More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0875 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0875  Coenzyme F390 synthetase-like protein  100 
 
 
563 aa  1150    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1074  coenzyme F390 synthetase-like protein  29.31 
 
 
461 aa  203  6e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.733782  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1703  coenzyme F390 synthetase  29 
 
 
472 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2997  coenzyme F390 synthetase-like protein  33.33 
 
 
468 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3212  coenzyme F390 synthetase-like protein  33.42 
 
 
460 aa  199  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4216  coenzyme F390 synthetase-like  29.57 
 
 
456 aa  194  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2239  coenzyme F390 synthetase-like  31.55 
 
 
466 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0016  coenzyme F390 synthetase-like protein  30 
 
 
480 aa  171  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110032  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4480  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.67 
 
 
454 aa  163  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4311  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.67 
 
 
454 aa  163  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0828925  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4211  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.67 
 
 
454 aa  163  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.494942  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0076  coenzyme F390 synthetase  27.68 
 
 
442 aa  147  7.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.743579  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4394  coenzyme F390 synthetase-like protein  37.5 
 
 
268 aa  146  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2310  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.65 
 
 
475 aa  144  6e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  25.49 
 
 
426 aa  140  6e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0614  CapK related-protein  25.22 
 
 
445 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.973847  normal  0.145617 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1919  hypothetical protein  26.65 
 
 
493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1908  hypothetical protein  26.65 
 
 
493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2955  putative adenylate-forming enzyme  29.82 
 
 
445 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0260622  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2316  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.32 
 
 
450 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2936  hypothetical protein  29.24 
 
 
445 aa  127  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3245  hypothetical protein  29.24 
 
 
445 aa  126  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3014  hypothetical protein  29.24 
 
 
445 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2999  coenzyme F390 synthetase  29.24 
 
 
445 aa  126  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0176304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3246  hypothetical protein  29.24 
 
 
445 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  23.54 
 
 
464 aa  125  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  27.18 
 
 
469 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1971  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  21.01 
 
 
453 aa  121  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  31.77 
 
 
453 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  23.94 
 
 
480 aa  116  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  33.64 
 
 
446 aa  113  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6630  hypothetical protein  27.25 
 
 
462 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.997054  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2007  CapK related-protein  27.92 
 
 
487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  21.95 
 
 
457 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2526  Coenzyme F390 synthetase-like protein  28.29 
 
 
437 aa  110  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142234 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1535  CapK protein, putative  25.96 
 
 
461 aa  110  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3795  CapK protein, putative  30 
 
 
475 aa  110  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.217638  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13008  possible CapK protein  25.99 
 
 
463 aa  109  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0922559  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  26.16 
 
 
458 aa  109  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  26.64 
 
 
451 aa  108  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  22.1 
 
 
448 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1959  coenzyme F390 synthetase-like  27.75 
 
 
239 aa  104  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872302  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0374  putative adenylate-forming enzyme  26.45 
 
 
433 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.28 
 
 
454 aa  101  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  26.34 
 
 
427 aa  100  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0449  putative capK protein  24.49 
 
 
446 aa  99  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  25.38 
 
 
446 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  23.62 
 
 
437 aa  98.6  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2299  hypothetical protein  22.11 
 
 
448 aa  98.6  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  20.09 
 
 
450 aa  97.8  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  26.22 
 
 
414 aa  97.8  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  25.25 
 
 
432 aa  97.1  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1800  putative polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 
448 aa  96.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  25.5 
 
 
433 aa  96.7  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  24.37 
 
 
432 aa  96.7  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  25.47 
 
 
414 aa  95.5  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  25.75 
 
 
414 aa  93.2  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  24.75 
 
 
434 aa  93.2  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3567  CapK related-protein  22.72 
 
 
502 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  25.57 
 
 
423 aa  92  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1200  hypothetical protein  34.13 
 
 
448 aa  91.7  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0277555  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0291  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  28.85 
 
 
453 aa  90.5  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.326701  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  25.52 
 
 
434 aa  90.5  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  38.6 
 
 
428 aa  89.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3110  adenylate-forming enzyme  24.3 
 
 
430 aa  89  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00628752  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4139  adenylate-forming enzyme  25.15 
 
 
428 aa  89.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  25.3 
 
 
433 aa  89  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0676  putative CapK protein  23.1 
 
 
459 aa  89  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0499803  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  32.27 
 
 
415 aa  89  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0582  hypothetical protein  24.24 
 
 
479 aa  87.8  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.661178  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  25.37 
 
 
434 aa  87.8  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  24.7 
 
 
433 aa  87.8  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  26.39 
 
 
428 aa  87.8  5e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  23.26 
 
 
432 aa  87.4  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  24.11 
 
 
444 aa  86.7  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1800  coenzyme F390 synthetase-like  24.86 
 
 
450 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0238175  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  26.35 
 
 
433 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1950  capK related-protein  23.48 
 
 
446 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  26.54 
 
 
412 aa  85.9  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  25.07 
 
 
434 aa  85.9  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  24.18 
 
 
444 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  25.25 
 
 
438 aa  85.5  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  24.37 
 
 
444 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3332  coenzyme F390 synthetase-like  26.74 
 
 
416 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.422547  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  24.29 
 
 
439 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  29.3 
 
 
443 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  23.88 
 
 
427 aa  84.7  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  26.15 
 
 
413 aa  84.7  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0169  phenylacetate--CoA ligase  23.12 
 
 
433 aa  84.3  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  24.12 
 
 
435 aa  84  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  27.31 
 
 
441 aa  84  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  28.65 
 
 
441 aa  83.6  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  23.59 
 
 
458 aa  84  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  28.65 
 
 
441 aa  84  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  28.65 
 
 
441 aa  83.6  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  23.4 
 
 
415 aa  83.2  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4420  adenylate-forming enzyme  24.34 
 
 
428 aa  83.2  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0824  phenylacetate--CoA ligase  35.58 
 
 
429 aa  83.2  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1829  phenylacetate-CoA ligase  27.53 
 
 
444 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.914606  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  21.76 
 
 
436 aa  83.2  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>