More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1950 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1950  capK related-protein  100 
 
 		 446 aa  923    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  33.11 
 
 		 451 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  31.11 
 
 		 457 aa  205  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1971  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  29.27 
 
 		 453 aa  190  5e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  34.43 
 
 		 426 aa  188  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  29.39 
 
 		 480 aa  182  8.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0291  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  29.4 
 
 		 453 aa  179  8e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.326701  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.52 
 
 		 446 aa  168  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  28.17 
 
 		 464 aa  168  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  27.59 
 
 		 469 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0676  putative CapK protein  29.36 
 
 		 459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0499803  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2310  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.34 
 
 		 475 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  30.73 
 
 		 453 aa  160  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  27.59 
 
 		 450 aa  159  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2316  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.78 
 
 		 450 aa  152  8e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1535  CapK protein, putative  29.84 
 
 		 461 aa  150  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  26.36 
 
 		 448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  26.37 
 
 		 439 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3567  CapK related-protein  29.23 
 
 		 502 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1793  putative CapK protein  28.12 
 
 		 441 aa  141  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0614  CapK related-protein  28.54 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.973847  normal  0.145617 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2007  CapK related-protein  26.41 
 
 		 487 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.21 
 
 		 454 aa  130  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3332  coenzyme F390 synthetase-like  26.68 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.422547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0295  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  28.83 
 
 		 461 aa  124  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2299  hypothetical protein  24.71 
 
 		 448 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2526  Coenzyme F390 synthetase-like protein  22.02 
 
 		 437 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142234 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  28.87 
 
 		 432 aa  120  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3795  CapK protein, putative  24.03 
 
 		 475 aa  120  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.217638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0441  capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.75 
 
 		 468 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356155  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2647  coenzyme F390 synthetase-like  27.15 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1200  hypothetical protein  26.76 
 
 		 448 aa  117  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0277555  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13008  possible CapK protein  22.66 
 
 		 463 aa  116  6e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0922559  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  28.44 
 
 		 432 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  26.85 
 
 		 458 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2883  phenylacetate-CoA ligase  28.21 
 
 		 427 aa  114  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  26.25 
 
 		 443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  27.96 
 
 		 432 aa  111  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0449  putative capK protein  25.06 
 
 		 446 aa  110  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1040  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.83 
 
 		 436 aa  109  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  27.05 
 
 		 434 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  25.58 
 
 		 434 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1800  putative polysaccharide biosynthesis protein  26 
 
 		 448 aa  107  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  27.76 
 
 		 436 aa  107  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  26.82 
 
 		 430 aa  107  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0477  phenylacetate-CoA ligase  26.65 
 
 		 427 aa  104  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1029  Phenylacetate--CoA ligase  27.79 
 
 		 429 aa  104  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  26.87 
 
 		 432 aa  103  5e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  27.27 
 
 		 437 aa  103  7e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2322  Phenylacetate--CoA ligase  28.94 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  25.67 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  26.05 
 
 		 432 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  27.1 
 
 		 433 aa  102  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  29.15 
 
 		 432 aa  102  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1585  Phenylacetate--CoA ligase  25.17 
 
 		 457 aa  101  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0730683 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  27.78 
 
 		 438 aa  101  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0582  hypothetical protein  27.54 
 
 		 479 aa  101  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.661178  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  28.24 
 
 		 431 aa  101  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  28.57 
 
 		 449 aa  100  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  26.23 
 
 		 444 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  26.74 
 
 		 433 aa  99.8  9e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26570  phenylacetate-CoA ligase  25.87 
 
 		 448 aa  99.8  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.123505 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  24.29 
 
 		 435 aa  99.4  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2897  Phenylacetate--CoA ligase  27.47 
 
 		 428 aa  98.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  27.78 
 
 		 433 aa  98.2  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  27.08 
 
 		 444 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  27.17 
 
 		 435 aa  98.2  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  26.27 
 
 		 444 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  28.36 
 
 		 427 aa  98.2  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.67 
 
 		 436 aa  97.8  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  28.1 
 
 		 437 aa  97.8  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  29.28 
 
 		 435 aa  97.1  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  24 
 
 		 433 aa  96.3  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  24.48 
 
 		 433 aa  96.3  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0901  phenylacetate-CoA ligase  27.25 
 
 		 445 aa  95.9  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  26.08 
 
 		 444 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  26.14 
 
 		 433 aa  95.9  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  25.75 
 
 		 432 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  26.27 
 
 		 434 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  25.52 
 
 		 442 aa  95.5  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  27.86 
 
 		 433 aa  95.5  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  24.64 
 
 		 433 aa  94.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  27.38 
 
 		 441 aa  94.4  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  26.39 
 
 		 433 aa  94.7  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  27.03 
 
 		 434 aa  94.7  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  25.83 
 
 		 432 aa  94  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  27.38 
 
 		 434 aa  94.4  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  26.57 
 
 		 434 aa  94.4  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  26.55 
 
 		 428 aa  94.4  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20330  phenylacetate-CoA ligase  24.48 
 
 		 449 aa  94.4  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  24.34 
 
 		 433 aa  93.6  6e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  22.89 
 
 		 434 aa  93.6  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  26.76 
 
 		 434 aa  93.6  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  23.76 
 
 		 433 aa  93.2  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  28.49 
 
 		 428 aa  93.2  9e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  26.33 
 
 		 435 aa  93.2  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2189  phenylacetate-CoA ligase  25.72 
 
 		 434 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0357047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  27.07 
 
 		 432 aa  92  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  23.92 
 
 		 436 aa  92.4  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  25.89 
 
 		 433 aa  92  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>