More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1676 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1676  phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 		 418 aa  862    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  40.48 
 
 		 432 aa  332  6e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  40.19 
 
 		 433 aa  330  3e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  40.43 
 
 		 435 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  40.38 
 
 		 434 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  41.4 
 
 		 433 aa  326  6e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  40.38 
 
 		 436 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  39.95 
 
 		 433 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  39.95 
 
 		 433 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  39.37 
 
 		 433 aa  320  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  39.9 
 
 		 432 aa  318  1e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4074  phenylacetate-CoA ligase  39.05 
 
 		 437 aa  316  4e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  38.7 
 
 		 433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  38.89 
 
 		 434 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  39.08 
 
 		 432 aa  311  1e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  42.34 
 
 		 428 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  39.71 
 
 		 433 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  38.7 
 
 		 433 aa  309  6.999999999999999e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  39.08 
 
 		 432 aa  309  6.999999999999999e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  38.41 
 
 		 436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  38.59 
 
 		 432 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  38.83 
 
 		 433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  41.29 
 
 		 435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  41.03 
 
 		 435 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  39.81 
 
 		 432 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  36.89 
 
 		 432 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  37.83 
 
 		 433 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  37.77 
 
 		 433 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  38.35 
 
 		 432 aa  302  7.000000000000001e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  36.96 
 
 		 433 aa  302  7.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  39.65 
 
 		 435 aa  301  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  40.4 
 
 		 434 aa  301  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  37.14 
 
 		 432 aa  300  3e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  40.4 
 
 		 434 aa  298  9e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  36.47 
 
 		 433 aa  296  3e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  37.05 
 
 		 433 aa  296  4e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  36.56 
 
 		 433 aa  296  4e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  36.12 
 
 		 439 aa  295  9e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  36.69 
 
 		 433 aa  295  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  38.44 
 
 		 441 aa  294  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  39.65 
 
 		 433 aa  294  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  38.89 
 
 		 434 aa  292  6e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  38.41 
 
 		 438 aa  291  1e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  38.65 
 
 		 433 aa  291  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  39.8 
 
 		 433 aa  290  3e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  37.74 
 
 		 430 aa  289  7e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  37.35 
 
 		 434 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  38.31 
 
 		 433 aa  285  8e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  37.05 
 
 		 434 aa  280  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  36.45 
 
 		 431 aa  280  4e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  38.07 
 
 		 433 aa  279  8e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  38.38 
 
 		 435 aa  278  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  35.49 
 
 		 429 aa  277  3e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  37.53 
 
 		 439 aa  276  7e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  33.73 
 
 		 433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  37.16 
 
 		 439 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0838  phenylacetate--CoA ligase  36.54 
 
 		 431 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  37.91 
 
 		 423 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  37.03 
 
 		 439 aa  273  3e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  37.25 
 
 		 434 aa  271  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  37.37 
 
 		 435 aa  271  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  36.07 
 
 		 432 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  34.21 
 
 		 433 aa  268  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  37.41 
 
 		 436 aa  266  7e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  35.07 
 
 		 432 aa  264  2e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  34.79 
 
 		 428 aa  261  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  35.75 
 
 		 423 aa  260  3e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1132  Phenylacetate--CoA ligase  36.3 
 
 		 418 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  35.66 
 
 		 445 aa  259  8e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  33.97 
 
 		 428 aa  258  1e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  38.44 
 
 		 437 aa  253  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  33.91 
 
 		 429 aa  254  3e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  33.92 
 
 		 436 aa  253  4.0000000000000004e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  31.41 
 
 		 430 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  33.42 
 
 		 435 aa  253  6e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  35.16 
 
 		 443 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  36.86 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  36.29 
 
 		 446 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  34.5 
 
 		 448 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0038  phenylacetate-CoA ligase  36.46 
 
 		 441 aa  249  6e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.455543  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  33.1 
 
 		 437 aa  248  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0042  Phenylacetate--CoA ligase  36.46 
 
 		 441 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0054  Phenylacetate--CoA ligase  36.39 
 
 		 441 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  34.54 
 
 		 446 aa  247  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  35.77 
 
 		 441 aa  246  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  36.36 
 
 		 431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  33.33 
 
 		 432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  32.86 
 
 		 434 aa  244  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3096  phenylacetate-CoA ligase  33.5 
 
 		 439 aa  244  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0154139  hitchhiker  0.00102169 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  36.68 
 
 		 434 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2630  phenylacetate-CoA ligase  33.82 
 
 		 439 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460145  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  34.57 
 
 		 439 aa  243  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2883  phenylacetate-CoA ligase  35.82 
 
 		 427 aa  243  5e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  34.13 
 
 		 434 aa  243  6e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3279  phenylacetate-CoA ligase  33.73 
 
 		 439 aa  242  9e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1236  phenylacetate-CoA ligase  37.16 
 
 		 436 aa  242  9e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2617  phenylacetate-CoA ligase  34.2 
 
 		 439 aa  242  9e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179563  normal  0.174416 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  35.75 
 
 		 434 aa  242  9e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3367  phenylacetate-CoA ligase  35.29 
 
 		 443 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322757  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  34.57 
 
 		 449 aa  241  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>