More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1955 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  100 
 
 		 453 aa  936    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  42.47 
 
 		 469 aa  360  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1971  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  31.4 
 
 		 453 aa  224  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0676  putative CapK protein  32.28 
 
 		 459 aa  223  7e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0499803  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  33.33 
 
 		 426 aa  219  6e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  32.39 
 
 		 457 aa  211  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  32.57 
 
 		 451 aa  200  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  32.06 
 
 		 448 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  29.29 
 
 		 458 aa  194  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0291  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  30.33 
 
 		 453 aa  188  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.326701  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0295  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  32.02 
 
 		 461 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  28.47 
 
 		 464 aa  183  7e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  25.28 
 
 		 446 aa  182  9.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  29.02 
 
 		 450 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  27.4 
 
 		 480 aa  180  4.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0614  CapK related-protein  31.09 
 
 		 445 aa  180  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.973847  normal  0.145617 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  28.04 
 
 		 439 aa  177  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  29.95 
 
 		 437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2310  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.87 
 
 		 475 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1950  capK related-protein  30.3 
 
 		 446 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3567  CapK related-protein  28.87 
 
 		 502 aa  172  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2007  CapK related-protein  29.48 
 
 		 487 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1800  putative polysaccharide biosynthesis protein  28.5 
 
 		 448 aa  167  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3795  CapK protein, putative  27.29 
 
 		 475 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.217638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2316  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.54 
 
 		 450 aa  160  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2526  Coenzyme F390 synthetase-like protein  27.67 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142234 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.33 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1793  putative CapK protein  27.27 
 
 		 441 aa  143  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1200  hypothetical protein  29.33 
 
 		 448 aa  141  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0277555  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2647  coenzyme F390 synthetase-like  28.76 
 
 		 467 aa  139  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1535  CapK protein, putative  27.64 
 
 		 461 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0582  hypothetical protein  27.25 
 
 		 479 aa  137  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.661178  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3332  coenzyme F390 synthetase-like  26.99 
 
 		 416 aa  133  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.422547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0387  Coenzyme F390 synthetase-like protein  27.54 
 
 		 466 aa  131  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.602394  normal  0.432377 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0875  Coenzyme F390 synthetase-like protein  26.02 
 
 		 563 aa  131  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13008  possible CapK protein  24.88 
 
 		 463 aa  130  6e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0922559  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2299  hypothetical protein  25.23 
 
 		 448 aa  125  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0449  putative capK protein  25.83 
 
 		 446 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1040  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.19 
 
 		 436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1074  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.15 
 
 		 461 aa  118  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.733782  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0662  Coenzyme F390 synthetase-like protein  27.3 
 
 		 425 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  26.39 
 
 		 433 aa  114  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  27.62 
 
 		 432 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1029  Phenylacetate--CoA ligase  27.01 
 
 		 429 aa  111  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  27.39 
 
 		 433 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1703  coenzyme F390 synthetase  24.2 
 
 		 472 aa  109  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  26.74 
 
 		 432 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  26.7 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  28.41 
 
 		 438 aa  108  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  26.1 
 
 		 434 aa  108  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0441  capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.63 
 
 		 468 aa  106  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356155  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2997  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.9 
 
 		 468 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  26.87 
 
 		 427 aa  103  5e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1943  hypothetical protein  21.97 
 
 		 460 aa  103  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0409  Phenylacetate--CoA ligase  25.65 
 
 		 447 aa  103  8e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0103532 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  26.34 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3044  hypothetical protein  24.52 
 
 		 573 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.584506  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02970  possible capK protein  23.33 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240993  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  25.11 
 
 		 434 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0477  phenylacetate-CoA ligase  27.54 
 
 		 427 aa  101  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  27.19 
 
 		 443 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  24.53 
 
 		 433 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1615  Coenzyme F390 synthetase-like protein  28.49 
 
 		 461 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2883  phenylacetate-CoA ligase  28.45 
 
 		 427 aa  101  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2897  Phenylacetate--CoA ligase  27.38 
 
 		 428 aa  100  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2792  phenylacetate--CoA ligase  26.2 
 
 		 440 aa  100  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08400  coenzyme F390 synthetase  24.93 
 
 		 447 aa  100  7e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0324519  normal  0.311069 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  26.03 
 
 		 435 aa  99.8  8e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  26.03 
 
 		 433 aa  99.8  8e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  25.64 
 
 		 432 aa  99.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  25.12 
 
 		 428 aa  99  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  27.02 
 
 		 444 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  26.01 
 
 		 432 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  32.86 
 
 		 432 aa  98.6  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  26.05 
 
 		 442 aa  97.8  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  26.3 
 
 		 433 aa  97.4  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3212  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.68 
 
 		 460 aa  97.1  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  25.62 
 
 		 432 aa  97.1  7e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  25.06 
 
 		 414 aa  96.3  9e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  25.45 
 
 		 435 aa  95.9  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  25.81 
 
 		 446 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  28.12 
 
 		 434 aa  95.5  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  25.24 
 
 		 436 aa  95.5  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  23.62 
 
 		 433 aa  95.5  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  25.55 
 
 		 414 aa  95.5  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  26.73 
 
 		 444 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  27.45 
 
 		 433 aa  95.5  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  25.69 
 
 		 433 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  25.3 
 
 		 414 aa  95.5  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1845  phenylacetate-CoA ligase  27.51 
 
 		 440 aa  94.7  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5526  phenylacetate-CoA ligase  28.02 
 
 		 449 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0759485  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1515  phenylacetate-CoA ligase  27.16 
 
 		 438 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0837149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  26.01 
 
 		 432 aa  94.4  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2752  phenylacetate-CoA ligase  27.76 
 
 		 434 aa  94  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0185722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  27.04 
 
 		 434 aa  94  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  24.87 
 
 		 415 aa  94  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  25.59 
 
 		 433 aa  93.6  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  25.59 
 
 		 433 aa  93.6  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  26.09 
 
 		 434 aa  93.2  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  26.7 
 
 		 444 aa  93.2  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>