138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0672 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0672  putative adenylate-forming enzyme  100 
 
 		 426 aa  856    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.393226  normal  0.19612 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4420  adenylate-forming enzyme  41.88 
 
 		 428 aa  295  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4139  adenylate-forming enzyme  42.2 
 
 		 428 aa  292  7e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2866  putative adenylate-forming enzyme  42.75 
 
 		 427 aa  291  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.879124 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2503  hypothetical protein  40.93 
 
 		 428 aa  290  5.0000000000000004e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239215 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2104  hypothetical protein  40.93 
 
 		 428 aa  289  6e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2214  adenylate-forming enzyme  40.69 
 
 		 428 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.362513  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3245  hypothetical protein  34.97 
 
 		 445 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3014  hypothetical protein  35.35 
 
 		 445 aa  277  3e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2999  coenzyme F390 synthetase  34.97 
 
 		 445 aa  277  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0176304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3246  hypothetical protein  35.35 
 
 		 445 aa  277  3e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2955  putative adenylate-forming enzyme  34.97 
 
 		 445 aa  277  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0260622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2936  hypothetical protein  34.73 
 
 		 445 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1598  hypothetical protein  33.1 
 
 		 424 aa  240  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002732  coenzyme F390 synthetase  35.26 
 
 		 419 aa  223  7e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0374  putative adenylate-forming enzyme  34.98 
 
 		 433 aa  222  9e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3110  adenylate-forming enzyme  33.94 
 
 		 430 aa  221  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00628752  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2997  coenzyme F390 synthetase-like protein  29.77 
 
 		 468 aa  116  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1703  coenzyme F390 synthetase  28.45 
 
 		 472 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4216  coenzyme F390 synthetase-like  27.78 
 
 		 456 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6630  hypothetical protein  29.37 
 
 		 462 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.997054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3212  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.87 
 
 		 460 aa  79  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1074  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.38 
 
 		 461 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.733782  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0016  coenzyme F390 synthetase-like protein  29.03 
 
 		 480 aa  73.9  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4480  coenzyme F390 synthetase-like protein  29.55 
 
 		 454 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4311  coenzyme F390 synthetase-like protein  29.55 
 
 		 454 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0828925  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4211  coenzyme F390 synthetase-like protein  29.55 
 
 		 454 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.494942  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4394  coenzyme F390 synthetase-like protein  30.23 
 
 		 268 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2239  coenzyme F390 synthetase-like  25.61 
 
 		 466 aa  72  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  27.27 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0875  Coenzyme F390 synthetase-like protein  21.93 
 
 		 563 aa  60.5  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  26.24 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1919  hypothetical protein  21.81 
 
 		 493 aa  59.7  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1908  hypothetical protein  21.5 
 
 		 493 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  27.51 
 
 		 450 aa  58.9  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  37.97 
 
 		 432 aa  57  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  35.96 
 
 		 432 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0449  putative capK protein  23.28 
 
 		 446 aa  55.5  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00696  hypothetical protein  30 
 
 		 417 aa  55.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0076  coenzyme F390 synthetase  19.84 
 
 		 442 aa  54.3  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.743579  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1535  CapK protein, putative  24.55 
 
 		 461 aa  54.3  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  28.74 
 
 		 430 aa  53.5  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  26.8 
 
 		 426 aa  53.1  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.21 
 
 		 454 aa  52.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  26.16 
 
 		 433 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  40.3 
 
 		 431 aa  52.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2010  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.12 
 
 		 455 aa  52.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.484811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  30.08 
 
 		 441 aa  51.6  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  24.41 
 
 		 432 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1652  coenzyme F390 synthetase-like  27.07 
 
 		 361 aa  51.2  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13008  possible CapK protein  21.15 
 
 		 463 aa  51.2  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0922559  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  25 
 
 		 433 aa  51.2  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1793  putative CapK protein  25.56 
 
 		 441 aa  50.8  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2408  Phenylacetate--CoA ligase  26.46 
 
 		 429 aa  51.2  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0464701 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  32.52 
 
 		 433 aa  50.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  26.35 
 
 		 435 aa  50.4  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  29.45 
 
 		 439 aa  50.4  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  27.93 
 
 		 469 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  25 
 
 		 433 aa  50.1  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  33.33 
 
 		 432 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  25 
 
 		 433 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 		 448 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  35.56 
 
 		 434 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  23.74 
 
 		 453 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  37.31 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  28.24 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0950  phenylacetate-CoA ligase  23.08 
 
 		 433 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000041107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  41.67 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  30.65 
 
 		 435 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  30 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0582  hypothetical protein  23.49 
 
 		 479 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.661178  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2526  Coenzyme F390 synthetase-like protein  20.9 
 
 		 437 aa  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142234 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  41.67 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  41.67 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  31.2 
 
 		 436 aa  47.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1132  Phenylacetate--CoA ligase  27.21 
 
 		 418 aa  47.8  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  35.82 
 
 		 434 aa  47.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  35.82 
 
 		 434 aa  47.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  35.82 
 
 		 433 aa  47  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  24.19 
 
 		 415 aa  47.4  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  34.94 
 
 		 428 aa  47.4  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  41.67 
 
 		 444 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  28.1 
 
 		 435 aa  47  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  35.82 
 
 		 432 aa  47  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  23.9 
 
 		 432 aa  47  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  31.87 
 
 		 433 aa  47  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  39.58 
 
 		 437 aa  46.6  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  22.32 
 
 		 435 aa  46.6  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  47.62 
 
 		 433 aa  46.6  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  34.33 
 
 		 433 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  41.67 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  34.18 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  41.67 
 
 		 446 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  27.38 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  26.05 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  41.67 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  29.63 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  24.39 
 
 		 434 aa  45.8  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  30.95 
 
 		 433 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  34.33 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>