More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3276 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3276  coenzyme F390 synthetase-like protein  100 
 
 
417 aa  847    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1800  coenzyme F390 synthetase-like  33.02 
 
 
450 aa  276  4e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0238175  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1469  hypothetical protein  40.06 
 
 
431 aa  268  2e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1004  coenzyme F390 synthetase-like protein  37.9 
 
 
442 aa  261  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1546  coenzyme F390 synthetase-like protein  35.65 
 
 
443 aa  261  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1615  Coenzyme F390 synthetase-like protein  38.92 
 
 
461 aa  256  7e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3140  hypothetical protein  34.65 
 
 
447 aa  252  7e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3434  coenzyme F390 synthetase-like protein  35.9 
 
 
467 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1315  hypothetical protein  37.54 
 
 
442 aa  245  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  hitchhiker  0.000203578 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0226  coenzyme F390 synthetase  33.43 
 
 
454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1580  AMP-binding protein  31.22 
 
 
449 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2614  coenzyme F390 synthetase-like protein  40.85 
 
 
377 aa  227  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0636  coenzyme F390 synthetase-like protein  33.97 
 
 
406 aa  218  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.201614 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1814  coenzyme F390 synthetase-like protein  34.08 
 
 
457 aa  203  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1556  coenzyme F390 synthetase-like protein  31.79 
 
 
435 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.30077  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3545  coenzyme F390 synthetase-like  28.54 
 
 
524 aa  189  8e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  29.94 
 
 
430 aa  136  8e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  28.35 
 
 
434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  33.33 
 
 
412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1817  coenzyme F390 synthetase  38.55 
 
 
465 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342453  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  27.3 
 
 
428 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  31.17 
 
 
413 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  28.02 
 
 
432 aa  123  7e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  28.53 
 
 
439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  28.8 
 
 
439 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  26.73 
 
 
432 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  27.61 
 
 
439 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  25.23 
 
 
432 aa  117  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  28.03 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  30.31 
 
 
435 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  31.31 
 
 
414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  26.71 
 
 
429 aa  112  9e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  30.3 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  28.13 
 
 
436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  26.46 
 
 
430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  31.7 
 
 
415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  27.24 
 
 
429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  30.64 
 
 
414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1132  Phenylacetate--CoA ligase  24.55 
 
 
418 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  25.84 
 
 
428 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  28.87 
 
 
432 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  29.29 
 
 
415 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  26.94 
 
 
438 aa  109  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2338  Phenylacetate--CoA ligase  29.55 
 
 
426 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  28.76 
 
 
433 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4074  phenylacetate-CoA ligase  24.85 
 
 
437 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  26.35 
 
 
433 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  28.76 
 
 
433 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  27.96 
 
 
432 aa  107  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  27.27 
 
 
412 aa  107  4e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2125  phenylacetate-CoA ligase  29.24 
 
 
427 aa  107  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2408  Phenylacetate--CoA ligase  29.93 
 
 
429 aa  106  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0464701 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  27.69 
 
 
433 aa  107  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  29.38 
 
 
427 aa  106  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  28.29 
 
 
436 aa  106  7e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  29.29 
 
 
433 aa  106  8e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  28.4 
 
 
432 aa  106  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  22.4 
 
 
441 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  26.75 
 
 
433 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  22.4 
 
 
441 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  25.53 
 
 
423 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  28.38 
 
 
413 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  22.4 
 
 
441 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  27.56 
 
 
434 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  29.39 
 
 
438 aa  104  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  27.42 
 
 
433 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  26.73 
 
 
432 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  28.57 
 
 
436 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  26.46 
 
 
433 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  24.36 
 
 
431 aa  103  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  27.36 
 
 
428 aa  103  6e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  27.08 
 
 
436 aa  103  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  27.06 
 
 
433 aa  102  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  27.48 
 
 
428 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3457  phenylacetate-CoA ligase  28.57 
 
 
433 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  25.91 
 
 
432 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  26.71 
 
 
427 aa  102  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  28.09 
 
 
434 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2115  coenzyme F390 synthetase  28.13 
 
 
447 aa  101  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  26.38 
 
 
433 aa  101  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  24.06 
 
 
432 aa  101  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  25.53 
 
 
430 aa  101  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1029  Phenylacetate--CoA ligase  24.75 
 
 
429 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0838  phenylacetate--CoA ligase  27.99 
 
 
431 aa  100  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  26.38 
 
 
433 aa  100  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  27.09 
 
 
435 aa  100  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  25.23 
 
 
432 aa  100  7e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  25.6 
 
 
433 aa  99.8  8e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  26.83 
 
 
442 aa  99.4  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  23.74 
 
 
441 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  24.88 
 
 
436 aa  99  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2883  phenylacetate-CoA ligase  25.56 
 
 
427 aa  99.4  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  26.32 
 
 
436 aa  99  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  25.33 
 
 
433 aa  99  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  25 
 
 
433 aa  98.6  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  25.97 
 
 
433 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  27.06 
 
 
432 aa  98.6  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  24.83 
 
 
433 aa  97.8  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  26.97 
 
 
432 aa  97.8  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  27.71 
 
 
437 aa  97.8  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>