More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1422 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2425  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase (AlkK-1)  82.34 
 
 		 474 aa  823    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.393978  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1422  coenzyme F390 synthetase-like protein  100 
 
 		 472 aa  969    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.132249 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  30.54 
 
 		 445 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  30.24 
 
 		 432 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  29.47 
 
 		 447 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0169  phenylacetate--CoA ligase  31.93 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  29.82 
 
 		 434 aa  147  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  27.53 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  28.26 
 
 		 430 aa  145  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  28.6 
 
 		 449 aa  145  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  30.69 
 
 		 458 aa  144  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  28.73 
 
 		 434 aa  142  9e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  29.07 
 
 		 434 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  29.42 
 
 		 430 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1613  Phenylacetate--CoA ligase  29.57 
 
 		 445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297864  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0409  Phenylacetate--CoA ligase  28.98 
 
 		 447 aa  140  6e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0103532 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2792  phenylacetate--CoA ligase  28.54 
 
 		 440 aa  138  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2152  Phenylacetate--CoA ligase  28.73 
 
 		 446 aa  137  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65736  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  26.55 
 
 		 435 aa  137  5e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0539  phenylacetate--CoA ligase  26.68 
 
 		 477 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  decreased coverage  0.00138843 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  28.23 
 
 		 428 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  27.25 
 
 		 436 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08400  coenzyme F390 synthetase  28.2 
 
 		 447 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0324519  normal  0.311069 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2129  phenylacetate--CoA ligase  27.96 
 
 		 472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  29.9 
 
 		 431 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  27.98 
 
 		 435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  26.71 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  26.83 
 
 		 437 aa  134  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  26.33 
 
 		 444 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  28.04 
 
 		 432 aa  133  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3655  phenylacetate--CoA ligase  27.1 
 
 		 481 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  28.86 
 
 		 433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  26.05 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  29.8 
 
 		 438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1318  phenylacetate-CoA ligase  29.74 
 
 		 440 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  27.56 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  28.86 
 
 		 433 aa  131  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  26.22 
 
 		 435 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  28 
 
 		 434 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  28.73 
 
 		 433 aa  130  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  26.77 
 
 		 435 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  30.08 
 
 		 429 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  27.19 
 
 		 433 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3048  phenylacetate-CoA ligase  27.53 
 
 		 456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  27.68 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  28.29 
 
 		 448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  26.37 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3839  phenylacetate-CoA ligase  29.58 
 
 		 440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4529  phenylacetate-CoA ligase  29.58 
 
 		 440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652745  normal  0.906833 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4126  phenylacetate-CoA ligase  29.9 
 
 		 440 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351473  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  28.97 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3959  phenylacetate-CoA ligase  29.25 
 
 		 440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349382  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  29.14 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5775  phenylacetate-CoA ligase  29.58 
 
 		 440 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4422  phenylacetate-CoA ligase  29.01 
 
 		 440 aa  128  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2322  Phenylacetate--CoA ligase  28.54 
 
 		 449 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  29.35 
 
 		 433 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  25.97 
 
 		 436 aa  127  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  29.3 
 
 		 433 aa  126  7e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  27.14 
 
 		 433 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  26.5 
 
 		 434 aa  126  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  26.77 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  26.91 
 
 		 434 aa  126  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  25.93 
 
 		 434 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  27.25 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  27.11 
 
 		 435 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  28.22 
 
 		 429 aa  124  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  27.23 
 
 		 433 aa  124  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1908  phenylacetate-CoA ligase  26.11 
 
 		 446 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3247  phenylacetate-CoA ligase  27.05 
 
 		 444 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  28.61 
 
 		 433 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  28.61 
 
 		 433 aa  124  4e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  26.23 
 
 		 427 aa  124  4e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  27.32 
 
 		 434 aa  124  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  27.16 
 
 		 432 aa  124  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  27.94 
 
 		 434 aa  123  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  27.39 
 
 		 441 aa  123  9e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  29.27 
 
 		 432 aa  123  9e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  28.12 
 
 		 433 aa  123  9e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  26.17 
 
 		 439 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  30.11 
 
 		 443 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  26.05 
 
 		 436 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  26.99 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2403  phenylacetate-CoA ligase  26.85 
 
 		 436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.670369 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  28.76 
 
 		 433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1392  phenylacetate-CoA ligase  28.64 
 
 		 441 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.276204  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  25.71 
 
 		 434 aa  121  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  27.65 
 
 		 439 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3117  phenylacetate-CoA ligase  27.21 
 
 		 434 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0603128  normal  0.0548798 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  28.17 
 
 		 432 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  25.98 
 
 		 433 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  26.84 
 
 		 435 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  27.23 
 
 		 436 aa  120  6e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1236  phenylacetate-CoA ligase  27.32 
 
 		 436 aa  120  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  28.01 
 
 		 428 aa  120  7e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  28.57 
 
 		 439 aa  120  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  25.77 
 
 		 439 aa  120  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  26.87 
 
 		 435 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  26.27 
 
 		 444 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  25.39 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>