119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1652 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1652  coenzyme F390 synthetase-like  100 
 
 
361 aa  753    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1793  putative CapK protein  28.15 
 
 
441 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.45 
 
 
454 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1971  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  28.33 
 
 
453 aa  99.8  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0676  putative CapK protein  25.86 
 
 
459 aa  99.4  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0499803  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  25.33 
 
 
457 aa  98.6  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  25.7 
 
 
448 aa  97.4  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0291  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  24.93 
 
 
453 aa  94.7  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.326701  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  25.53 
 
 
450 aa  93.2  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  27.12 
 
 
480 aa  93.2  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  25.6 
 
 
451 aa  92.8  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13008  possible CapK protein  25.08 
 
 
463 aa  89.7  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0922559  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0295  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  26.63 
 
 
461 aa  88.2  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619099  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1040  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.41 
 
 
436 aa  88.6  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  24.41 
 
 
437 aa  86.7  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  24.84 
 
 
439 aa  86.3  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  25.64 
 
 
453 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2316  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.73 
 
 
450 aa  84.3  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3567  CapK related-protein  25.07 
 
 
502 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2647  coenzyme F390 synthetase-like  26.52 
 
 
467 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2310  coenzyme F390 synthetase-like protein  23.99 
 
 
475 aa  77.8  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  23.97 
 
 
464 aa  77  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4139  adenylate-forming enzyme  31.94 
 
 
428 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4420  adenylate-forming enzyme  30.74 
 
 
428 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1074  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.78 
 
 
461 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.733782  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02970  possible capK protein  23.05 
 
 
435 aa  73.6  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240993  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  20.48 
 
 
446 aa  73.2  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1800  putative polysaccharide biosynthesis protein  25.32 
 
 
448 aa  72.4  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2214  adenylate-forming enzyme  29.24 
 
 
428 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.362513  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0441  capsular polysaccharide biosynthesis protein  21.78 
 
 
468 aa  70.1  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356155  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2503  hypothetical protein  28.88 
 
 
428 aa  69.7  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000239215 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  23.38 
 
 
458 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0614  CapK related-protein  26.46 
 
 
445 aa  69.7  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.973847  normal  0.145617 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2156  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.3 
 
 
459 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295514  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2104  hypothetical protein  28.52 
 
 
428 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3212  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.94 
 
 
460 aa  67.8  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2526  Coenzyme F390 synthetase-like protein  23.48 
 
 
437 aa  67  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142234 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0016  coenzyme F390 synthetase-like protein  31.06 
 
 
480 aa  66.2  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110032  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1703  coenzyme F390 synthetase  27.07 
 
 
472 aa  66.2  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3795  CapK protein, putative  23.81 
 
 
475 aa  65.9  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.217638  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3332  coenzyme F390 synthetase-like  23.45 
 
 
416 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.422547  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0662  Coenzyme F390 synthetase-like protein  28.78 
 
 
425 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0387  Coenzyme F390 synthetase-like protein  25.27 
 
 
466 aa  64.3  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.602394  normal  0.432377 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2010  coenzyme F390 synthetase-like protein  29.08 
 
 
455 aa  63.9  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.484811  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6699  indoleacetate--lysine ligase  26.85 
 
 
411 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.43537  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4480  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.47 
 
 
454 aa  63.5  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4311  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.47 
 
 
454 aa  63.5  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0828925  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4211  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.47 
 
 
454 aa  63.5  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.494942  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2866  putative adenylate-forming enzyme  35.04 
 
 
427 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.879124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2429  capK domain protein  30.36 
 
 
476 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00799946  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4394  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.35 
 
 
268 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0374  putative adenylate-forming enzyme  30.28 
 
 
433 aa  59.7  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3014  hypothetical protein  27.06 
 
 
445 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  25.31 
 
 
469 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3246  hypothetical protein  27.06 
 
 
445 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3245  hypothetical protein  27.06 
 
 
445 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2999  coenzyme F390 synthetase  27.06 
 
 
445 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0176304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2936  hypothetical protein  27.06 
 
 
445 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4216  coenzyme F390 synthetase-like  24.06 
 
 
456 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3044  hypothetical protein  33.33 
 
 
573 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.584506  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6630  hypothetical protein  25.68 
 
 
462 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.997054  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4305  CapK domain-containing protein  27.74 
 
 
481 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2016  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.41 
 
 
452 aa  57.4  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.651292  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3613  coenzyme F390 synthetase  30.22 
 
 
436 aa  57  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0420369  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1535  CapK protein, putative  22.69 
 
 
461 aa  57  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1075  phenylacetate--CoA ligase  22.58 
 
 
429 aa  56.2  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0582  hypothetical protein  23 
 
 
479 aa  56.2  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.661178  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0371  indoleacetate-lysine ligase  30.83 
 
 
395 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2955  putative adenylate-forming enzyme  26.47 
 
 
445 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0260622  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0875  Coenzyme F390 synthetase-like protein  25.74 
 
 
563 aa  55.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1943  hypothetical protein  27.22 
 
 
460 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3545  coenzyme F390 synthetase-like  23.15 
 
 
524 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  22.7 
 
 
423 aa  54.3  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0472  putative capK protein  20 
 
 
459 aa  54.3  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000021402  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03810  coenzyme F390 synthetase-like protein  22.04 
 
 
429 aa  53.9  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0449  putative capK protein  23.71 
 
 
446 aa  53.9  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2239  coenzyme F390 synthetase-like  22.73 
 
 
466 aa  53.5  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2458  coenzyme F390 synthetase/phenylacetyl-CoA ligase  27.33 
 
 
451 aa  53.5  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2007  CapK related-protein  27.92 
 
 
487 aa  53.1  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  22.91 
 
 
436 aa  53.1  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0133  Phenylacetate--CoA ligase  21.52 
 
 
436 aa  53.1  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0426675  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1004  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.49 
 
 
442 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1546  coenzyme F390 synthetase-like protein  21.28 
 
 
443 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0672  putative adenylate-forming enzyme  27.07 
 
 
426 aa  51.2  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.393226  normal  0.19612 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1200  hypothetical protein  20.33 
 
 
448 aa  51.2  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0277555  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3655  phenylacetate--CoA ligase  24.72 
 
 
481 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0076  coenzyme F390 synthetase  24.59 
 
 
442 aa  50.4  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.743579  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  24.55 
 
 
438 aa  50.1  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0539  phenylacetate--CoA ligase  28.87 
 
 
477 aa  49.7  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  decreased coverage  0.00138843 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  24.79 
 
 
429 aa  49.7  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  24.37 
 
 
427 aa  49.7  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  23.25 
 
 
435 aa  49.7  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  19.63 
 
 
426 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5019  phenylacetate--CoA ligase  25.39 
 
 
477 aa  49.3  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.173124  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1598  hypothetical protein  23.15 
 
 
424 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2299  hypothetical protein  22.18 
 
 
448 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2614  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.4 
 
 
377 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1754  coenzyme F390 synthetase  20.95 
 
 
451 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4201  coenzyme F390 synthetase-like  23.78 
 
 
457 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282456  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0672  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.52 
 
 
426 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>