More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4305 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4305  CapK domain-containing protein  100 
 
 		 481 aa  978    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2429  capK domain protein  47.8 
 
 		 476 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00799946  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  26.73 
 
 		 448 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  26.97 
 
 		 457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  24.4 
 
 		 451 aa  111  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  27.66 
 
 		 426 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  26.84 
 
 		 469 aa  110  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0291  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  25.55 
 
 		 453 aa  106  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.326701  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  27.85 
 
 		 450 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1971  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  23.73 
 
 		 453 aa  100  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13008  possible CapK protein  24.38 
 
 		 463 aa  100  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0922559  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2526  Coenzyme F390 synthetase-like protein  24.78 
 
 		 437 aa  99.8  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142234 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0472  putative capK protein  24.2 
 
 		 459 aa  99  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000021402  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  25.93 
 
 		 480 aa  97.4  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0676  putative CapK protein  24.55 
 
 		 459 aa  95.9  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0499803  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2310  coenzyme F390 synthetase-like protein  23.23 
 
 		 475 aa  93.6  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  25.8 
 
 		 439 aa  93.2  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.59 
 
 		 454 aa  92.8  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  25.98 
 
 		 464 aa  92.4  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  24.67 
 
 		 458 aa  91.7  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2647  coenzyme F390 synthetase-like  26.3 
 
 		 467 aa  90.9  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2316  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.29 
 
 		 450 aa  90.5  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  27.3 
 
 		 453 aa  89.7  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1200  hypothetical protein  26.3 
 
 		 448 aa  89  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0277555  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  25 
 
 		 437 aa  88.2  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4201  coenzyme F390 synthetase-like  25.6 
 
 		 457 aa  87.4  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1535  CapK protein, putative  27.42 
 
 		 461 aa  86.7  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0582  hypothetical protein  26.47 
 
 		 479 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.661178  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1040  coenzyme F390 synthetase-like protein  22.45 
 
 		 436 aa  82.4  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  25.76 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  23.77 
 
 		 436 aa  82.4  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6630  hypothetical protein  31.28 
 
 		 462 aa  80.5  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.997054  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.45 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3245  hypothetical protein  24.82 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4216  coenzyme F390 synthetase-like  24.7 
 
 		 456 aa  80.1  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1074  coenzyme F390 synthetase-like protein  31.6 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.733782  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3014  hypothetical protein  24.82 
 
 		 445 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3246  hypothetical protein  24.82 
 
 		 445 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  26.74 
 
 		 432 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2999  coenzyme F390 synthetase  24.57 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0176304  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0449  putative capK protein  25.95 
 
 		 446 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0387  Coenzyme F390 synthetase-like protein  22.65 
 
 		 466 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.602394  normal  0.432377 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  25.4 
 
 		 443 aa  77  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2299  hypothetical protein  25 
 
 		 448 aa  77  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1943  hypothetical protein  24.63 
 
 		 460 aa  76.6  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  26.44 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2936  hypothetical protein  24.57 
 
 		 445 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  24.51 
 
 		 436 aa  76.3  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0614  CapK related-protein  25.75 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.973847  normal  0.145617 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  24.28 
 
 		 444 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  24.68 
 
 		 434 aa  74.7  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0441  capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 		 468 aa  73.6  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356155  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1800  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 		 448 aa  73.6  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1793  putative CapK protein  23.64 
 
 		 441 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  24.71 
 
 		 458 aa  72.8  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  22.22 
 
 		 435 aa  73.2  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0662  Coenzyme F390 synthetase-like protein  24.35 
 
 		 425 aa  73.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2955  putative adenylate-forming enzyme  23.89 
 
 		 445 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0260622  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5019  phenylacetate--CoA ligase  26.15 
 
 		 477 aa  72.4  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.173124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  24.16 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1613  Phenylacetate--CoA ligase  22.82 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297864  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1132  Phenylacetate--CoA ligase  24.63 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  25.71 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  26.44 
 
 		 433 aa  71.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00696  hypothetical protein  25.48 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  25.5 
 
 		 433 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3545  coenzyme F390 synthetase-like  27.17 
 
 		 524 aa  70.9  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1950  capK related-protein  27.83 
 
 		 446 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0409  Phenylacetate--CoA ligase  24.14 
 
 		 447 aa  70.5  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0103532 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3332  coenzyme F390 synthetase-like  25.91 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.422547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2007  CapK related-protein  24.29 
 
 		 487 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  26.26 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  25.95 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08400  coenzyme F390 synthetase  23.99 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0324519  normal  0.311069 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  24.03 
 
 		 442 aa  69.7  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  23.23 
 
 		 447 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  24.5 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2152  Phenylacetate--CoA ligase  24.62 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65736  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  24.93 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  22.22 
 
 		 432 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  26.81 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  25.54 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  25.28 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  25.07 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2792  phenylacetate--CoA ligase  24.53 
 
 		 440 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  22.22 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1585  Phenylacetate--CoA ligase  24.69 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0730683 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  24.7 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  24.25 
 
 		 428 aa  67  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  24.19 
 
 		 439 aa  67  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  24.72 
 
 		 434 aa  67  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1800  coenzyme F390 synthetase-like  24.27 
 
 		 450 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0238175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  23.24 
 
 		 437 aa  66.6  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  23.36 
 
 		 434 aa  66.6  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2322  Phenylacetate--CoA ligase  25.46 
 
 		 449 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  24.74 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2129  phenylacetate--CoA ligase  25.1 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0382  phenylacetate--CoA ligase  24.92 
 
 		 442 aa  65.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1615  Coenzyme F390 synthetase-like protein  24.4 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  23.8 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>