191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2557 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2557  phenylacetate-CoA ligase  100 
 
 		 390 aa  796    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1925  hypothetical protein  36.59 
 
 		 426 aa  239  4e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.132933  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1926  acyl-CoA reductase  28.27 
 
 		 837 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.318722  normal  0.240378 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2558  hypothetical protein  26.03 
 
 		 816 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  26.41 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  22.66 
 
 		 436 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  23.82 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  25.77 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  25.77 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  25.98 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  25.42 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  25.7 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  26.32 
 
 		 430 aa  62  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3406  coenzyme F390 synthetase-like protein  34.93 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684455  normal  0.102946 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  25.07 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  23.62 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2752  phenylacetate-CoA ligase  26.23 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0185722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  25.49 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  24.86 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  24.46 
 
 		 444 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6699  indoleacetate--lysine ligase  27.16 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.43537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1469  hypothetical protein  24.71 
 
 		 431 aa  59.7  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  28.86 
 
 		 433 aa  59.7  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3276  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.3 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  25.45 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1040  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.04 
 
 		 436 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  21.05 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4201  coenzyme F390 synthetase-like  27.78 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  26.47 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  26.48 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  25.26 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2904  phenylacetate-CoA ligase  26.62 
 
 		 432 aa  57  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  24.46 
 
 		 448 aa  57  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  24.02 
 
 		 438 aa  57  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  24.58 
 
 		 432 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  23.12 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  29.57 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  24.48 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  26.73 
 
 		 433 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3140  hypothetical protein  25.55 
 
 		 447 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  26.11 
 
 		 434 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0440  phenylacetate-CoA ligase  25 
 
 		 436 aa  56.2  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  30.95 
 
 		 458 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  24.86 
 
 		 432 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000398  coenzyme F390 synthetase  30.71 
 
 		 400 aa  56.2  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1814  coenzyme F390 synthetase-like protein  33.1 
 
 		 457 aa  55.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  25.98 
 
 		 433 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3117  phenylacetate-CoA ligase  26.51 
 
 		 434 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0603128  normal  0.0548798 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  23.97 
 
 		 432 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  26.02 
 
 		 415 aa  54.3  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3550  phenylacetate-CoA ligase  26.95 
 
 		 432 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489447  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3577  phenylacetate-CoA ligase  26.95 
 
 		 432 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306139  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  24.24 
 
 		 434 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1303  Phenylacetate--CoA ligase  27.27 
 
 		 437 aa  53.9  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0437  Phenylacetate--CoA ligase  24.02 
 
 		 435 aa  53.9  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288534  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  31.25 
 
 		 434 aa  53.5  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  29.95 
 
 		 428 aa  53.5  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1318  phenylacetate-CoA ligase  31.11 
 
 		 440 aa  53.5  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  21.84 
 
 		 432 aa  53.1  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0539  phenylacetate-coenzyme A ligase  26.95 
 
 		 432 aa  53.1  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0321632  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  35.04 
 
 		 458 aa  53.1  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  27.67 
 
 		 433 aa  53.1  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0638  phenylacetate-CoA ligase  26.95 
 
 		 432 aa  53.1  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100652  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0935  phenylacetate-coenzyme A ligase  26.95 
 
 		 432 aa  53.1  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3212  coenzyme F390 synthetase-like protein  29.09 
 
 		 460 aa  53.1  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1905  phenylacetate-coenzyme A ligase  26.95 
 
 		 432 aa  53.1  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511484  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1315  hypothetical protein  27.38 
 
 		 442 aa  53.1  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  hitchhiker  0.000203578 
 
 
-
 
NC_002950  PG0111  capsular polysacharride biosynthesis gene, putative  29.8 
 
 		 422 aa  52.4  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000821148 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3568  phenylacetate-CoA ligase  26.62 
 
 		 432 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172482  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1800  coenzyme F390 synthetase-like  26.89 
 
 		 450 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0238175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  21.45 
 
 		 437 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3839  phenylacetate-CoA ligase  31.11 
 
 		 440 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4529  phenylacetate-CoA ligase  31.11 
 
 		 440 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652745  normal  0.906833 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5775  phenylacetate-CoA ligase  31.11 
 
 		 440 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2486  phenylacetate-CoA ligase  24.41 
 
 		 450 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1615  Coenzyme F390 synthetase-like protein  26.09 
 
 		 461 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1284  AMP-dependent synthetase and ligase  28.39 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  29.26 
 
 		 430 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  23.75 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  28.27 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0388  phenylacetate-CoA ligase  26.96 
 
 		 427 aa  51.6  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.128203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1004  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.71 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4126  phenylacetate-CoA ligase  31.58 
 
 		 440 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351473  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4074  phenylacetate-CoA ligase  23.14 
 
 		 437 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0441  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.4 
 
 		 468 aa  51.6  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356155  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4422  phenylacetate-CoA ligase  36.84 
 
 		 440 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  29.03 
 
 		 433 aa  50.8  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.85 
 
 		 436 aa  50.8  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  21.41 
 
 		 433 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0371  indoleacetate-lysine ligase  26.6 
 
 		 395 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  22.34 
 
 		 435 aa  50.4  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3959  phenylacetate-CoA ligase  36.84 
 
 		 440 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349382  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  21.41 
 
 		 433 aa  50.4  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  30.09 
 
 		 434 aa  50.4  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3367  phenylacetate-CoA ligase  24.23 
 
 		 443 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322757  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  26.07 
 
 		 433 aa  50.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  29.63 
 
 		 433 aa  50.4  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2322  Phenylacetate--CoA ligase  32.21 
 
 		 449 aa  50.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  22.11 
 
 		 431 aa  50.1  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0169  phenylacetate--CoA ligase  27.74 
 
 		 433 aa  50.4  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>