More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3545 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3545  coenzyme F390 synthetase-like  100 
 
 		 524 aa  1049    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1580  AMP-binding protein  48.81 
 
 		 449 aa  363  4e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1800  coenzyme F390 synthetase-like  41.51 
 
 		 450 aa  286  7e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0238175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1615  Coenzyme F390 synthetase-like protein  43.01 
 
 		 461 aa  277  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3434  coenzyme F390 synthetase-like protein  40.26 
 
 		 467 aa  276  9e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1315  hypothetical protein  41.34 
 
 		 442 aa  270  7e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  hitchhiker  0.000203578 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3140  hypothetical protein  39.48 
 
 		 447 aa  248  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1556  coenzyme F390 synthetase-like protein  43.05 
 
 		 435 aa  243  9e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.30077  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1004  coenzyme F390 synthetase-like protein  40.16 
 
 		 442 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2614  coenzyme F390 synthetase-like protein  41.69 
 
 		 377 aa  240  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1546  coenzyme F390 synthetase-like protein  41.79 
 
 		 443 aa  239  6.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1814  coenzyme F390 synthetase-like protein  41.16 
 
 		 457 aa  239  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1469  hypothetical protein  34.83 
 
 		 431 aa  236  8e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0226  coenzyme F390 synthetase  39.79 
 
 		 454 aa  226  7e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0636  coenzyme F390 synthetase-like protein  45.62 
 
 		 406 aa  225  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.201614 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3276  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.54 
 
 		 417 aa  189  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  32.08 
 
 		 427 aa  151  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  33.53 
 
 		 434 aa  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  31.43 
 
 		 432 aa  143  8e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  30.81 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  31.25 
 
 		 436 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  32.28 
 
 		 438 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  30.41 
 
 		 430 aa  137  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  29.36 
 
 		 439 aa  136  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  27.78 
 
 		 433 aa  135  3e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  29.46 
 
 		 441 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  29.45 
 
 		 428 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  27.49 
 
 		 433 aa  134  5e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  31.27 
 
 		 431 aa  133  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  29.45 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  28.4 
 
 		 432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  28.39 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  28.81 
 
 		 432 aa  131  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  28.87 
 
 		 432 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  29.38 
 
 		 436 aa  130  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  30.86 
 
 		 413 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  27.94 
 
 		 435 aa  129  9.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  26.71 
 
 		 433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  30.88 
 
 		 441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  28.53 
 
 		 432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  30.88 
 
 		 441 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  30.88 
 
 		 441 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  30.51 
 
 		 442 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  27.91 
 
 		 439 aa  127  6e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  28.99 
 
 		 432 aa  126  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  28.96 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  28.07 
 
 		 429 aa  126  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  27.32 
 
 		 432 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  27.42 
 
 		 413 aa  125  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  29.46 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  29.17 
 
 		 435 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  26.96 
 
 		 434 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  27.56 
 
 		 412 aa  125  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  27.4 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  27.57 
 
 		 432 aa  125  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1908  phenylacetate-CoA ligase  31.32 
 
 		 446 aa  124  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1817  coenzyme F390 synthetase  49.19 
 
 		 465 aa  123  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342453  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  25.43 
 
 		 434 aa  123  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  31.01 
 
 		 428 aa  123  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  31.56 
 
 		 441 aa  123  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1029  Phenylacetate--CoA ligase  29.86 
 
 		 429 aa  123  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  25.73 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2115  coenzyme F390 synthetase  30.13 
 
 		 447 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  28.36 
 
 		 414 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  29.43 
 
 		 443 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  27.73 
 
 		 436 aa  121  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  27.71 
 
 		 433 aa  121  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  28.78 
 
 		 438 aa  121  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2010  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.84 
 
 		 455 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.484811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  27.4 
 
 		 434 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  29.35 
 
 		 434 aa  120  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2486  phenylacetate-CoA ligase  30.08 
 
 		 450 aa  120  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  26.42 
 
 		 434 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  31.02 
 
 		 415 aa  120  7.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  29.71 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  33.14 
 
 		 694 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  30.35 
 
 		 434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2883  phenylacetate-CoA ligase  30.5 
 
 		 427 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  25.75 
 
 		 437 aa  118  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  27.15 
 
 		 433 aa  118  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0950  phenylacetate-CoA ligase  29.95 
 
 		 433 aa  118  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000041107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3117  phenylacetate-CoA ligase  29.11 
 
 		 434 aa  118  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0603128  normal  0.0548798 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  29.1 
 
 		 415 aa  118  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  27.92 
 
 		 434 aa  118  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  28.99 
 
 		 449 aa  118  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  26.52 
 
 		 433 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  27.84 
 
 		 433 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  27.89 
 
 		 432 aa  117  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  26.93 
 
 		 435 aa  117  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  26.99 
 
 		 435 aa  117  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0901  phenylacetate-CoA ligase  30.12 
 
 		 445 aa  117  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  29.86 
 
 		 437 aa  117  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2051  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  31.33 
 
 		 433 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.433372  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  28.92 
 
 		 432 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2189  phenylacetate-CoA ligase  31.58 
 
 		 434 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0357047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  28.82 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  25.32 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0477  phenylacetate-CoA ligase  31.07 
 
 		 427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  24.51 
 
 		 433 aa  115  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0409  Phenylacetate--CoA ligase  27.1 
 
 		 447 aa  114  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0103532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>