More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1925 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1925  hypothetical protein  100 
 
 		 426 aa  869    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.132933  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2557  phenylacetate-CoA ligase  36.59 
 
 		 390 aa  239  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2558  hypothetical protein  28.97 
 
 		 816 aa  106  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1926  acyl-CoA reductase  28.34 
 
 		 837 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.318722  normal  0.240378 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1592  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  26.42 
 
 		 397 aa  93.2  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  24.32 
 
 		 432 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  24.71 
 
 		 434 aa  86.7  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  23.61 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  25.28 
 
 		 432 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6699  indoleacetate--lysine ligase  27.1 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.43537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  23.76 
 
 		 434 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  23.46 
 
 		 438 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  23.84 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  24.88 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  24.25 
 
 		 433 aa  83.2  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  25.33 
 
 		 430 aa  82.8  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3536  putative phenylacetate-CoA ligase  27.48 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.756955  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0437  Phenylacetate--CoA ligase  24.25 
 
 		 435 aa  80.5  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288534  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  25.52 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3247  phenylacetate-CoA ligase  24.72 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  22.99 
 
 		 433 aa  77  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  22.38 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2310  Phenylacetate--CoA ligase  22.52 
 
 		 425 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3048  phenylacetate-CoA ligase  25.06 
 
 		 456 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0388  phenylacetate-CoA ligase  26.85 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.128203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  24.36 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1615  Coenzyme F390 synthetase-like protein  28.75 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1878  coenzyme F390 synthetase  26.58 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  25.23 
 
 		 439 aa  73.6  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2115  coenzyme F390 synthetase  24.02 
 
 		 447 aa  73.6  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  23.53 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  25.68 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  24.37 
 
 		 445 aa  72.8  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2408  Phenylacetate--CoA ligase  25.8 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0464701 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  23.19 
 
 		 434 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  24.86 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  22.79 
 
 		 432 aa  72  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20330  phenylacetate-CoA ligase  24.23 
 
 		 449 aa  71.6  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  23.42 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  26.54 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0950  phenylacetate-CoA ligase  25.45 
 
 		 433 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000041107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0121  phenylacetate-CoA ligase, putative  26.89 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2223  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.72 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.230555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2016  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.08 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.651292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  23.32 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  24.38 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  26.37 
 
 		 448 aa  70.1  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  24.58 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  26.9 
 
 		 457 aa  70.1  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0460  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  23.91 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  23.44 
 
 		 433 aa  69.7  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  25.27 
 
 		 436 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0563  putative phenylacetate-CoA ligase  27.62 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0311753 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  23.36 
 
 		 432 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  24.31 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  22.79 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1754  coenzyme F390 synthetase  22.02 
 
 		 451 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  23.65 
 
 		 432 aa  68.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3457  phenylacetate-CoA ligase  25.66 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  24.64 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  22.52 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  24.36 
 
 		 433 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  25.81 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  23.98 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1029  Phenylacetate--CoA ligase  24.12 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0628  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.66 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3347  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  25.71 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  22.56 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  23.11 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4074  phenylacetate-CoA ligase  23.22 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  23.2 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2792  phenylacetate--CoA ligase  23.48 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  24.65 
 
 		 428 aa  67  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  27.18 
 
 		 446 aa  67  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  22.97 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  25.08 
 
 		 464 aa  66.6  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0136  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  27.36 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0413194 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1040  coenzyme F390 synthetase-like protein  21.91 
 
 		 436 aa  66.2  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  23.78 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  24.43 
 
 		 449 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  25.7 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  24.48 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  22.95 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  22.95 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0948  putative anaerobic phenylacetate CoA ligase  26.22 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  25.14 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  22.95 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0540  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  23.74 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000138329  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  24.79 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  25.16 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2446  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  26.07 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0540  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.61 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  24.79 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2273  putative anaerobic phenylacetate CoA ligase  26.22 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0598  putative phenylacetate-CoA ligase  26.26 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  24 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  22.83 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  23.91 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  23.73 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  22.72 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>