More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1926 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1926  acyl-CoA reductase  100 
 
 
837 aa  1697    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.318722  normal  0.240378 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2558  hypothetical protein  41.85 
 
 
816 aa  553  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1627  acyl-CoA reductase  31.72 
 
 
415 aa  180  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2557  phenylacetate-CoA ligase  28.27 
 
 
390 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1925  hypothetical protein  28.57 
 
 
426 aa  106  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.132933  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06244  fatty acid reductase  25.47 
 
 
477 aa  102  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0935  Acyl-CoA reductase (LuxC)  24.54 
 
 
488 aa  99.4  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0964  acyl-CoA reductase LuxC  27.69 
 
 
476 aa  96.7  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362003  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  29.93 
 
 
436 aa  95.1  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4529  acyl-CoA reductase  29.92 
 
 
498 aa  92.8  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  22.99 
 
 
433 aa  90.9  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4609  acyl-CoA reductase  27.08 
 
 
435 aa  86.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000498452  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  27.07 
 
 
433 aa  85.9  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  26.03 
 
 
428 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  24.01 
 
 
434 aa  84  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3633  long-chain-fatty-acyl-CoA reductase  24.69 
 
 
479 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.867434  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4516  putative acyl-CoA reductase  27.59 
 
 
499 aa  81.6  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.684609  normal  0.796561 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  25.17 
 
 
413 aa  82  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1744  acyl-CoA reductase  25.08 
 
 
430 aa  81.3  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6699  indoleacetate--lysine ligase  26.36 
 
 
411 aa  81.3  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.43537  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0950  phenylacetate-CoA ligase  25.5 
 
 
433 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000041107  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4479  acyl-CoA reductase  25.84 
 
 
484 aa  79.7  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.222988  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  26.97 
 
 
458 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3113  acyl protein synthase/acyl-CoA reductase RfbN  23.26 
 
 
429 aa  79.7  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  26.06 
 
 
412 aa  79  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3504  putative phenylacetate-CoA ligase  26.33 
 
 
413 aa  79  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2631  acyl protein synthase/acyl-CoA reductase RfbN  23.28 
 
 
825 aa  79  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  23.65 
 
 
433 aa  76.6  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  24.65 
 
 
433 aa  76.3  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0540  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  27.46 
 
 
421 aa  75.9  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000138329  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  25.47 
 
 
413 aa  75.5  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1613  Phenylacetate--CoA ligase  24.67 
 
 
445 aa  75.5  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297864  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  25.51 
 
 
445 aa  75.5  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  25.92 
 
 
442 aa  75.5  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2051  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  24.56 
 
 
433 aa  75.1  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.433372  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  28.13 
 
 
432 aa  74.3  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2287  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  29.11 
 
 
418 aa  73.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.534483  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2446  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  27.46 
 
 
421 aa  74.3  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  24.34 
 
 
412 aa  73.9  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  25.15 
 
 
430 aa  73.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  26.48 
 
 
433 aa  72.8  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  24.29 
 
 
439 aa  73.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  24.67 
 
 
447 aa  72.8  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  23.66 
 
 
433 aa  73.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  25.43 
 
 
432 aa  72.4  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3347  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  27.66 
 
 
421 aa  71.6  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  23.74 
 
 
429 aa  71.6  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  24.23 
 
 
433 aa  71.6  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0460  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  28.01 
 
 
421 aa  71.6  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  24.84 
 
 
427 aa  71.2  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  25.28 
 
 
434 aa  71.2  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  23.81 
 
 
415 aa  71.2  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  24.09 
 
 
431 aa  71.2  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  25.21 
 
 
435 aa  70.9  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  23.94 
 
 
433 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  24.09 
 
 
435 aa  70.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2408  Phenylacetate--CoA ligase  23.89 
 
 
429 aa  70.9  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0464701 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  24.79 
 
 
429 aa  70.5  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3434  coenzyme F390 synthetase-like protein  29.24 
 
 
467 aa  70.1  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0824  phenylacetate--CoA ligase  28.19 
 
 
429 aa  70.1  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_811  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  28.63 
 
 
429 aa  69.7  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  24.86 
 
 
438 aa  69.7  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0136  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  26.41 
 
 
421 aa  69.7  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0413194 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3156  acyl protein synthase/acyl-CoA reductase RfbN  24.26 
 
 
431 aa  69.3  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  27.76 
 
 
434 aa  69.3  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  23.86 
 
 
438 aa  68.9  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0016  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.64 
 
 
480 aa  68.9  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110032  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  24.75 
 
 
441 aa  68.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0379  phenylacetate--CoA ligase  27.42 
 
 
432 aa  68.6  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  23.8 
 
 
423 aa  68.2  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  23.71 
 
 
444 aa  68.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2311  putative phenylacetate-CoA ligase  25.89 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00962069 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1515  phenylacetate-CoA ligase  24.27 
 
 
438 aa  68.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0837149  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1074  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.18 
 
 
461 aa  68.2  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.733782  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  24.56 
 
 
441 aa  67  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3441  putative phenylacetate-CoA ligase  25.98 
 
 
420 aa  67  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362161 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3457  phenylacetate-CoA ligase  24.52 
 
 
433 aa  67.4  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  24.44 
 
 
435 aa  67  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2152  Phenylacetate--CoA ligase  25.58 
 
 
446 aa  67.4  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65736  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  24.56 
 
 
441 aa  67  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0582  hypothetical protein  27.14 
 
 
479 aa  67.4  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.661178  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  25.19 
 
 
441 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  24.72 
 
 
434 aa  67  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4697  long-chain-fatty-acyl-CoA reductase  23.94 
 
 
480 aa  66.6  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5019  phenylacetate--CoA ligase  23.21 
 
 
477 aa  66.6  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.173124  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  31.61 
 
 
450 aa  66.6  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  22.44 
 
 
434 aa  66.2  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2792  phenylacetate--CoA ligase  26.27 
 
 
440 aa  66.6  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  22.5 
 
 
435 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1800  coenzyme F390 synthetase-like  27.87 
 
 
450 aa  65.9  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0238175  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2299  hypothetical protein  29.45 
 
 
448 aa  66.2  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  24.32 
 
 
415 aa  65.9  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0838  phenylacetate--CoA ligase  25.34 
 
 
431 aa  65.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0319  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  24.65 
 
 
421 aa  65.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000219032  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3655  phenylacetate--CoA ligase  25 
 
 
481 aa  65.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  24.01 
 
 
434 aa  65.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  23.53 
 
 
432 aa  65.5  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  26 
 
 
443 aa  65.5  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  22.25 
 
 
430 aa  65.1  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0563  putative phenylacetate-CoA ligase  26.11 
 
 
418 aa  65.1  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0311753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>