More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1703 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1703  coenzyme F390 synthetase  100 
 
 		 472 aa  979    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0076  coenzyme F390 synthetase  36.16 
 
 		 442 aa  301  2e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.743579  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0875  Coenzyme F390 synthetase-like protein  29 
 
 		 563 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2997  coenzyme F390 synthetase-like protein  31.27 
 
 		 468 aa  189  8e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3212  coenzyme F390 synthetase-like protein  30.17 
 
 		 460 aa  162  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1074  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.93 
 
 		 461 aa  161  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.733782  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2239  coenzyme F390 synthetase-like  31.59 
 
 		 466 aa  160  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0016  coenzyme F390 synthetase-like protein  31.65 
 
 		 480 aa  155  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4216  coenzyme F390 synthetase-like  27.46 
 
 		 456 aa  155  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4394  coenzyme F390 synthetase-like protein  33.59 
 
 		 268 aa  139  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1919  hypothetical protein  29.08 
 
 		 493 aa  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1908  hypothetical protein  28.84 
 
 		 493 aa  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4480  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.99 
 
 		 454 aa  136  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4311  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.99 
 
 		 454 aa  136  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0828925  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4211  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.99 
 
 		 454 aa  136  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.494942  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  27.31 
 
 		 426 aa  132  9e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.18 
 
 		 464 aa  120  6e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6630  hypothetical protein  28.61 
 
 		 462 aa  116  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.997054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  25.98 
 
 		 457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0672  putative adenylate-forming enzyme  28.45 
 
 		 426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.393226  normal  0.19612 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2310  coenzyme F390 synthetase-like protein  23.42 
 
 		 475 aa  110  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3245  hypothetical protein  26.89 
 
 		 445 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3014  hypothetical protein  27.76 
 
 		 445 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2999  coenzyme F390 synthetase  26.75 
 
 		 445 aa  109  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0176304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2936  hypothetical protein  26.75 
 
 		 445 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3246  hypothetical protein  27.76 
 
 		 445 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2955  putative adenylate-forming enzyme  26.12 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0260622  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1598  hypothetical protein  28.36 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2316  coenzyme F390 synthetase-like protein  22.56 
 
 		 450 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  25.31 
 
 		 450 aa  100  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  26.63 
 
 		 433 aa  99.8  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  24.79 
 
 		 432 aa  98.2  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  20.74 
 
 		 480 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0374  putative adenylate-forming enzyme  26.12 
 
 		 433 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  24.86 
 
 		 453 aa  97.8  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  24.58 
 
 		 435 aa  98.2  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  24.58 
 
 		 433 aa  97.8  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  26 
 
 		 434 aa  97.4  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  22.3 
 
 		 469 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  26.15 
 
 		 432 aa  95.9  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  24.5 
 
 		 432 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  24.29 
 
 		 433 aa  95.5  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  24.08 
 
 		 432 aa  94  6e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  24.58 
 
 		 433 aa  93.6  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  24.67 
 
 		 441 aa  93.6  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  24.79 
 
 		 432 aa  93.6  7e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  22.98 
 
 		 432 aa  93.2  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1200  hypothetical protein  27.39 
 
 		 448 aa  93.2  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0277555  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1971  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  24.12 
 
 		 453 aa  92.8  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  24.45 
 
 		 441 aa  93.2  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  24.58 
 
 		 434 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1959  coenzyme F390 synthetase-like  28.15 
 
 		 239 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  23.51 
 
 		 432 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  24 
 
 		 451 aa  92  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  24.5 
 
 		 435 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  26.67 
 
 		 441 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  24.24 
 
 		 439 aa  92.4  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.26 
 
 		 454 aa  91.3  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  26.07 
 
 		 433 aa  91.7  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3795  CapK protein, putative  26.84 
 
 		 475 aa  91.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.217638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0614  CapK related-protein  23.59 
 
 		 445 aa  90.9  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.973847  normal  0.145617 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  23.93 
 
 		 435 aa  91.3  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0449  putative capK protein  23.3 
 
 		 446 aa  91.3  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  23.8 
 
 		 432 aa  90.5  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  24.79 
 
 		 434 aa  90.5  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2214  adenylate-forming enzyme  23.45 
 
 		 428 aa  90.5  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.362513  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2503  hypothetical protein  23.16 
 
 		 428 aa  90.1  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239215 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  24.36 
 
 		 439 aa  89.7  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  24.65 
 
 		 434 aa  89.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  25.07 
 
 		 437 aa  89.4  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  27 
 
 		 438 aa  89.7  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  24.29 
 
 		 433 aa  89.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  25.56 
 
 		 433 aa  89.7  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2104  hypothetical protein  23.16 
 
 		 428 aa  89.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1950  capK related-protein  23.2 
 
 		 446 aa  89  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  25.42 
 
 		 435 aa  88.6  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0676  putative CapK protein  24.91 
 
 		 459 aa  87.8  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0499803  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  24.37 
 
 		 434 aa  88.2  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  24.72 
 
 		 434 aa  88.2  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  25.07 
 
 		 434 aa  88.2  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2408  Phenylacetate--CoA ligase  25.86 
 
 		 429 aa  87.8  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0464701 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3332  coenzyme F390 synthetase-like  29.41 
 
 		 416 aa  87.8  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.422547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  22.95 
 
 		 446 aa  87.4  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  25.07 
 
 		 434 aa  87  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  24.01 
 
 		 432 aa  86.7  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  24.08 
 
 		 433 aa  86.7  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  23.63 
 
 		 423 aa  86.7  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  24.72 
 
 		 434 aa  86.7  9e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3567  CapK related-protein  23.6 
 
 		 502 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  23.43 
 
 		 442 aa  86.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03810  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.07 
 
 		 429 aa  85.9  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  24.79 
 
 		 434 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4139  adenylate-forming enzyme  24.14 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  23.29 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  24.93 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  23.29 
 
 		 433 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  25.28 
 
 		 433 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  25.82 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  24.58 
 
 		 427 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  24.79 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>