More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_5015 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 446 aa  933    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  37.75 
 
 		 480 aa  336  3.9999999999999995e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1800  putative polysaccharide biosynthesis protein  30.53 
 
 		 448 aa  216  5e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  27.29 
 
 		 469 aa  209  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1971  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  28.86 
 
 		 453 aa  209  9e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  30.7 
 
 		 439 aa  199  9e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  26.14 
 
 		 450 aa  196  6e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2310  coenzyme F390 synthetase-like protein  29.13 
 
 		 475 aa  188  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  28.54 
 
 		 464 aa  184  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  24.05 
 
 		 448 aa  183  6e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  28.61 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  23.39 
 
 		 457 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  26.03 
 
 		 451 aa  180  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0676  putative CapK protein  23.95 
 
 		 459 aa  179  9e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0499803  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2316  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.48 
 
 		 450 aa  179  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0291  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  24.72 
 
 		 453 aa  177  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.326701  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3567  CapK related-protein  28.09 
 
 		 502 aa  172  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0614  CapK related-protein  28.71 
 
 		 445 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.973847  normal  0.145617 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.89 
 
 		 454 aa  172  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  25.75 
 
 		 453 aa  170  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2647  coenzyme F390 synthetase-like  30.34 
 
 		 467 aa  169  6e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1950  capK related-protein  26.52 
 
 		 446 aa  168  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  25.33 
 
 		 437 aa  167  4e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0295  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  26.53 
 
 		 461 aa  157  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  26.17 
 
 		 458 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1793  putative CapK protein  25.7 
 
 		 441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1535  CapK protein, putative  25.48 
 
 		 461 aa  144  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13008  possible CapK protein  27.58 
 
 		 463 aa  139  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0922559  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0441  capsular polysaccharide biosynthesis protein  28.12 
 
 		 468 aa  137  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356155  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2526  Coenzyme F390 synthetase-like protein  26.14 
 
 		 437 aa  137  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142234 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1200  hypothetical protein  24 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0277555  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0449  putative capK protein  27.54 
 
 		 446 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3795  CapK protein, putative  25.91 
 
 		 475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.217638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3332  coenzyme F390 synthetase-like  24.16 
 
 		 416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.422547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  26.96 
 
 		 438 aa  127  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2007  CapK related-protein  23.85 
 
 		 487 aa  122  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02970  possible capK protein  26.59 
 
 		 435 aa  122  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240993  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2299  hypothetical protein  23.79 
 
 		 448 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0387  Coenzyme F390 synthetase-like protein  27.93 
 
 		 466 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.602394  normal  0.432377 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0875  Coenzyme F390 synthetase-like protein  33.64 
 
 		 563 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.73 
 
 		 436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  25.65 
 
 		 443 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  25.91 
 
 		 433 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5790  phenylacetate--CoA ligase  28.32 
 
 		 416 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0582  hypothetical protein  26.79 
 
 		 479 aa  106  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.661178  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  23.83 
 
 		 442 aa  105  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  26.14 
 
 		 428 aa  103  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0016  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.56 
 
 		 480 aa  103  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2239  coenzyme F390 synthetase-like  34.81 
 
 		 466 aa  103  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  27.25 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  26.18 
 
 		 427 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0662  Coenzyme F390 synthetase-like protein  21.53 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  27.55 
 
 		 433 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  26.9 
 
 		 445 aa  101  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  23.7 
 
 		 432 aa  100  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0169  phenylacetate--CoA ligase  25.31 
 
 		 433 aa  99.4  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  25.31 
 
 		 433 aa  99.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  26.84 
 
 		 433 aa  99.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  22.39 
 
 		 433 aa  99.4  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  26.48 
 
 		 434 aa  99.8  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  24.48 
 
 		 432 aa  99  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1943  hypothetical protein  23.28 
 
 		 460 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  25.65 
 
 		 434 aa  99  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0133  Phenylacetate--CoA ligase  26.35 
 
 		 436 aa  97.8  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0426675  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4074  phenylacetate-CoA ligase  22.86 
 
 		 437 aa  97.8  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  23.02 
 
 		 433 aa  97.1  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3212  coenzyme F390 synthetase-like protein  31.44 
 
 		 460 aa  96.7  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  26.45 
 
 		 441 aa  96.3  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  25.68 
 
 		 435 aa  95.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2429  capK domain protein  24.07 
 
 		 476 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00799946  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  24.72 
 
 		 439 aa  95.5  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  25.36 
 
 		 434 aa  95.5  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  27.14 
 
 		 435 aa  95.1  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  25.97 
 
 		 434 aa  94.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2010  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.89 
 
 		 455 aa  94.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.484811  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  25.97 
 
 		 439 aa  94  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  24.01 
 
 		 430 aa  94  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4201  coenzyme F390 synthetase-like  22.01 
 
 		 457 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6630  hypothetical protein  20.26 
 
 		 462 aa  94  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.997054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  26 
 
 		 435 aa  93.6  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  24.6 
 
 		 433 aa  93.6  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  24.74 
 
 		 433 aa  93.6  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  23.93 
 
 		 436 aa  93.6  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  25.97 
 
 		 435 aa  93.6  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  24.27 
 
 		 433 aa  93.2  9e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2883  phenylacetate-CoA ligase  23.56 
 
 		 427 aa  93.2  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  27.35 
 
 		 439 aa  93.2  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1040  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.54 
 
 		 436 aa  93.2  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0472  putative capK protein  24.37 
 
 		 459 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000021402  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08400  coenzyme F390 synthetase  24.74 
 
 		 447 aa  92.8  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0324519  normal  0.311069 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  25.23 
 
 		 431 aa  92  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  24.8 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1515  phenylacetate-CoA ligase  24.82 
 
 		 438 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0837149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  22.46 
 
 		 433 aa  92  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1074  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.64 
 
 		 461 aa  92  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.733782  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  25.27 
 
 		 434 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  25.96 
 
 		 432 aa  90.9  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4216  coenzyme F390 synthetase-like  29.06 
 
 		 456 aa  90.9  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  25.71 
 
 		 433 aa  90.5  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  23.39 
 
 		 432 aa  90.5  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>