184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6699 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6699  indoleacetate--lysine ligase  100 
 
 
411 aa  822    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.43537  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0371  indoleacetate-lysine ligase  29.46 
 
 
395 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1925  hypothetical protein  27.1 
 
 
426 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.132933  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1926  acyl-CoA reductase  26.65 
 
 
837 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.318722  normal  0.240378 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0016  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.38 
 
 
480 aa  73.9  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110032  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3212  coenzyme F390 synthetase-like protein  33.95 
 
 
460 aa  71.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2558  hypothetical protein  27.76 
 
 
816 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.39 
 
 
454 aa  65.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2016  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.32 
 
 
452 aa  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.651292  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  23.65 
 
 
412 aa  65.1  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2152  Phenylacetate--CoA ligase  26.95 
 
 
446 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65736  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3373  hypothetical protein  29.49 
 
 
406 aa  63.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2897  Phenylacetate--CoA ligase  26.01 
 
 
428 aa  62.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1652  coenzyme F390 synthetase-like  26.85 
 
 
361 aa  62.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  22.91 
 
 
413 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1315  hypothetical protein  27.57 
 
 
442 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  hitchhiker  0.000203578 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  23.3 
 
 
413 aa  61.2  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  25 
 
 
433 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3365  AMP-dependent synthetase and ligase  30.86 
 
 
402 aa  60.1  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2557  phenylacetate-CoA ligase  27.16 
 
 
390 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2125  phenylacetate-CoA ligase  26.52 
 
 
427 aa  59.3  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4394  coenzyme F390 synthetase-like protein  31.43 
 
 
268 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0455  putative phenylacetate-CoA ligase  28.06 
 
 
415 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.647769  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0464  putative phenylacetate-CoA ligase  28.06 
 
 
415 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.260095 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  24.71 
 
 
432 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  25.18 
 
 
436 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2010  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.26 
 
 
455 aa  57.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.484811  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1074  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.17 
 
 
461 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.733782  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3359  phenylacetate--CoA ligase  29.48 
 
 
411 aa  57.8  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  26.25 
 
 
439 aa  57.4  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0676  putative CapK protein  26.32 
 
 
459 aa  57  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0499803  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  23.62 
 
 
433 aa  56.6  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  27.41 
 
 
441 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  27.41 
 
 
441 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  24.72 
 
 
443 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  23.76 
 
 
436 aa  56.2  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1029  Phenylacetate--CoA ligase  25 
 
 
429 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  27.41 
 
 
441 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  23.56 
 
 
694 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1877  coenzyme F390 synthetase-like protein  23.84 
 
 
429 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  29.17 
 
 
432 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2310  Phenylacetate--CoA ligase  24.59 
 
 
425 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  24.43 
 
 
427 aa  55.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  23.25 
 
 
433 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5720  putative phenylacetate-CoA ligase  28.99 
 
 
407 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.776613  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0107  coenzyme F390 synthetase/phenylacetyl-CoA ligase  25.2 
 
 
451 aa  54.7  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4480  coenzyme F390 synthetase-like protein  33.88 
 
 
454 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4311  coenzyme F390 synthetase-like protein  33.88 
 
 
454 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0828925  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4211  coenzyme F390 synthetase-like protein  33.88 
 
 
454 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.494942  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1075  phenylacetate--CoA ligase  24.12 
 
 
429 aa  54.3  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1919  hypothetical protein  22.29 
 
 
493 aa  53.9  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3504  putative phenylacetate-CoA ligase  29.73 
 
 
413 aa  53.9  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2226  coenzyme F390 synthetase/phenylacetyl-CoA ligase  23.92 
 
 
450 aa  53.9  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.457159 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  25.45 
 
 
458 aa  53.9  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  23.66 
 
 
433 aa  53.9  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  24.14 
 
 
433 aa  53.9  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4216  coenzyme F390 synthetase-like  25.68 
 
 
456 aa  53.5  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  22.4 
 
 
435 aa  53.5  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1908  hypothetical protein  21.97 
 
 
493 aa  53.5  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1132  Phenylacetate--CoA ligase  26.58 
 
 
418 aa  53.5  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  27.63 
 
 
438 aa  53.5  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1793  putative CapK protein  28.98 
 
 
441 aa  53.5  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1153  putative phenylacetate-CoA ligase  27.81 
 
 
415 aa  53.1  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3140  hypothetical protein  30.35 
 
 
447 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0133  Phenylacetate--CoA ligase  24.65 
 
 
436 aa  52.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0426675  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1200  hypothetical protein  26.97 
 
 
448 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0277555  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  26.69 
 
 
430 aa  52.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3434  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.56 
 
 
467 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2239  coenzyme F390 synthetase-like  30.25 
 
 
466 aa  52.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3441  putative phenylacetate-CoA ligase  28.5 
 
 
420 aa  52.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  23.28 
 
 
433 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  22.86 
 
 
436 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  23.81 
 
 
434 aa  51.2  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3247  phenylacetate-CoA ligase  23.8 
 
 
444 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1546  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.06 
 
 
443 aa  51.2  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  29.17 
 
 
437 aa  51.6  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1908  phenylacetate-CoA ligase  23.71 
 
 
446 aa  51.2  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1515  phenylacetate-CoA ligase  26.35 
 
 
438 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0837149  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0054  phenylacetate-CoA ligase, putative  28.77 
 
 
405 aa  50.8  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  23.97 
 
 
432 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0838  phenylacetate--CoA ligase  23.32 
 
 
431 aa  50.8  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5790  phenylacetate--CoA ligase  26.36 
 
 
416 aa  50.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1303  Phenylacetate--CoA ligase  29.33 
 
 
437 aa  50.4  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26570  phenylacetate-CoA ligase  25.08 
 
 
448 aa  50.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.123505 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2299  hypothetical protein  24.44 
 
 
448 aa  50.4  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  23.55 
 
 
446 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  27.33 
 
 
451 aa  50.1  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2883  phenylacetate-CoA ligase  25.77 
 
 
427 aa  50.1  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  23.3 
 
 
435 aa  50.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  25.1 
 
 
431 aa  50.1  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0563  putative phenylacetate-CoA ligase  28.45 
 
 
418 aa  50.1  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0311753 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  22.65 
 
 
434 aa  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  27.18 
 
 
441 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  24.49 
 
 
457 aa  49.7  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  21.97 
 
 
433 aa  49.7  0.00009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0382  phenylacetate-CoA ligase  27.94 
 
 
406 aa  49.3  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0956  Phenylacetate--CoA ligase  26.09 
 
 
434 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  27.42 
 
 
450 aa  49.3  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  23.15 
 
 
433 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1449  phenylacetate-CoA ligase  22.33 
 
 
429 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>