62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4415 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4415  coenzyme F390 synthetase-like protein  100 
 
 		 480 aa  936    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.992937  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3406  coenzyme F390 synthetase-like protein  64.49 
 
 		 478 aa  500  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684455  normal  0.102946 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0441  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.23 
 
 		 468 aa  159  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356155  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3332  coenzyme F390 synthetase-like  31.47 
 
 		 416 aa  156  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.422547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2316  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.64 
 
 		 450 aa  113  9e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2310  coenzyme F390 synthetase-like protein  29.25 
 
 		 475 aa  103  8e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0449  putative capK protein  28.57 
 
 		 446 aa  97.8  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.19 
 
 		 464 aa  96.7  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2156  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.03 
 
 		 459 aa  87.8  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  28.67 
 
 		 457 aa  85.1  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0472  putative capK protein  22.51 
 
 		 459 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000021402  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13008  possible CapK protein  21.87 
 
 		 463 aa  84.7  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0922559  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.74 
 
 		 446 aa  84.7  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3795  CapK protein, putative  27.99 
 
 		 475 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.217638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  27.58 
 
 		 458 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1950  capK related-protein  30.37 
 
 		 446 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1535  CapK protein, putative  29.14 
 
 		 461 aa  80.1  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2526  Coenzyme F390 synthetase-like protein  21.91 
 
 		 437 aa  77.4  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142234 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3567  CapK related-protein  27.32 
 
 		 502 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0807  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.47 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.316461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  27.37 
 
 		 451 aa  75.5  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1040  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.55 
 
 		 436 aa  75.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0387  Coenzyme F390 synthetase-like protein  25.41 
 
 		 466 aa  71.2  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.602394  normal  0.432377 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  30.08 
 
 		 480 aa  69.7  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  31.27 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  26.68 
 
 		 437 aa  66.6  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  25.45 
 
 		 469 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0614  CapK related-protein  26.3 
 
 		 445 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.973847  normal  0.145617 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02970  possible capK protein  22.99 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240993  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0111  capsular polysacharride biosynthesis gene, putative  24.31 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000821148 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0582  hypothetical protein  40 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.661178  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  25.81 
 
 		 439 aa  59.7  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2007  CapK related-protein  25.78 
 
 		 487 aa  59.3  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1971  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  28.76 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4201  coenzyme F390 synthetase-like  28.86 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00696  hypothetical protein  22.43 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0291  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  29.1 
 
 		 453 aa  55.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.326701  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0295  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  27.88 
 
 		 461 aa  55.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  26.5 
 
 		 450 aa  53.9  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0676  putative CapK protein  26.62 
 
 		 459 aa  53.1  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0499803  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2557  phenylacetate-CoA ligase  32.17 
 
 		 390 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1200  hypothetical protein  30.06 
 
 		 448 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0277555  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  27.95 
 
 		 426 aa  49.7  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2517  AMP-dependent synthetase and ligase  34.15 
 
 		 459 aa  49.3  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.570913  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0875  Coenzyme F390 synthetase-like protein  26.77 
 
 		 563 aa  48.5  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1817  coenzyme F390 synthetase  34.86 
 
 		 465 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342453  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1793  putative CapK protein  22.78 
 
 		 441 aa  47.8  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3212  coenzyme F390 synthetase-like protein  31.43 
 
 		 460 aa  47  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2051  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  27.27 
 
 		 433 aa  47  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.433372  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3634  phenylacetate-CoA ligase  28.76 
 
 		 444 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1923  phenylacetate-CoA ligase  28.14 
 
 		 443 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0702505  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1829  phenylacetate-CoA ligase  27.71 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.914606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3276  coenzyme F390 synthetase-like protein  29.1 
 
 		 417 aa  45.8  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1132  Phenylacetate--CoA ligase  30.71 
 
 		 418 aa  45.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  36.84 
 
 		 432 aa  44.7  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6699  indoleacetate--lysine ligase  28.03 
 
 		 411 aa  44.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.43537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2299  hypothetical protein  22.39 
 
 		 448 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  25.43 
 
 		 433 aa  44.3  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  25.1 
 
 		 429 aa  43.5  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5790  phenylacetate--CoA ligase  31.79 
 
 		 416 aa  43.5  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0838  phenylacetate--CoA ligase  31.06 
 
 		 431 aa  43.5  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  28.5 
 
 		 430 aa  43.5  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>