More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2035 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  100 
 
 
454 aa  923    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  31.72 
 
 
457 aa  242  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0676  putative CapK protein  30.42 
 
 
459 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0499803  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1971  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  31.46 
 
 
453 aa  231  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  31.65 
 
 
451 aa  229  8e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  30.18 
 
 
448 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  29.58 
 
 
450 aa  212  9e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0291  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  29.18 
 
 
453 aa  204  3e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.326701  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2316  coenzyme F390 synthetase-like protein  31.11 
 
 
450 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  29.68 
 
 
464 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  32.78 
 
 
439 aa  196  6e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2310  coenzyme F390 synthetase-like protein  30.82 
 
 
475 aa  193  5e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  25.17 
 
 
469 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1793  putative CapK protein  27.7 
 
 
441 aa  188  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  26.06 
 
 
437 aa  187  5e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0614  CapK related-protein  27.42 
 
 
445 aa  180  4e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.973847  normal  0.145617 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2526  Coenzyme F390 synthetase-like protein  27.84 
 
 
437 aa  176  7e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142234 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0295  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  27.09 
 
 
461 aa  172  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619099  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  25.39 
 
 
480 aa  172  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.89 
 
 
446 aa  172  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2647  coenzyme F390 synthetase-like  31.12 
 
 
467 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  29.16 
 
 
426 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3567  CapK related-protein  27.13 
 
 
502 aa  160  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0449  putative capK protein  26.68 
 
 
446 aa  153  8e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  26.56 
 
 
458 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3332  coenzyme F390 synthetase-like  26.72 
 
 
416 aa  145  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.422547  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1800  putative polysaccharide biosynthesis protein  25.36 
 
 
448 aa  144  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  26.42 
 
 
453 aa  142  9e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13008  possible CapK protein  26.25 
 
 
463 aa  140  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0922559  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1535  CapK protein, putative  25.48 
 
 
461 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0387  Coenzyme F390 synthetase-like protein  26.15 
 
 
466 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.602394  normal  0.432377 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1950  capK related-protein  26.21 
 
 
446 aa  130  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0441  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.57 
 
 
468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356155  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3795  CapK protein, putative  23.87 
 
 
475 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.217638  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1652  coenzyme F390 synthetase-like  28.81 
 
 
361 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00696  hypothetical protein  28.95 
 
 
417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0016  coenzyme F390 synthetase-like protein  29.3 
 
 
480 aa  114  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110032  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0472  putative capK protein  27.68 
 
 
459 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000021402  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1040  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.95 
 
 
436 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0875  Coenzyme F390 synthetase-like protein  25.28 
 
 
563 aa  101  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3212  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.87 
 
 
460 aa  101  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2239  coenzyme F390 synthetase-like  22.74 
 
 
466 aa  99.8  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1200  hypothetical protein  24.71 
 
 
448 aa  97.4  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0277555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3014  hypothetical protein  26.04 
 
 
445 aa  97.1  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3246  hypothetical protein  26.04 
 
 
445 aa  97.1  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3245  hypothetical protein  25.8 
 
 
445 aa  97.1  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4201  coenzyme F390 synthetase-like  24.3 
 
 
457 aa  96.7  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282456  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2955  putative adenylate-forming enzyme  25.62 
 
 
445 aa  95.9  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0260622  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4216  coenzyme F390 synthetase-like  24.04 
 
 
456 aa  96.3  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1074  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.67 
 
 
461 aa  96.3  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.733782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2999  coenzyme F390 synthetase  25.8 
 
 
445 aa  95.5  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0176304  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2429  capK domain protein  28.68 
 
 
476 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00799946  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2156  coenzyme F390 synthetase-like protein  21.27 
 
 
459 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295514  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2936  hypothetical protein  25.8 
 
 
445 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4305  CapK domain-containing protein  27.59 
 
 
481 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1703  coenzyme F390 synthetase  24.26 
 
 
472 aa  91.3  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3613  coenzyme F390 synthetase  23.6 
 
 
436 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0420369  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1943  hypothetical protein  24.46 
 
 
460 aa  90.1  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  26.07 
 
 
434 aa  88.2  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4394  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.13 
 
 
268 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0662  Coenzyme F390 synthetase-like protein  22.87 
 
 
425 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  23.91 
 
 
435 aa  86.7  7e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02970  possible capK protein  26.35 
 
 
435 aa  85.9  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240993  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  25.12 
 
 
433 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  23.64 
 
 
433 aa  84  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2299  hypothetical protein  22.96 
 
 
448 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0582  hypothetical protein  22.15 
 
 
479 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.661178  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1919  hypothetical protein  23.54 
 
 
493 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1908  hypothetical protein  23.54 
 
 
493 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2007  CapK related-protein  21.43 
 
 
487 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  25.61 
 
 
443 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2997  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.17 
 
 
468 aa  79.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  24.73 
 
 
430 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0111  capsular polysacharride biosynthesis gene, putative  22.84 
 
 
422 aa  78.2  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000821148 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  22.22 
 
 
433 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  24.46 
 
 
423 aa  77.8  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  25.06 
 
 
435 aa  77  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1075  phenylacetate--CoA ligase  25.07 
 
 
429 aa  76.6  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  22.2 
 
 
433 aa  76.6  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2010  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.5 
 
 
455 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.484811  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  23.22 
 
 
432 aa  76.3  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  28.71 
 
 
436 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  24.36 
 
 
433 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  24.81 
 
 
434 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2897  Phenylacetate--CoA ligase  24 
 
 
428 aa  74.3  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  24.8 
 
 
413 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2214  adenylate-forming enzyme  22.4 
 
 
428 aa  73.6  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.362513  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2503  hypothetical protein  22.4 
 
 
428 aa  73.6  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000239215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0807  coenzyme F390 synthetase-like protein  22.67 
 
 
452 aa  73.6  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.316461  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2866  putative adenylate-forming enzyme  24.18 
 
 
427 aa  73.6  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.879124 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  23.15 
 
 
439 aa  72.8  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0076  coenzyme F390 synthetase  25.3 
 
 
442 aa  73.2  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.743579  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  24.6 
 
 
434 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2104  hypothetical protein  22.4 
 
 
428 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4480  coenzyme F390 synthetase-like protein  21.67 
 
 
454 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4311  coenzyme F390 synthetase-like protein  21.67 
 
 
454 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0828925  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4211  coenzyme F390 synthetase-like protein  21.67 
 
 
454 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.494942  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4074  phenylacetate-CoA ligase  25.07 
 
 
437 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  29.26 
 
 
429 aa  72  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  22.17 
 
 
432 aa  71.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>