201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4311 on replicon NC_008538
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008537  Arth_4480  coenzyme F390 synthetase-like protein  100 
 
 
454 aa  917    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4311  coenzyme F390 synthetase-like protein  100 
 
 
454 aa  917    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0828925  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4211  coenzyme F390 synthetase-like protein  100 
 
 
454 aa  917    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.494942  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4216  coenzyme F390 synthetase-like  54.2 
 
 
456 aa  480  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1074  coenzyme F390 synthetase-like protein  41.2 
 
 
461 aa  318  1e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.733782  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0016  coenzyme F390 synthetase-like protein  37.61 
 
 
480 aa  246  8e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110032  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2239  coenzyme F390 synthetase-like  35.94 
 
 
466 aa  246  9e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3212  coenzyme F390 synthetase-like protein  37.84 
 
 
460 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4394  coenzyme F390 synthetase-like protein  42.08 
 
 
268 aa  193  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1959  coenzyme F390 synthetase-like  47.84 
 
 
239 aa  192  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872302  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0875  Coenzyme F390 synthetase-like protein  28.93 
 
 
563 aa  184  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2997  coenzyme F390 synthetase-like protein  31.93 
 
 
468 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1703  coenzyme F390 synthetase  27.99 
 
 
472 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4395  hypothetical protein  46.48 
 
 
198 aa  126  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0374  putative adenylate-forming enzyme  26.98 
 
 
433 aa  119  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0076  coenzyme F390 synthetase  23.52 
 
 
442 aa  119  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.743579  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3014  hypothetical protein  25.67 
 
 
445 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2999  coenzyme F390 synthetase  25.72 
 
 
445 aa  113  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0176304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3246  hypothetical protein  25.67 
 
 
445 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3245  hypothetical protein  25.67 
 
 
445 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2955  putative adenylate-forming enzyme  25.3 
 
 
445 aa  113  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0260622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2936  hypothetical protein  25.43 
 
 
445 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6630  hypothetical protein  29.33 
 
 
462 aa  100  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.997054  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1919  hypothetical protein  24.47 
 
 
493 aa  99.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1908  hypothetical protein  24.47 
 
 
493 aa  99  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  28.15 
 
 
450 aa  98.2  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002732  coenzyme F390 synthetase  25.98 
 
 
419 aa  95.1  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4139  adenylate-forming enzyme  27.89 
 
 
428 aa  92.8  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1971  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  25 
 
 
453 aa  90.5  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4420  adenylate-forming enzyme  27 
 
 
428 aa  89  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3110  adenylate-forming enzyme  23.53 
 
 
430 aa  88.6  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00628752  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.68 
 
 
446 aa  87.4  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  32.73 
 
 
469 aa  87  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  23.54 
 
 
457 aa  86.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0672  putative adenylate-forming enzyme  27.66 
 
 
426 aa  85.5  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.393226  normal  0.19612 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  23.66 
 
 
464 aa  84  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  22.42 
 
 
451 aa  83.6  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2214  adenylate-forming enzyme  25.59 
 
 
428 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.362513  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  21.67 
 
 
454 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2104  hypothetical protein  25.78 
 
 
428 aa  80.1  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1075  phenylacetate--CoA ligase  25.81 
 
 
429 aa  79.7  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2316  coenzyme F390 synthetase-like protein  23.74 
 
 
450 aa  79.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3795  CapK protein, putative  26.54 
 
 
475 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.217638  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2503  hypothetical protein  25.29 
 
 
428 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000239215 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2866  putative adenylate-forming enzyme  26.63 
 
 
427 aa  78.2  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.879124 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  23.64 
 
 
439 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.9 
 
 
436 aa  77  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0582  hypothetical protein  27.62 
 
 
479 aa  77  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.661178  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  25.84 
 
 
448 aa  76.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  24.55 
 
 
458 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5790  phenylacetate--CoA ligase  25 
 
 
416 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2310  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.37 
 
 
475 aa  74.7  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  26.05 
 
 
453 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03810  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.32 
 
 
429 aa  74.3  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1598  hypothetical protein  26.94 
 
 
424 aa  73.2  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  27.44 
 
 
430 aa  72.4  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13008  possible CapK protein  21.17 
 
 
463 aa  72.8  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0922559  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1535  CapK protein, putative  27.98 
 
 
461 aa  72.4  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  25.12 
 
 
480 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3332  coenzyme F390 synthetase-like  24.3 
 
 
416 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.422547  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0676  putative CapK protein  26.99 
 
 
459 aa  70.9  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0499803  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1950  capK related-protein  25.06 
 
 
446 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0291  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  26.74 
 
 
453 aa  69.7  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.326701  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1877  coenzyme F390 synthetase-like protein  23.6 
 
 
429 aa  67  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1943  hypothetical protein  22.84 
 
 
460 aa  65.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0614  CapK related-protein  26.02 
 
 
445 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.973847  normal  0.145617 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0387  Coenzyme F390 synthetase-like protein  23.6 
 
 
466 aa  65.5  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.602394  normal  0.432377 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  24.7 
 
 
427 aa  65.1  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1200  hypothetical protein  27.5 
 
 
448 aa  64.3  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0277555  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0133  Phenylacetate--CoA ligase  25.21 
 
 
436 aa  63.9  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0426675  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1652  coenzyme F390 synthetase-like  26.47 
 
 
361 aa  63.5  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1132  Phenylacetate--CoA ligase  28.51 
 
 
418 aa  63.5  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  23.02 
 
 
434 aa  62.4  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  24.48 
 
 
428 aa  61.2  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  31.86 
 
 
432 aa  61.6  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2526  Coenzyme F390 synthetase-like protein  19.38 
 
 
437 aa  61.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142234 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  22.57 
 
 
426 aa  61.2  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1800  putative polysaccharide biosynthesis protein  21.56 
 
 
448 aa  61.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2429  capK domain protein  23.66 
 
 
476 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00799946  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2287  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  26.82 
 
 
418 aa  58.9  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.534483  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2016  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.41 
 
 
452 aa  58.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.651292  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  24.87 
 
 
436 aa  58.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  28.68 
 
 
433 aa  58.2  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  29.92 
 
 
433 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  24.74 
 
 
442 aa  57.4  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3545  coenzyme F390 synthetase-like  26.1 
 
 
524 aa  57  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08400  coenzyme F390 synthetase  23.89 
 
 
447 aa  56.6  0.0000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0324519  normal  0.311069 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  27.75 
 
 
435 aa  56.2  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1793  putative CapK protein  25.52 
 
 
441 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  22.11 
 
 
437 aa  56.2  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1040  coenzyme F390 synthetase-like protein  23.84 
 
 
436 aa  56.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  23.59 
 
 
432 aa  56.6  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3567  CapK related-protein  26.14 
 
 
502 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2408  Phenylacetate--CoA ligase  25.3 
 
 
429 aa  54.7  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0464701 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0409  Phenylacetate--CoA ligase  21.93 
 
 
447 aa  54.3  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0103532 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  23.48 
 
 
434 aa  54.7  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  23.84 
 
 
432 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6699  indoleacetate--lysine ligase  33.88 
 
 
411 aa  54.3  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.43537  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0449  putative capK protein  23.3 
 
 
446 aa  54.3  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  22.93 
 
 
433 aa  53.9  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>