More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1546 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1546  coenzyme F390 synthetase-like protein  100 
 
 		 443 aa  886    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1004  coenzyme F390 synthetase-like protein  63.55 
 
 		 442 aa  547  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3434  coenzyme F390 synthetase-like protein  49.46 
 
 		 467 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1800  coenzyme F390 synthetase-like  48.88 
 
 		 450 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0238175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1315  hypothetical protein  47.29 
 
 		 442 aa  376  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  hitchhiker  0.000203578 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1615  Coenzyme F390 synthetase-like protein  47.84 
 
 		 461 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3140  hypothetical protein  43.62 
 
 		 447 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0226  coenzyme F390 synthetase  48.17 
 
 		 454 aa  368  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1469  hypothetical protein  46.59 
 
 		 431 aa  342  1e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2614  coenzyme F390 synthetase-like protein  49.72 
 
 		 377 aa  322  8e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1814  coenzyme F390 synthetase-like protein  40.27 
 
 		 457 aa  290  4e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3276  coenzyme F390 synthetase-like protein  35.65 
 
 		 417 aa  261  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1556  coenzyme F390 synthetase-like protein  41.01 
 
 		 435 aa  256  5e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.30077  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3545  coenzyme F390 synthetase-like  41.79 
 
 		 524 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0636  coenzyme F390 synthetase-like protein  42.39 
 
 		 406 aa  239  9e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.201614 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1580  AMP-binding protein  37.14 
 
 		 449 aa  229  5e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  33.92 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  30.88 
 
 		 434 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  29.02 
 
 		 432 aa  147  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  33.06 
 
 		 427 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  30.08 
 
 		 433 aa  144  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  28.84 
 
 		 413 aa  141  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  31.66 
 
 		 431 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  30.29 
 
 		 435 aa  139  7e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  31.86 
 
 		 430 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  27.72 
 
 		 432 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1817  coenzyme F390 synthetase  48.59 
 
 		 465 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342453  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  29.97 
 
 		 433 aa  137  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2904  phenylacetate-CoA ligase  32.27 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  30.47 
 
 		 412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  30.46 
 
 		 436 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3568  phenylacetate-CoA ligase  32 
 
 		 432 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172482  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3550  phenylacetate-CoA ligase  32 
 
 		 432 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489447  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3577  phenylacetate-CoA ligase  32 
 
 		 432 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306139  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  27.94 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0539  phenylacetate-coenzyme A ligase  32 
 
 		 432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0321632  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5526  phenylacetate-CoA ligase  30.87 
 
 		 449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0759485  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0935  phenylacetate-coenzyme A ligase  32 
 
 		 432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  30.73 
 
 		 432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  27.88 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0638  phenylacetate-CoA ligase  32 
 
 		 432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100652  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1905  phenylacetate-coenzyme A ligase  32 
 
 		 432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511484  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  31.75 
 
 		 432 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  29.6 
 
 		 432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  27.9 
 
 		 433 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  29.37 
 
 		 434 aa  131  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  29.59 
 
 		 434 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  31.1 
 
 		 434 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  30.68 
 
 		 432 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  30.56 
 
 		 415 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4074  phenylacetate-CoA ligase  30.79 
 
 		 437 aa  129  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  29.98 
 
 		 436 aa  129  9.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  27.42 
 
 		 439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3367  phenylacetate-CoA ligase  31.51 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322757  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  27.25 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  31.12 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2752  phenylacetate-CoA ligase  29.26 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0185722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  29.49 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  28.45 
 
 		 414 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  29.64 
 
 		 432 aa  127  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  28.84 
 
 		 433 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0169  phenylacetate--CoA ligase  28.57 
 
 		 433 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  27.15 
 
 		 439 aa  127  5e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0901  phenylacetate-CoA ligase  31.46 
 
 		 445 aa  127  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2883  phenylacetate-CoA ligase  30.17 
 
 		 427 aa  127  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  28.39 
 
 		 432 aa  127  6e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  26.53 
 
 		 433 aa  126  7e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  30.89 
 
 		 430 aa  126  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  29.33 
 
 		 434 aa  126  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  32.53 
 
 		 436 aa  126  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  26.48 
 
 		 436 aa  126  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  29.46 
 
 		 433 aa  126  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  28.47 
 
 		 434 aa  126  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3117  phenylacetate-CoA ligase  31.12 
 
 		 434 aa  126  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0603128  normal  0.0548798 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  30.85 
 
 		 444 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  27.56 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  28.42 
 
 		 432 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  29.73 
 
 		 434 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  31.63 
 
 		 414 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  29.65 
 
 		 431 aa  124  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5775  phenylacetate-CoA ligase  28.08 
 
 		 440 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  27.7 
 
 		 435 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  30.87 
 
 		 428 aa  124  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  30.48 
 
 		 694 aa  124  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  31.23 
 
 		 434 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  26.54 
 
 		 433 aa  123  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  30.02 
 
 		 432 aa  123  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1318  phenylacetate-CoA ligase  28.34 
 
 		 440 aa  122  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  29.07 
 
 		 435 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  30.47 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  25.99 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  29.1 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  30.81 
 
 		 436 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  30.57 
 
 		 449 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  28.14 
 
 		 436 aa  122  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  26.72 
 
 		 433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  25.73 
 
 		 433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3839  phenylacetate-CoA ligase  27.85 
 
 		 440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4529  phenylacetate-CoA ligase  27.85 
 
 		 440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652745  normal  0.906833 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  28.08 
 
 		 434 aa  120  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>