More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2558 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2558  hypothetical protein  100 
 
 		 816 aa  1657    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1926  acyl-CoA reductase  43.04 
 
 		 837 aa  530  1e-149  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.318722  normal  0.240378 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1627  acyl-CoA reductase  31.45 
 
 		 415 aa  146  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1925  hypothetical protein  28.97 
 
 		 426 aa  106  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.132933  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0950  phenylacetate-CoA ligase  27.92 
 
 		 433 aa  97.8  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000041107  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2051  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  28 
 
 		 433 aa  94  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.433372  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  26.49 
 
 		 434 aa  93.6  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  25.9 
 
 		 433 aa  92.8  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  26.82 
 
 		 412 aa  90.9  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  28.78 
 
 		 433 aa  88.6  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4516  putative acyl-CoA reductase  31.74 
 
 		 499 aa  85.9  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.684609  normal  0.796561 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  25.78 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0935  Acyl-CoA reductase (LuxC)  23.2 
 
 		 488 aa  82.8  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  28.01 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  25.25 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  28.62 
 
 		 436 aa  79.7  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  29.05 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  27.05 
 
 		 415 aa  79.7  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2557  phenylacetate-CoA ligase  26.03 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4529  acyl-CoA reductase  28.78 
 
 		 498 aa  79  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  28.88 
 
 		 438 aa  77  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6916  long-chain-fatty-acyl-CoA reductase  22.44 
 
 		 484 aa  77  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.245802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  25.36 
 
 		 433 aa  77.4  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06244  fatty acid reductase  24.01 
 
 		 477 aa  76.6  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  26.84 
 
 		 441 aa  76.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1515  phenylacetate-CoA ligase  29.03 
 
 		 438 aa  76.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0837149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  25.8 
 
 		 428 aa  76.3  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2631  acyl protein synthase/acyl-CoA reductase RfbN  24.07 
 
 		 825 aa  76.6  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  26.35 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  27.09 
 
 		 441 aa  75.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  27.09 
 
 		 427 aa  75.5  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  26.84 
 
 		 441 aa  75.5  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  26.27 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1307  acyl-CoA reductase  23.56 
 
 		 499 aa  74.7  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  26.96 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  28.28 
 
 		 432 aa  74.7  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1132  Phenylacetate--CoA ligase  28.23 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  27.3 
 
 		 435 aa  74.3  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  27.76 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.17 
 
 		 436 aa  73.9  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  26.96 
 
 		 414 aa  72.8  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  27.13 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  24.57 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  28.16 
 
 		 443 aa  72  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  30.42 
 
 		 439 aa  72  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  27.09 
 
 		 445 aa  72  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2247  phenylacetate-CoA ligase  29.46 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0997438  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  27.46 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  26.17 
 
 		 434 aa  72  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1584  phenylacetate-CoA ligase  29.46 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2257  phenylacetate-CoA ligase  29.46 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.253945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  23.74 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1485  phenylacetate-CoA ligase  29.46 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  28.08 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4697  long-chain-fatty-acyl-CoA reductase  28.49 
 
 		 480 aa  71.2  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  26.24 
 
 		 435 aa  71.2  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  27.2 
 
 		 433 aa  71.2  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  30.15 
 
 		 432 aa  71.2  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  25.77 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1585  Phenylacetate--CoA ligase  27.22 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0730683 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  26.62 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  24.4 
 
 		 439 aa  70.5  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  27.24 
 
 		 434 aa  70.5  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0437  Phenylacetate--CoA ligase  25 
 
 		 435 aa  69.7  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288534  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6699  indoleacetate--lysine ligase  27.76 
 
 		 411 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.43537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  26.67 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  27.16 
 
 		 433 aa  70.1  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  23.93 
 
 		 439 aa  69.7  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  26.41 
 
 		 432 aa  70.1  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1744  acyl-CoA reductase  25.33 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  27.64 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  25.88 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3367  phenylacetate-CoA ligase  29.31 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322757  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  26.03 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1908  phenylacetate-CoA ligase  30.04 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2408  Phenylacetate--CoA ligase  28.38 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0464701 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  29.37 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  27.24 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  27.49 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4609  acyl-CoA reductase  29.01 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000498452  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3633  long-chain-fatty-acyl-CoA reductase  22.16 
 
 		 479 aa  68.2  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.867434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  28.81 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  25.82 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  28.21 
 
 		 431 aa  67.4  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2189  phenylacetate-CoA ligase  28.9 
 
 		 434 aa  67  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0357047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1613  Phenylacetate--CoA ligase  26.51 
 
 		 445 aa  67.4  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297864  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  26.67 
 
 		 428 aa  67.4  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0379  phenylacetate--CoA ligase  28.17 
 
 		 432 aa  67.4  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1923  phenylacetate-CoA ligase  28.57 
 
 		 443 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0702505  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  23.63 
 
 		 439 aa  66.6  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2452  phenylacetate--CoA ligase  27.96 
 
 		 432 aa  66.6  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  24.01 
 
 		 447 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  30.77 
 
 		 436 aa  66.2  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  27.78 
 
 		 432 aa  66.6  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3434  coenzyme F390 synthetase-like protein  30.77 
 
 		 467 aa  65.9  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  24.29 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  27.17 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  27.9 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1817  coenzyme F390 synthetase  42 
 
 		 465 aa  65.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342453  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  28.62 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>