.43 
 
 		 434 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  26.3 
 
 		 433 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  28.44 
 
 		 432 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3457  phenylacetate-CoA ligase  33.33 
 
 		 433 aa  107  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  28.88 
 
 		 433 aa  106  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  28.43 
 
 		 439 aa  106  6e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  30.63 
 
 		 441 aa  106  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  27.86 
 
 		 432 aa  106  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  27.81 
 
 		 433 aa  106  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  30.31 
 
 		 428 aa  106  9e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  30 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  27.78 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2016  coenzyme F390 synthetase-like protein  29.57 
 
 		 452 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.651292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  27 
 
 		 435 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  31.94 
 
 		 436 aa  104  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  29.84 
 
 		 432 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  32.81 
 
 		 444 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  29.13 
 
 		 433 aa  103  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  31.94 
 
 		 434 aa  103  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2115  coenzyme F390 synthetase  30.19 
 
 		 447 aa  102  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  30.17 
 
 		 458 aa  102  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  29.06 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3117  phenylacetate-CoA ligase  30.91 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0603128  normal  0.0548798 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  28.66 
 
 		 433 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  28 
 
 		 434 aa  102  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>