More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3613 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3613  coenzyme F390 synthetase  100 
 
 		 436 aa  875    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0420369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  32.4 
 
 		 434 aa  187  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2016  coenzyme F390 synthetase-like protein  31.78 
 
 		 452 aa  187  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.651292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  32.02 
 
 		 434 aa  176  5e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  32.41 
 
 		 430 aa  176  9e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  30 
 
 		 429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  33.26 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  31.65 
 
 		 430 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  30.65 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  34.66 
 
 		 444 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2010  coenzyme F390 synthetase-like protein  29.22 
 
 		 455 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.484811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  32.07 
 
 		 433 aa  168  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  31.53 
 
 		 435 aa  166  5e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  31.89 
 
 		 428 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  30.17 
 
 		 429 aa  164  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  32.28 
 
 		 432 aa  163  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  35.61 
 
 		 441 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  31.76 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  32.49 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  31.25 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  29.52 
 
 		 434 aa  161  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  29.52 
 
 		 434 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  33.43 
 
 		 431 aa  160  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  33.49 
 
 		 444 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  32.27 
 
 		 432 aa  160  4e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  30.91 
 
 		 434 aa  160  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  31.21 
 
 		 433 aa  160  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  32.02 
 
 		 434 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  30.88 
 
 		 435 aa  160  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  34.58 
 
 		 438 aa  160  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  31.85 
 
 		 432 aa  159  6e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  35.19 
 
 		 441 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  33.72 
 
 		 434 aa  159  9e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  35.19 
 
 		 441 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  34.95 
 
 		 441 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  29.98 
 
 		 435 aa  157  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  31.59 
 
 		 432 aa  156  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  31.92 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  32.63 
 
 		 446 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  29.44 
 
 		 437 aa  155  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  31.06 
 
 		 428 aa  155  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  29.09 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  31.07 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  30.12 
 
 		 435 aa  153  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  31.22 
 
 		 433 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  31.62 
 
 		 435 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  30.68 
 
 		 434 aa  153  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  29.44 
 
 		 433 aa  152  8.999999999999999e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  31.76 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  30.42 
 
 		 439 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  33.43 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  30.59 
 
 		 439 aa  151  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  30.05 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  30.39 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  27.55 
 
 		 433 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  30.47 
 
 		 433 aa  151  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  30.27 
 
 		 433 aa  150  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  29.93 
 
 		 439 aa  150  5e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  31.17 
 
 		 436 aa  149  8e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  31.45 
 
 		 413 aa  149  8e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  30.84 
 
 		 436 aa  149  8e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  30.02 
 
 		 435 aa  149  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  29.17 
 
 		 433 aa  149  9e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  29.66 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  29.38 
 
 		 436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  30.84 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  32.41 
 
 		 412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  29.25 
 
 		 432 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  29.91 
 
 		 432 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  29.47 
 
 		 433 aa  147  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  28.5 
 
 		 432 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  30.02 
 
 		 433 aa  145  9e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  31.07 
 
 		 433 aa  146  9e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  28.85 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  28.72 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  30.49 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  28.87 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  29.44 
 
 		 432 aa  144  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  27.82 
 
 		 415 aa  144  4e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  30.59 
 
 		 439 aa  143  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  31.6 
 
 		 432 aa  142  9e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  30.05 
 
 		 433 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  30.05 
 
 		 433 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  31.38 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  29.77 
 
 		 433 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  29.71 
 
 		 431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  32.64 
 
 		 446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  28.97 
 
 		 439 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  28.7 
 
 		 436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  28.87 
 
 		 433 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  29.55 
 
 		 435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  29.72 
 
 		 433 aa  141  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  29.26 
 
 		 432 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  30.47 
 
 		 432 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  27.96 
 
 		 414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  30.16 
 
 		 438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  27.96 
 
 		 414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5526  phenylacetate-CoA ligase  33.5 
 
 		 449 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0759485  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  31.34 
 
 		 436 aa  140  4.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  30.6 
 
 		 412 aa  139  7.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>