More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2010 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2010  coenzyme F390 synthetase-like protein  100 
 
 		 455 aa  946    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.484811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2016  coenzyme F390 synthetase-like protein  39.63 
 
 		 452 aa  273  6e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.651292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  33.04 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  29.49 
 
 		 433 aa  173  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  29.18 
 
 		 432 aa  173  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  30.93 
 
 		 433 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  30.25 
 
 		 432 aa  172  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  31.53 
 
 		 433 aa  170  5e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  30.77 
 
 		 434 aa  169  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  29.41 
 
 		 433 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  29.32 
 
 		 434 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  32.21 
 
 		 433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  29.58 
 
 		 433 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  30.86 
 
 		 434 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  29.85 
 
 		 436 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3613  coenzyme F390 synthetase  29.22 
 
 		 436 aa  163  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0420369  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  28.96 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  29.27 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  28.29 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  29.3 
 
 		 433 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  28.07 
 
 		 435 aa  162  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  28.77 
 
 		 434 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  30.37 
 
 		 433 aa  162  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  30.77 
 
 		 435 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  28.32 
 
 		 435 aa  160  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  30.15 
 
 		 433 aa  160  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  29.15 
 
 		 434 aa  160  5e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  32.37 
 
 		 434 aa  160  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  28.18 
 
 		 433 aa  160  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  30.99 
 
 		 433 aa  159  7e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  28.27 
 
 		 434 aa  159  9e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  29.43 
 
 		 433 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  29.66 
 
 		 430 aa  158  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  28.69 
 
 		 446 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  28.39 
 
 		 441 aa  158  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  29.72 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  28.13 
 
 		 433 aa  157  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  28.95 
 
 		 432 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  28.09 
 
 		 433 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  29.1 
 
 		 431 aa  156  6e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  27.91 
 
 		 433 aa  156  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  28.09 
 
 		 433 aa  156  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  28.86 
 
 		 434 aa  156  9e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  28.08 
 
 		 434 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  29.52 
 
 		 443 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  28.05 
 
 		 428 aa  155  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  28.69 
 
 		 444 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  27.08 
 
 		 434 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  28.61 
 
 		 432 aa  155  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  31.06 
 
 		 429 aa  155  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  26.87 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  30.56 
 
 		 434 aa  155  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  29.79 
 
 		 432 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  28 
 
 		 444 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  28.53 
 
 		 432 aa  153  5e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  30.42 
 
 		 437 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  28.99 
 
 		 433 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  28.83 
 
 		 433 aa  153  7e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  27.6 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  30.14 
 
 		 439 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  29.92 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  30.42 
 
 		 439 aa  151  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  27.63 
 
 		 432 aa  152  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  30.42 
 
 		 439 aa  151  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  30.46 
 
 		 442 aa  151  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  27.62 
 
 		 444 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  29.39 
 
 		 434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  27.48 
 
 		 439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  30.59 
 
 		 428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2792  phenylacetate--CoA ligase  28.37 
 
 		 440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  32.78 
 
 		 436 aa  147  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  29.91 
 
 		 441 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  29.91 
 
 		 441 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  29.91 
 
 		 441 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  28.42 
 
 		 430 aa  147  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  29.05 
 
 		 433 aa  146  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  27.3 
 
 		 436 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4320  phenylacetate--CoA ligase  30.49 
 
 		 444 aa  146  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  30.03 
 
 		 432 aa  146  9e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  30.68 
 
 		 427 aa  146  9e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  28.77 
 
 		 430 aa  145  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  27.69 
 
 		 433 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  28.23 
 
 		 441 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  28.43 
 
 		 458 aa  144  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  28.95 
 
 		 436 aa  144  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  28.61 
 
 		 446 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  27.14 
 
 		 436 aa  143  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  31.62 
 
 		 429 aa  142  9e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  31.1 
 
 		 433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  29.48 
 
 		 445 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  26.93 
 
 		 432 aa  141  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  29.48 
 
 		 436 aa  140  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  31.01 
 
 		 433 aa  140  6e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  27.89 
 
 		 433 aa  140  6e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  24.58 
 
 		 432 aa  140  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08400  coenzyme F390 synthetase  27.45 
 
 		 447 aa  139  1e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0324519  normal  0.311069 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2322  Phenylacetate--CoA ligase  27 
 
 		 449 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4074  phenylacetate-CoA ligase  28.9 
 
 		 437 aa  139  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  29.56 
 
 		 423 aa  138  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  29.57 
 
 		 428 aa  138  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>