More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0374 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0374  putative adenylate-forming enzyme  100 
 
 
433 aa  888    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2936  hypothetical protein  42.62 
 
 
445 aa  300  3e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2999  coenzyme F390 synthetase  42.62 
 
 
445 aa  300  4e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0176304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3245  hypothetical protein  42.62 
 
 
445 aa  299  7e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3014  hypothetical protein  42.35 
 
 
445 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3246  hypothetical protein  42.35 
 
 
445 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2955  putative adenylate-forming enzyme  42.51 
 
 
445 aa  295  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0260622  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3110  adenylate-forming enzyme  32.38 
 
 
430 aa  266  5e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00628752  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1598  hypothetical protein  42.18 
 
 
424 aa  248  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2866  putative adenylate-forming enzyme  35.96 
 
 
427 aa  245  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.879124 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4139  adenylate-forming enzyme  36.66 
 
 
428 aa  244  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2214  adenylate-forming enzyme  37.38 
 
 
428 aa  244  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.362513  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2503  hypothetical protein  37.15 
 
 
428 aa  243  6e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000239215 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2104  hypothetical protein  37.15 
 
 
428 aa  242  9e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4420  adenylate-forming enzyme  37 
 
 
428 aa  237  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0672  putative adenylate-forming enzyme  34.98 
 
 
426 aa  229  7e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.393226  normal  0.19612 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002732  coenzyme F390 synthetase  36.59 
 
 
419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4216  coenzyme F390 synthetase-like  27.25 
 
 
456 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0875  Coenzyme F390 synthetase-like protein  26.45 
 
 
563 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2997  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.3 
 
 
468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0016  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.92 
 
 
480 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110032  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3212  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.27 
 
 
460 aa  109  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4480  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.55 
 
 
454 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4311  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.55 
 
 
454 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0828925  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4211  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.55 
 
 
454 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.494942  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1074  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.41 
 
 
461 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.733782  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1703  coenzyme F390 synthetase  25.65 
 
 
472 aa  100  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2239  coenzyme F390 synthetase-like  25.19 
 
 
466 aa  95.5  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6630  hypothetical protein  29.58 
 
 
462 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.997054  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1793  putative CapK protein  28.51 
 
 
441 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1919  hypothetical protein  24.94 
 
 
493 aa  83.2  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1908  hypothetical protein  24.94 
 
 
493 aa  82.4  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2429  capK domain protein  29.61 
 
 
476 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00799946  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4394  coenzyme F390 synthetase-like protein  32.77 
 
 
268 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 
446 aa  79.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  23.16 
 
 
454 aa  78.2  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0076  coenzyme F390 synthetase  23.12 
 
 
442 aa  76.3  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.743579  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  24.06 
 
 
435 aa  75.1  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  23.92 
 
 
434 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  21.77 
 
 
434 aa  74.7  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  24.64 
 
 
433 aa  74.3  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  24.85 
 
 
434 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0449  putative capK protein  23.53 
 
 
446 aa  73.9  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0387  Coenzyme F390 synthetase-like protein  27.97 
 
 
466 aa  73.9  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.602394  normal  0.432377 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  28.42 
 
 
428 aa  73.6  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  24.2 
 
 
413 aa  73.6  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  23.85 
 
 
435 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  23.18 
 
 
433 aa  72.4  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3367  phenylacetate-CoA ligase  22.66 
 
 
443 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322757  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  22.3 
 
 
436 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  25.31 
 
 
412 aa  70.9  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  25.22 
 
 
433 aa  70.9  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  19.85 
 
 
433 aa  70.1  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  25.12 
 
 
413 aa  69.7  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  21.77 
 
 
433 aa  69.7  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  22.4 
 
 
439 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  24.88 
 
 
435 aa  69.7  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  25.4 
 
 
448 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  20.72 
 
 
432 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  24.07 
 
 
433 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  23.15 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  28.76 
 
 
445 aa  68.2  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  22.52 
 
 
439 aa  68.2  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  21.73 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0133  Phenylacetate--CoA ligase  21.93 
 
 
436 aa  67.8  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0426675  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  23.19 
 
 
438 aa  68.2  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0901  phenylacetate-CoA ligase  22.43 
 
 
445 aa  67.8  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  22.69 
 
 
433 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  22.34 
 
 
439 aa  67.4  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13008  possible CapK protein  20.93 
 
 
463 aa  66.6  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0922559  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1923  phenylacetate-CoA ligase  22.56 
 
 
443 aa  66.6  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0702505  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  23.5 
 
 
443 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1971  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  24.18 
 
 
453 aa  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2408  Phenylacetate--CoA ligase  23.77 
 
 
429 aa  65.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0464701 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  21.46 
 
 
427 aa  66.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  25.62 
 
 
442 aa  66.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1615  Coenzyme F390 synthetase-like protein  24.55 
 
 
461 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  27.18 
 
 
437 aa  65.5  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0042  Phenylacetate--CoA ligase  25.55 
 
 
441 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1652  coenzyme F390 synthetase-like  27.89 
 
 
361 aa  65.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  21.5 
 
 
480 aa  65.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  24.72 
 
 
412 aa  65.5  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  20.93 
 
 
434 aa  65.1  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  21.13 
 
 
433 aa  65.1  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1829  phenylacetate-CoA ligase  22.52 
 
 
444 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.914606  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  21.39 
 
 
433 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  20.88 
 
 
437 aa  64.7  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  28.23 
 
 
469 aa  65.1  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  25.38 
 
 
430 aa  65.1  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08400  coenzyme F390 synthetase  25.73 
 
 
447 aa  64.7  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0324519  normal  0.311069 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5526  phenylacetate-CoA ligase  22.81 
 
 
449 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0759485  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  23.18 
 
 
433 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  23.39 
 
 
432 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  23.03 
 
 
415 aa  63.5  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  27.27 
 
 
432 aa  63.9  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  22.06 
 
 
434 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0038  phenylacetate-CoA ligase  25.55 
 
 
441 aa  63.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.455543  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  26.13 
 
 
446 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  22.94 
 
 
434 aa  63.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  24.23 
 
 
428 aa  62.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>