79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0807 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0807  coenzyme F390 synthetase-like protein  100 
 
 		 452 aa  929    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.316461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0472  putative capK protein  29.93 
 
 		 459 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000021402  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  25.35 
 
 		 464 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2310  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.31 
 
 		 475 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3332  coenzyme F390 synthetase-like  28.28 
 
 		 416 aa  119  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.422547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2316  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.93 
 
 		 450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0441  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.46 
 
 		 468 aa  107  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356155  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2156  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.92 
 
 		 459 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4415  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.47 
 
 		 480 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.992937  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  22.67 
 
 		 454 aa  73.6  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1040  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.59 
 
 		 436 aa  73.2  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  21.17 
 
 		 446 aa  72  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13008  possible CapK protein  25.78 
 
 		 463 aa  71.2  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0922559  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2647  coenzyme F390 synthetase-like  24.13 
 
 		 467 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  24.44 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  21.31 
 
 		 448 aa  70.1  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0449  putative capK protein  22.22 
 
 		 446 aa  67.4  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4305  CapK domain-containing protein  22.09 
 
 		 481 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  21.18 
 
 		 457 aa  65.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2458  coenzyme F390 synthetase/phenylacetyl-CoA ligase  22.16 
 
 		 451 aa  62.4  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3406  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.21 
 
 		 478 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684455  normal  0.102946 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3795  CapK protein, putative  20.76 
 
 		 475 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.217638  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02970  possible capK protein  22.89 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240993  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1971  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  20.06 
 
 		 453 aa  59.7  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  20.19 
 
 		 450 aa  57.4  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  20.81 
 
 		 453 aa  56.6  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  22.12 
 
 		 436 aa  55.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0387  Coenzyme F390 synthetase-like protein  22.03 
 
 		 466 aa  55.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.602394  normal  0.432377 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  19.26 
 
 		 480 aa  55.1  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3567  CapK related-protein  19.69 
 
 		 502 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  21.43 
 
 		 426 aa  53.9  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0539  phenylacetate--CoA ligase  21.88 
 
 		 477 aa  53.5  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  decreased coverage  0.00138843 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1950  capK related-protein  21.61 
 
 		 446 aa  53.1  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0602  coenzyme F390 synthetase  20.43 
 
 		 451 aa  52.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0488194  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5019  phenylacetate--CoA ligase  22.79 
 
 		 477 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.173124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1754  coenzyme F390 synthetase  20.82 
 
 		 451 aa  52.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  19.69 
 
 		 451 aa  51.6  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08400  coenzyme F390 synthetase  22.02 
 
 		 447 aa  51.2  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0324519  normal  0.311069 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3048  phenylacetate-CoA ligase  21.97 
 
 		 456 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00696  hypothetical protein  24.31 
 
 		 417 aa  50.8  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3655  phenylacetate--CoA ligase  20.31 
 
 		 481 aa  50.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  22.64 
 
 		 432 aa  50.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1535  CapK protein, putative  19.61 
 
 		 461 aa  50.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1793  putative CapK protein  20.39 
 
 		 441 aa  50.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1422  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.47 
 
 		 472 aa  50.4  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.132249 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0508  coenzyme F390 synthetase  21.46 
 
 		 455 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0111  capsular polysacharride biosynthesis gene, putative  27.6 
 
 		 422 aa  49.3  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000821148 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1845  phenylacetate-CoA ligase  21.67 
 
 		 440 aa  49.7  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  21.22 
 
 		 448 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2425  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase (AlkK-1)  32.79 
 
 		 474 aa  48.9  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.393978  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0291  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  19.44 
 
 		 453 aa  48.9  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.326701  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0676  putative CapK protein  20.98 
 
 		 459 aa  48.9  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0499803  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2689  coenzyme F390 synthetase-like protein  23.89 
 
 		 438 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0708257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  23.53 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1703  coenzyme F390 synthetase  22.38 
 
 		 472 aa  48.5  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  22.58 
 
 		 436 aa  47.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  22.64 
 
 		 443 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20330  phenylacetate-CoA ligase  22.08 
 
 		 449 aa  48.1  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2526  Coenzyme F390 synthetase-like protein  23.67 
 
 		 437 aa  47.4  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142234 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  21.61 
 
 		 439 aa  47.4  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  20.62 
 
 		 434 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  19.94 
 
 		 437 aa  47  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  20.64 
 
 		 439 aa  47  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  21.68 
 
 		 433 aa  46.6  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0824  phenylacetate--CoA ligase  23.48 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2226  coenzyme F390 synthetase/phenylacetyl-CoA ligase  21.01 
 
 		 450 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.457159 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  22.01 
 
 		 436 aa  46.2  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0875  Coenzyme F390 synthetase-like protein  21.62 
 
 		 563 aa  45.8  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4074  phenylacetate-CoA ligase  22.65 
 
 		 437 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2429  capK domain protein  20.63 
 
 		 476 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00799946  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2129  phenylacetate--CoA ligase  19.71 
 
 		 472 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0940  AMP-binding enzyme  23.85 
 
 		 429 aa  45.1  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0409  Phenylacetate--CoA ligase  22.44 
 
 		 447 aa  44.7  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0103532 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  22.98 
 
 		 432 aa  44.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  22.43 
 
 		 436 aa  43.9  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4201  coenzyme F390 synthetase-like  19.64 
 
 		 457 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  20.1 
 
 		 444 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_811  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  23.31 
 
 		 429 aa  43.5  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  21.83 
 
 		 431 aa  43.5  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>