More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2316 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  73.66 
 
 		 464 aa  706    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2316  coenzyme F390 synthetase-like protein  100 
 
 		 450 aa  929    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2310  coenzyme F390 synthetase-like protein  82.39 
 
 		 475 aa  769    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3332  coenzyme F390 synthetase-like  37.35 
 
 		 416 aa  281  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.422547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0441  capsular polysaccharide biosynthesis protein  35.39 
 
 		 468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356155  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1971  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  35.48 
 
 		 453 aa  218  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  32.86 
 
 		 458 aa  209  9e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  31.11 
 
 		 454 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0449  putative capK protein  29.81 
 
 		 446 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  31.91 
 
 		 457 aa  192  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1535  CapK protein, putative  30.05 
 
 		 461 aa  189  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  31.12 
 
 		 439 aa  187  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0676  putative CapK protein  29.65 
 
 		 459 aa  186  9e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0499803  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  30.72 
 
 		 451 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0472  putative capK protein  26.26 
 
 		 459 aa  184  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000021402  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  27.48 
 
 		 469 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  28.48 
 
 		 446 aa  179  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2156  coenzyme F390 synthetase-like protein  31.15 
 
 		 459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3795  CapK protein, putative  26.5 
 
 		 475 aa  170  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.217638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0614  CapK related-protein  30.11 
 
 		 445 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.973847  normal  0.145617 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  28.86 
 
 		 480 aa  168  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  30 
 
 		 450 aa  167  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0291  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  29.18 
 
 		 453 aa  164  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.326701  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  28.84 
 
 		 426 aa  157  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  26.82 
 
 		 453 aa  155  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2007  CapK related-protein  27.43 
 
 		 487 aa  154  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1950  capK related-protein  27.78 
 
 		 446 aa  152  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0387  Coenzyme F390 synthetase-like protein  25.48 
 
 		 466 aa  151  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.602394  normal  0.432377 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3567  CapK related-protein  28.28 
 
 		 502 aa  150  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2526  Coenzyme F390 synthetase-like protein  26.42 
 
 		 437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142234 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  28.54 
 
 		 437 aa  145  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13008  possible CapK protein  25.23 
 
 		 463 aa  141  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0922559  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1200  hypothetical protein  26.91 
 
 		 448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0277555  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1800  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.5 
 
 		 448 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  31.33 
 
 		 433 aa  137  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  32.73 
 
 		 432 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  27.84 
 
 		 448 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  30.56 
 
 		 434 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  28.4 
 
 		 433 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  29 
 
 		 433 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  29 
 
 		 433 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  26.68 
 
 		 435 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  28.61 
 
 		 438 aa  130  7.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0295  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  26.95 
 
 		 461 aa  129  8.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  30.51 
 
 		 434 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  27.51 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  30.65 
 
 		 433 aa  128  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0875  Coenzyme F390 synthetase-like protein  25.32 
 
 		 563 aa  127  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  28.95 
 
 		 443 aa  127  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  29.31 
 
 		 434 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  30.36 
 
 		 432 aa  125  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  28.61 
 
 		 427 aa  126  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  30.24 
 
 		 432 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0582  hypothetical protein  28.28 
 
 		 479 aa  125  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.661178  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  27.61 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  29.45 
 
 		 432 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  28.87 
 
 		 432 aa  123  5e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  29.82 
 
 		 433 aa  123  6e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  32.17 
 
 		 432 aa  123  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  28.09 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  27.95 
 
 		 439 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  28.57 
 
 		 436 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1793  putative CapK protein  25.47 
 
 		 441 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2299  hypothetical protein  24.66 
 
 		 448 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  28.57 
 
 		 432 aa  121  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  28 
 
 		 437 aa  120  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  28.09 
 
 		 433 aa  121  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  32.09 
 
 		 434 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  29.43 
 
 		 433 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  28.87 
 
 		 432 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  27.84 
 
 		 433 aa  120  6e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  26.54 
 
 		 428 aa  120  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  30.06 
 
 		 433 aa  120  7e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  27.93 
 
 		 434 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  27.25 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  29.85 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  27.34 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  29.04 
 
 		 442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  29.58 
 
 		 444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  29.91 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  26.65 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  30.5 
 
 		 435 aa  117  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  27.39 
 
 		 430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  29.13 
 
 		 432 aa  117  6e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  30.02 
 
 		 445 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5775  phenylacetate-CoA ligase  28.38 
 
 		 440 aa  117  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  26.81 
 
 		 423 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  30.18 
 
 		 434 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0901  phenylacetate-CoA ligase  28.13 
 
 		 445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  27.29 
 
 		 435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  28.66 
 
 		 433 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1318  phenylacetate-CoA ligase  28.38 
 
 		 440 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  24.38 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  27.99 
 
 		 446 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0807  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.93 
 
 		 452 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.316461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  28.14 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  30.18 
 
 		 435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  27.65 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  30.59 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3406  coenzyme F390 synthetase-like protein  29.64 
 
 		 478 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684455  normal  0.102946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>