More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2425 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2425  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase (AlkK-1)  100 
 
 		 474 aa  975    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.393978  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1422  coenzyme F390 synthetase-like protein  82.34 
 
 		 472 aa  823    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.132249 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  29.07 
 
 		 432 aa  144  4e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  28.82 
 
 		 434 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  29.34 
 
 		 449 aa  140  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  29 
 
 		 445 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0169  phenylacetate--CoA ligase  29.62 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  28.76 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2792  phenylacetate--CoA ligase  29.59 
 
 		 440 aa  137  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2129  phenylacetate--CoA ligase  28.61 
 
 		 472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  26.64 
 
 		 438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  27.47 
 
 		 447 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  28.11 
 
 		 430 aa  131  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  28.79 
 
 		 458 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3655  phenylacetate--CoA ligase  26.27 
 
 		 481 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  27.92 
 
 		 433 aa  127  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  26.83 
 
 		 435 aa  128  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0539  phenylacetate--CoA ligase  26.54 
 
 		 477 aa  128  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  decreased coverage  0.00138843 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  29.44 
 
 		 433 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08400  coenzyme F390 synthetase  27.91 
 
 		 447 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0324519  normal  0.311069 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4126  phenylacetate-CoA ligase  28.4 
 
 		 440 aa  126  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351473  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1613  Phenylacetate--CoA ligase  28.07 
 
 		 445 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297864  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2322  Phenylacetate--CoA ligase  27.14 
 
 		 449 aa  126  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  26.67 
 
 		 433 aa  126  9e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  27.78 
 
 		 430 aa  126  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1318  phenylacetate-CoA ligase  28.07 
 
 		 440 aa  126  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  28.86 
 
 		 434 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  27.16 
 
 		 435 aa  125  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  26.99 
 
 		 434 aa  125  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  27.88 
 
 		 427 aa  125  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  26.27 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  27.29 
 
 		 433 aa  124  4e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  26.52 
 
 		 444 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1392  phenylacetate-CoA ligase  28.17 
 
 		 441 aa  123  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.276204  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  27.19 
 
 		 429 aa  123  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  26.44 
 
 		 435 aa  123  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3839  phenylacetate-CoA ligase  27.76 
 
 		 440 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4529  phenylacetate-CoA ligase  27.76 
 
 		 440 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652745  normal  0.906833 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  25.44 
 
 		 435 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  27.45 
 
 		 443 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  25.5 
 
 		 437 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  26.2 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3959  phenylacetate-CoA ligase  26.67 
 
 		 440 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349382  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0409  Phenylacetate--CoA ligase  27.76 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0103532 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4422  phenylacetate-CoA ligase  26.44 
 
 		 440 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  26.36 
 
 		 433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5775  phenylacetate-CoA ligase  27.83 
 
 		 440 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  26.13 
 
 		 432 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  23.97 
 
 		 433 aa  121  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  26.36 
 
 		 433 aa  121  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  26.55 
 
 		 434 aa  120  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  25.53 
 
 		 434 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2152  Phenylacetate--CoA ligase  26.6 
 
 		 446 aa  120  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65736  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1236  phenylacetate-CoA ligase  25.62 
 
 		 436 aa  120  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  26.91 
 
 		 448 aa  120  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  28.01 
 
 		 432 aa  120  6e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  26.91 
 
 		 433 aa  120  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  26.34 
 
 		 434 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  26.73 
 
 		 433 aa  119  9e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  25.93 
 
 		 435 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  26.64 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1908  phenylacetate-CoA ligase  26.35 
 
 		 446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  25.71 
 
 		 431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2403  phenylacetate-CoA ligase  25.87 
 
 		 436 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.670369 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  25.78 
 
 		 433 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  26.99 
 
 		 434 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  26.36 
 
 		 433 aa  118  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  25.77 
 
 		 432 aa  117  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  27.71 
 
 		 439 aa  117  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  26 
 
 		 444 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  26.1 
 
 		 436 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  28.73 
 
 		 432 aa  116  8.999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  26.41 
 
 		 428 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  27.35 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  25.56 
 
 		 433 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  27.07 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  28.07 
 
 		 432 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  25.32 
 
 		 433 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  28.41 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  24.51 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  25.49 
 
 		 432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0901  phenylacetate-CoA ligase  27.17 
 
 		 445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3048  phenylacetate-CoA ligase  25.77 
 
 		 456 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  25.96 
 
 		 435 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2883  phenylacetate-CoA ligase  26.93 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  26.85 
 
 		 433 aa  115  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3247  phenylacetate-CoA ligase  25.48 
 
 		 444 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  24.78 
 
 		 434 aa  114  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  25.05 
 
 		 436 aa  113  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  26.79 
 
 		 432 aa  114  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5526  phenylacetate-CoA ligase  25.92 
 
 		 449 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0759485  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  27.1 
 
 		 434 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0986  phenylacetate-CoA ligase  25.43 
 
 		 435 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  26.12 
 
 		 436 aa  113  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  27.11 
 
 		 441 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  25.83 
 
 		 428 aa  113  9e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  24.51 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  26.25 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  27.29 
 
 		 433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  26.05 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>