More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2205 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  100 
 
 		 439 aa  907    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0662  Coenzyme F390 synthetase-like protein  33.16 
 
 		 425 aa  240  4e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3044  hypothetical protein  33.77 
 
 		 573 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.584506  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  30.7 
 
 		 446 aa  199  7.999999999999999e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2310  coenzyme F390 synthetase-like protein  32.56 
 
 		 475 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  32.78 
 
 		 454 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  30.92 
 
 		 480 aa  193  6e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0614  CapK related-protein  32.19 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.973847  normal  0.145617 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1971  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  28.57 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2316  coenzyme F390 synthetase-like protein  31.12 
 
 		 450 aa  187  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  30.95 
 
 		 464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  29.98 
 
 		 448 aa  180  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  29.72 
 
 		 450 aa  177  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  29.47 
 
 		 451 aa  172  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  30.29 
 
 		 469 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0449  putative capK protein  29.31 
 
 		 446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  28.3 
 
 		 457 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  27.27 
 
 		 453 aa  164  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0291  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  27.55 
 
 		 453 aa  161  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.326701  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0676  putative CapK protein  27.05 
 
 		 459 aa  160  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0499803  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3567  CapK related-protein  29.05 
 
 		 502 aa  160  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  28.8 
 
 		 426 aa  157  4e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1800  putative polysaccharide biosynthesis protein  25.79 
 
 		 448 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  28.92 
 
 		 437 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2647  coenzyme F390 synthetase-like  29.43 
 
 		 467 aa  152  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1950  capK related-protein  26.37 
 
 		 446 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0295  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  28.6 
 
 		 461 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619099  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13008  possible CapK protein  25.23 
 
 		 463 aa  135  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0922559  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1535  CapK protein, putative  27.54 
 
 		 461 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1793  putative CapK protein  26.71 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3332  coenzyme F390 synthetase-like  27.34 
 
 		 416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.422547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  27.75 
 
 		 458 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2526  Coenzyme F390 synthetase-like protein  25 
 
 		 437 aa  128  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142234 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2299  hypothetical protein  27.25 
 
 		 448 aa  124  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  27.79 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0582  hypothetical protein  27.21 
 
 		 479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.661178  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2007  CapK related-protein  25.33 
 
 		 487 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  25.66 
 
 		 432 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1943  hypothetical protein  23.83 
 
 		 460 aa  112  9e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0441  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.51 
 
 		 468 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356155  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1200  hypothetical protein  24.08 
 
 		 448 aa  110  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0277555  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0387  Coenzyme F390 synthetase-like protein  26.15 
 
 		 466 aa  110  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.602394  normal  0.432377 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  25.29 
 
 		 433 aa  108  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  27.74 
 
 		 443 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  25.67 
 
 		 434 aa  106  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  25 
 
 		 439 aa  106  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  25 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  25.87 
 
 		 436 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  26.13 
 
 		 432 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3795  CapK protein, putative  26.79 
 
 		 475 aa  104  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.217638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  27.64 
 
 		 432 aa  104  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  26.93 
 
 		 432 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4201  coenzyme F390 synthetase-like  29.3 
 
 		 457 aa  103  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  24.78 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  25.29 
 
 		 433 aa  102  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  25.28 
 
 		 439 aa  101  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  28.19 
 
 		 438 aa  101  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  24.59 
 
 		 436 aa  100  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  27.02 
 
 		 430 aa  100  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  26.93 
 
 		 433 aa  100  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1074  coenzyme F390 synthetase-like protein  32.41 
 
 		 461 aa  100  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.733782  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1615  Coenzyme F390 synthetase-like protein  28.17 
 
 		 461 aa  100  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  26.19 
 
 		 432 aa  99.8  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  25.71 
 
 		 413 aa  99.8  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  26.87 
 
 		 436 aa  99.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  24.59 
 
 		 435 aa  99.4  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  28.31 
 
 		 429 aa  99.4  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  25 
 
 		 415 aa  99.8  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  28.1 
 
 		 435 aa  98.6  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  25.3 
 
 		 433 aa  98.6  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0472  putative capK protein  22.4 
 
 		 459 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000021402  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  26.78 
 
 		 445 aa  98.2  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2429  capK domain protein  25.92 
 
 		 476 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00799946  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  26.65 
 
 		 442 aa  97.8  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  28.48 
 
 		 433 aa  97.4  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  26.86 
 
 		 432 aa  97.1  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  28.92 
 
 		 432 aa  96.7  8e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  28.19 
 
 		 446 aa  96.7  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  26.78 
 
 		 432 aa  95.9  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  26.14 
 
 		 428 aa  96.3  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00696  hypothetical protein  25.29 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  25.59 
 
 		 434 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2883  phenylacetate-CoA ligase  27.08 
 
 		 427 aa  95.9  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3545  coenzyme F390 synthetase-like  27.25 
 
 		 524 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  24.77 
 
 		 433 aa  94.4  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2322  Phenylacetate--CoA ligase  27.33 
 
 		 449 aa  94  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.53 
 
 		 436 aa  93.6  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  25.85 
 
 		 438 aa  93.6  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2897  Phenylacetate--CoA ligase  25.93 
 
 		 428 aa  93.2  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4305  CapK domain-containing protein  25.8 
 
 		 481 aa  93.2  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  24.53 
 
 		 433 aa  93.2  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  25.38 
 
 		 434 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  23.58 
 
 		 434 aa  92.4  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1029  Phenylacetate--CoA ligase  27.07 
 
 		 429 aa  92.4  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  24.75 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  25.06 
 
 		 433 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  26.89 
 
 		 433 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  25.12 
 
 		 431 aa  91.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  27.38 
 
 		 444 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  25.66 
 
 		 414 aa  92  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>