More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2647 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2647  coenzyme F390 synthetase-like  100 
 
 
467 aa  977    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  30.34 
 
 
446 aa  169  7e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  31.12 
 
 
454 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  29.43 
 
 
439 aa  152  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  27.79 
 
 
457 aa  150  6e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0295  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  29.75 
 
 
461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619099  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2526  Coenzyme F390 synthetase-like protein  27.82 
 
 
437 aa  145  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142234 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0614  CapK related-protein  26.94 
 
 
445 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.973847  normal  0.145617 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  27.19 
 
 
450 aa  143  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  27.84 
 
 
437 aa  142  9e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1971  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  25.32 
 
 
453 aa  141  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0676  putative CapK protein  25.94 
 
 
459 aa  136  8e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0499803  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0291  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  26.63 
 
 
453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.326701  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  27.81 
 
 
451 aa  132  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0449  putative capK protein  25.42 
 
 
446 aa  130  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  27.27 
 
 
480 aa  129  9.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  30.27 
 
 
453 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  25.46 
 
 
448 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  25.58 
 
 
464 aa  121  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3332  coenzyme F390 synthetase-like  27.91 
 
 
416 aa  120  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.422547  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2310  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.94 
 
 
475 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1950  capK related-protein  27.15 
 
 
446 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1800  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.38 
 
 
448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  28.49 
 
 
426 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13008  possible CapK protein  25.91 
 
 
463 aa  114  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0922559  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2316  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.17 
 
 
450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1793  putative CapK protein  25 
 
 
441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3567  CapK related-protein  27.85 
 
 
502 aa  110  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0441  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.47 
 
 
468 aa  107  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356155  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  27.71 
 
 
469 aa  105  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0387  Coenzyme F390 synthetase-like protein  26.02 
 
 
466 aa  100  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.602394  normal  0.432377 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1535  CapK protein, putative  25.42 
 
 
461 aa  99.8  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0582  hypothetical protein  25.62 
 
 
479 aa  98.6  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.661178  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3795  CapK protein, putative  24.77 
 
 
475 aa  97.1  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.217638  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1040  coenzyme F390 synthetase-like protein  23.9 
 
 
436 aa  95.5  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  26.1 
 
 
458 aa  95.1  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4305  CapK domain-containing protein  26.3 
 
 
481 aa  90.9  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  24.86 
 
 
433 aa  89.4  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1943  hypothetical protein  24.01 
 
 
460 aa  86.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  24.01 
 
 
433 aa  83.6  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  26.71 
 
 
438 aa  83.6  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  25.57 
 
 
432 aa  83.2  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  25.57 
 
 
432 aa  81.3  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1074  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.35 
 
 
461 aa  80.9  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.733782  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  26.79 
 
 
433 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1652  coenzyme F390 synthetase-like  26.32 
 
 
361 aa  79.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  25 
 
 
432 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  27.37 
 
 
423 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_811  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  33.33 
 
 
429 aa  79  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2897  Phenylacetate--CoA ligase  27.12 
 
 
428 aa  79  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  24.49 
 
 
432 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2156  coenzyme F390 synthetase-like protein  24 
 
 
459 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295514  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0824  phenylacetate--CoA ligase  33.33 
 
 
429 aa  78.2  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  27.71 
 
 
441 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  26.88 
 
 
433 aa  77.4  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2997  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.06 
 
 
468 aa  77.4  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  29 
 
 
443 aa  77  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0875  Coenzyme F390 synthetase-like protein  21.79 
 
 
563 aa  77  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  24.27 
 
 
414 aa  77  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0662  Coenzyme F390 synthetase-like protein  26.07 
 
 
425 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  26.13 
 
 
428 aa  76.3  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2287  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  33.33 
 
 
418 aa  75.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.534483  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0940  AMP-binding enzyme  32.5 
 
 
429 aa  75.5  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  24.34 
 
 
414 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  25.57 
 
 
435 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  26.43 
 
 
428 aa  75.5  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2310  Phenylacetate--CoA ligase  30 
 
 
425 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  24.28 
 
 
434 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  24.5 
 
 
433 aa  75.1  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  24.18 
 
 
414 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  25.81 
 
 
433 aa  74.3  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  26.52 
 
 
441 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  27.27 
 
 
435 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2883  phenylacetate-CoA ligase  26.29 
 
 
427 aa  73.9  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  23.99 
 
 
434 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  25.59 
 
 
442 aa  73.9  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  24.93 
 
 
433 aa  73.9  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  30.63 
 
 
433 aa  73.9  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1703  coenzyme F390 synthetase  23.86 
 
 
472 aa  73.6  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  26.52 
 
 
427 aa  73.6  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2104  hypothetical protein  24.66 
 
 
428 aa  73.6  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  23.44 
 
 
438 aa  73.2  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  22.67 
 
 
433 aa  72.8  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  29.89 
 
 
429 aa  73.2  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  25 
 
 
433 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2299  hypothetical protein  24.04 
 
 
448 aa  72.8  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2503  hypothetical protein  24.24 
 
 
428 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000239215 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  28.17 
 
 
412 aa  72.4  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  25.76 
 
 
435 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  24.71 
 
 
436 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0477  phenylacetate-CoA ligase  24.71 
 
 
427 aa  72  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6630  hypothetical protein  28.98 
 
 
462 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.997054  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  24.93 
 
 
436 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  26.97 
 
 
436 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  23.68 
 
 
432 aa  72  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2214  adenylate-forming enzyme  24.24 
 
 
428 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.362513  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  23.98 
 
 
432 aa  72  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  22.46 
 
 
436 aa  72  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  24.5 
 
 
428 aa  72.4  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  27.52 
 
 
441 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>