More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02970 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_02970  possible capK protein  100 
 
 		 435 aa  893    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240993  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1040  coenzyme F390 synthetase-like protein  57.41 
 
 		 436 aa  527  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1793  putative CapK protein  29.89 
 
 		 441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1535  CapK protein, putative  29.45 
 
 		 461 aa  144  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0676  putative CapK protein  26.57 
 
 		 459 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0499803  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.59 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  24.71 
 
 		 457 aa  119  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  25.18 
 
 		 450 aa  119  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0291  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  26.32 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.326701  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  24.2 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  25.22 
 
 		 448 aa  117  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  25.9 
 
 		 480 aa  116  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1971  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  24.42 
 
 		 453 aa  113  7.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0295  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  26.65 
 
 		 461 aa  108  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619099  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1943  hypothetical protein  24.35 
 
 		 460 aa  104  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  22.92 
 
 		 469 aa  103  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  25.99 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  24.19 
 
 		 453 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3567  CapK related-protein  21.52 
 
 		 502 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  22.49 
 
 		 464 aa  97.4  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  23.71 
 
 		 426 aa  96.3  9e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2526  Coenzyme F390 synthetase-like protein  26.39 
 
 		 437 aa  94.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142234 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0614  CapK related-protein  21.46 
 
 		 445 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.973847  normal  0.145617 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3795  CapK protein, putative  24.61 
 
 		 475 aa  88.2  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.217638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1800  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.5 
 
 		 448 aa  87  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.35 
 
 		 454 aa  85.9  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2310  coenzyme F390 synthetase-like protein  23.7 
 
 		 475 aa  85.5  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0387  Coenzyme F390 synthetase-like protein  26.24 
 
 		 466 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.602394  normal  0.432377 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2316  coenzyme F390 synthetase-like protein  22.43 
 
 		 450 aa  85.1  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0016  coenzyme F390 synthetase-like protein  23.33 
 
 		 480 aa  84.7  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110032  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2429  capK domain protein  27.76 
 
 		 476 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00799946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  23.51 
 
 		 458 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1950  capK related-protein  22.87 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  25.4 
 
 		 434 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2997  coenzyme F390 synthetase-like protein  30.12 
 
 		 468 aa  78.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2299  hypothetical protein  22.74 
 
 		 448 aa  79  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1200  hypothetical protein  24.37 
 
 		 448 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0277555  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  21.65 
 
 		 439 aa  75.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00696  hypothetical protein  25.44 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13008  possible CapK protein  27.51 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0922559  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0582  hypothetical protein  25.11 
 
 		 479 aa  73.2  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.661178  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  28.17 
 
 		 433 aa  72  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2647  coenzyme F390 synthetase-like  22.46 
 
 		 467 aa  70.5  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  26.92 
 
 		 432 aa  70.1  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3212  coenzyme F390 synthetase-like protein  22.75 
 
 		 460 aa  69.7  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  27.37 
 
 		 423 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3332  coenzyme F390 synthetase-like  21.18 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.422547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1652  coenzyme F390 synthetase-like  23.43 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4201  coenzyme F390 synthetase-like  22.19 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0441  capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.56 
 
 		 468 aa  67.8  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356155  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  29.26 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  22.61 
 
 		 433 aa  67  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  22.61 
 
 		 433 aa  67  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1878  coenzyme F390 synthetase  31.46 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0266  putative phenylacetate-CoA ligase  25.63 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  24.65 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  25.4 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000398  coenzyme F390 synthetase  31.82 
 
 		 400 aa  66.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  26.85 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2409  phenylacetate-CoA ligase  22.93 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2322  Phenylacetate--CoA ligase  23.73 
 
 		 449 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4415  coenzyme F390 synthetase-like protein  22.99 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.992937  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  25.63 
 
 		 433 aa  63.9  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1284  AMP-dependent synthetase and ligase  35.96 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1703  coenzyme F390 synthetase  31.1 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1919  hypothetical protein  29.24 
 
 		 493 aa  63.2  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  24.74 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1908  hypothetical protein  29.24 
 
 		 493 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  25.82 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0956  Phenylacetate--CoA ligase  21.75 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  22.45 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  24.29 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3944  phenylacetate-CoA ligase  21.99 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  22.92 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1515  phenylacetate-CoA ligase  26.15 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0837149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6630  hypothetical protein  24.48 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.997054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  26.64 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  26.46 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  25.99 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  22.87 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  24.24 
 
 		 449 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0807  coenzyme F390 synthetase-like protein  22.89 
 
 		 452 aa  59.7  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.316461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  24.41 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  23.83 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  24.1 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1074  coenzyme F390 synthetase-like protein  22.14 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.733782  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1509  phenylacetate-CoA ligase  22.91 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.047551  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  23.73 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  25 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  23.67 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  25 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  25 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4216  coenzyme F390 synthetase-like  24.59 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2617  phenylacetate-CoA ligase  25 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179563  normal  0.174416 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  27.88 
 
 		 413 aa  57  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  24.36 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2239  coenzyme F390 synthetase-like  28.87 
 
 		 466 aa  56.6  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  24.64 
 
 		 432 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  23.56 
 
 		 432 aa  56.6  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  22.05 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>